34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2108 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  100 
 
 		 1214 aa  2467    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  35.68 
 
 		 1177 aa  668    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  27.02 
 
 		 1228 aa  269  2.9999999999999995e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  25.65 
 
 		 1208 aa  230  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1207 aa  228  6e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  25.19 
 
 		 1207 aa  221  5e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  25.84 
 
 		 1206 aa  213  2e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  26.12 
 
 		 1178 aa  206  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  26.96 
 
 		 1183 aa  200  2.0000000000000003e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  23.73 
 
 		 1185 aa  199  3e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  24.82 
 
 		 1202 aa  196  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  24.39 
 
 		 1203 aa  194  6e-48  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  26.07 
 
 		 1213 aa  191  8e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  25.44 
 
 		 1193 aa  190  2e-46  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  27.04 
 
 		 1203 aa  183  2e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  23.85 
 
 		 1201 aa  182  4.999999999999999e-44  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  23 
 
 		 1192 aa  176  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  25.13 
 
 		 1168 aa  167  1.0000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  26.93 
 
 		 1180 aa  166  3e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1186 aa  134  2.0000000000000002e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  25.3 
 
 		 1211 aa  128  5e-28  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  24.34 
 
 		 1199 aa  124  9.999999999999999e-27  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  22.96 
 
 		 1157 aa  93.6  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  22.5 
 
 		 1148 aa  85.1  0.000000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  22.42 
 
 		 1157 aa  84  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  23 
 
 		 1142 aa  72.8  0.00000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  24.43 
 
 		 1236 aa  68.2  0.0000000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1911  hypothetical protein  22.81 
 
 		 1280 aa  67  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281193  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1166 aa  62.8  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  20.09 
 
 		 1145 aa  62  0.00000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  22.25 
 
 		 1153 aa  59.7  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1239 aa  56.6  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1203  hypothetical protein  24.72 
 
 		 1192 aa  52  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694076  hitchhiker  0.00012393 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0638  hypothetical protein  22.64 
 
 		 1203 aa  46.2  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000981876  normal  0.418476 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>