31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2757 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  41.3 
 
 		 1148 aa  891    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  37.23 
 
 		 1153 aa  769    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  100 
 
 		 1145 aa  2358    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  59.69 
 
 		 1142 aa  1441    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  40.61 
 
 		 1157 aa  845    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  40.35 
 
 		 1157 aa  847    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  31.08 
 
 		 1166 aa  611  1e-173  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  24.37 
 
 		 1185 aa  121  7.999999999999999e-26  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  24.65 
 
 		 1168 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  22.32 
 
 		 1213 aa  112  5e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  23.66 
 
 		 1193 aa  105  4e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  22.15 
 
 		 1203 aa  105  5e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  24.82 
 
 		 1178 aa  99.8  3e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  26.28 
 
 		 1183 aa  99  5e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  22.1 
 
 		 1192 aa  97.4  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1203 aa  94.4  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  23.73 
 
 		 1202 aa  90.5  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1186 aa  86.7  0.000000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  24.32 
 
 		 1206 aa  84.3  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  25.6 
 
 		 1207 aa  83.6  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  24.92 
 
 		 1207 aa  83.2  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  23.98 
 
 		 1208 aa  84  0.00000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  22.35 
 
 		 1180 aa  82  0.00000000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  23.13 
 
 		 1199 aa  72  0.00000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  21.85 
 
 		 1201 aa  69.7  0.0000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1177 aa  68.6  0.0000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  22.61 
 
 		 1228 aa  65.5  0.000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  21.56 
 
 		 1236 aa  63.9  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  20.71 
 
 		 1214 aa  62.8  0.00000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  21.26 
 
 		 1239 aa  61.6  0.00000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  22.05 
 
 		 1211 aa  54.7  0.000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>