33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2210 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  100 
 
 
1168 aa  2409    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  57.59 
 
 
1203 aa  1398    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  53.5 
 
 
1201 aa  1243    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  56.99 
 
 
1193 aa  1373    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  32.65 
 
 
1180 aa  596  1e-168  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  32.82 
 
 
1213 aa  496  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  30.04 
 
 
1185 aa  494  9.999999999999999e-139  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  28.58 
 
 
1203 aa  490  1e-137  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  28.86 
 
 
1202 aa  488  1e-136  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  31.78 
 
 
1192 aa  465  1e-129  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  29.48 
 
 
1178 aa  429  1e-118  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  28.32 
 
 
1183 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  24.62 
 
 
1186 aa  241  6.999999999999999e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  25.34 
 
 
1177 aa  189  3e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  25.13 
 
 
1214 aa  175  5.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  22.34 
 
 
1228 aa  168  5.9999999999999996e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  24.26 
 
 
1211 aa  134  9e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  24.3 
 
 
1142 aa  132  3e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  22.04 
 
 
1153 aa  123  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  24.65 
 
 
1145 aa  122  4.9999999999999996e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  22.48 
 
 
1206 aa  119  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  19.35 
 
 
1207 aa  110  2e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  19.25 
 
 
1207 aa  109  4e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  23.46 
 
 
1208 aa  105  4e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  21.66 
 
 
1239 aa  102  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  22.98 
 
 
1199 aa  102  5e-20  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  22.67 
 
 
1157 aa  97.4  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  22.09 
 
 
1157 aa  95.1  6e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  21.8 
 
 
1236 aa  95.1  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  23.55 
 
 
1166 aa  90.5  2e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  20.59 
 
 
1148 aa  77  0.000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1911  hypothetical protein  22.22 
 
 
1280 aa  59.7  0.0000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3194  hypothetical protein  20 
 
 
1270 aa  59.3  0.0000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>