30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DhcVS_261 on replicon NC_013552
Organism: Dehalococcoides sp. VS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  100 
 
 		 1228 aa  2468    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  25.75 
 
 		 1177 aa  297  8e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  26.86 
 
 		 1214 aa  276  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  27.45 
 
 		 1207 aa  209  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  27.35 
 
 		 1207 aa  207  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  26.37 
 
 		 1206 aa  198  6e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  25.63 
 
 		 1203 aa  172  3e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  23.8 
 
 		 1193 aa  171  8e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  22.34 
 
 		 1168 aa  164  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1186 aa  162  4e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  24.86 
 
 		 1201 aa  162  5e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1185 aa  161  9e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  24.77 
 
 		 1180 aa  157  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  25.99 
 
 		 1208 aa  154  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  22.83 
 
 		 1211 aa  150  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  25.21 
 
 		 1183 aa  145  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  20.92 
 
 		 1192 aa  140  1e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  24.47 
 
 		 1203 aa  140  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  25.61 
 
 		 1202 aa  138  8e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  23.3 
 
 		 1178 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  22.47 
 
 		 1213 aa  129  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  26.84 
 
 		 1199 aa  128  6e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1236 aa  94.7  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  21.57 
 
 		 1153 aa  83.2  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  24.29 
 
 		 1239 aa  79.7  0.0000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1157 aa  72.8  0.00000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  22.73 
 
 		 1157 aa  68.6  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  23.78 
 
 		 1166 aa  67.8  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  20.64 
 
 		 1142 aa  66.6  0.000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  21.81 
 
 		 1145 aa  65.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>