22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1911 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1911  hypothetical protein  100 
 
 
1280 aa  2561    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3194  hypothetical protein  53.16 
 
 
1270 aa  1288    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1914  hypothetical protein  70.91 
 
 
125 aa  153  2e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  24.41 
 
 
1193 aa  77.8  0.000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  24.63 
 
 
1236 aa  73.6  0.00000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  22.79 
 
 
1203 aa  70.1  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  21.51 
 
 
1178 aa  68.2  0.000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  22.81 
 
 
1214 aa  67  0.000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  22.49 
 
 
1192 aa  63.9  0.00000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  23.23 
 
 
1177 aa  63.9  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  23.99 
 
 
1185 aa  59.7  0.0000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  26.18 
 
 
1206 aa  58.2  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  23.16 
 
 
1186 aa  54.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  22.26 
 
 
1239 aa  53.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  23.87 
 
 
1207 aa  52.8  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  22.96 
 
 
1203 aa  51.6  0.0001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  27.41 
 
 
1207 aa  50.8  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  22.94 
 
 
1180 aa  50.4  0.0002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  21.92 
 
 
1202 aa  48.5  0.0007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  20.19 
 
 
1183 aa  48.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  21.35 
 
 
1153 aa  47.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  21.45 
 
 
1199 aa  47.4  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>