31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_2037 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  100 
 
 
1211 aa  2463    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  42.31 
 
 
1199 aa  957    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  26.3 
 
 
1178 aa  151  9e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  22.95 
 
 
1228 aa  148  8.000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  23.52 
 
 
1177 aa  142  3.9999999999999997e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  23.2 
 
 
1193 aa  142  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  22.93 
 
 
1180 aa  139  5e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  24.2 
 
 
1203 aa  138  6.0000000000000005e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  23.96 
 
 
1192 aa  137  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  23.21 
 
 
1185 aa  137  9.999999999999999e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  25.67 
 
 
1183 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  26.28 
 
 
1202 aa  134  1.0000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  24.94 
 
 
1201 aa  130  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  22.29 
 
 
1203 aa  129  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  25.3 
 
 
1214 aa  128  6e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  24.26 
 
 
1168 aa  125  6e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  24.64 
 
 
1213 aa  117  1.0000000000000001e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  28.2 
 
 
1186 aa  112  6e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  23.41 
 
 
1206 aa  93.6  2e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  23.32 
 
 
1207 aa  80.9  0.0000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  23.06 
 
 
1207 aa  79.7  0.0000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  24.18 
 
 
1208 aa  79.3  0.0000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  23.74 
 
 
1157 aa  72.4  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  23.77 
 
 
1157 aa  70.1  0.0000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  23.44 
 
 
1153 aa  67.4  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  21.93 
 
 
1148 aa  58.2  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  22.05 
 
 
1145 aa  55.1  0.000008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  19.9 
 
 
1142 aa  54.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  21.8 
 
 
1166 aa  53.1  0.00003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  22.78 
 
 
1236 aa  52.4  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  24.35 
 
 
1239 aa  49.3  0.0005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>