34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4844 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  100 
 
 		 1186 aa  2433    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2289  ATPase-like protein  26.89 
 
 		 1192 aa  266  2e-69  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  25.55 
 
 		 1185 aa  264  6e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1680  hypothetical protein  25.35 
 
 		 1203 aa  244  5e-63  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000160907 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  23.11 
 
 		 1183 aa  240  1e-61  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0557  hypothetical protein  25.02 
 
 		 1193 aa  237  9e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  29.43 
 
 		 1203 aa  236  2.0000000000000002e-60  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1894  hypothetical protein  24.35 
 
 		 1178 aa  232  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0208797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2210  hypothetical protein  24.62 
 
 		 1168 aa  231  7e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.802914  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  28.22 
 
 		 1202 aa  220  1e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02960  hypothetical protein  25.24 
 
 		 1180 aa  214  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1609  hypothetical protein  24.31 
 
 		 1201 aa  201  1.0000000000000001e-49  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.838427  normal  0.0465574 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0338  hypothetical protein  27.61 
 
 		 1213 aa  194  7e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0121838  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_261  hypothetical protein  25.93 
 
 		 1228 aa  162  4e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  24.52 
 
 		 1214 aa  134  1.0000000000000001e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1123  hypothetical protein  25.42 
 
 		 1177 aa  131  9.000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.928627  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1155  hypothetical protein  25.22 
 
 		 1206 aa  127  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2037  hypothetical protein  28.2 
 
 		 1211 aa  112  5e-23  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0990  hypothetical protein  26.7 
 
 		 1199 aa  108  5e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3081  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1208 aa  103  1e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  23.39 
 
 		 1142 aa  98.2  8e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1234  hypothetical protein  21.59 
 
 		 1207 aa  91.3  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0600  hypothetical protein  21.86 
 
 		 1207 aa  90.1  2e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3234  hypothetical protein  22.26 
 
 		 1153 aa  88.6  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.540167  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2757  hypothetical protein  23.86 
 
 		 1145 aa  86.7  0.000000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.636677  hitchhiker  0.0057166 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1083  hypothetical protein  22.98 
 
 		 1166 aa  84.7  0.000000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.679898  normal  0.445705 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1818  hypothetical protein  22.56 
 
 		 1157 aa  79  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0281308 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2242  hypothetical protein  22.53 
 
 		 1148 aa  78.6  0.0000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.297499 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1909  hypothetical protein  25.34 
 
 		 1236 aa  77.4  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.6802  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1708  hypothetical protein  22.57 
 
 		 1157 aa  77  0.000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0961451 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3196  hypothetical protein  25.89 
 
 		 1239 aa  67.4  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1203  hypothetical protein  21.83 
 
 		 1192 aa  62.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694076  hitchhiker  0.00012393 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1911  hypothetical protein  23.16 
 
 		 1280 aa  54.3  0.00001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.281193  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3194  hypothetical protein  21.73 
 
 		 1270 aa  53.1  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>