15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_1203 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_1203  hypothetical protein  100 
 
 
1192 aa  2399    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694076  hitchhiker  0.00012393 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0115  hypothetical protein  24.02 
 
 
1227 aa  219  2e-55  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4280  putative phage resistance protein  26.2 
 
 
1240 aa  188  7e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0709  bacteriophage resistance gene pglY  25.83 
 
 
1261 aa  183  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.907183  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1546  phage resistance protein  25.19 
 
 
1238 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3202  putative phage resistance protein  26.03 
 
 
1230 aa  177  8e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.571473  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05220  hypothetical protein  25.11 
 
 
1285 aa  170  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2954  bacteriophage resistance gene PglY  23.62 
 
 
1227 aa  157  1e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.231929 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4844  hypothetical protein  21.83 
 
 
1186 aa  62.8  0.00000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000657531  normal  0.281651 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2494  hypothetical protein  23.38 
 
 
1185 aa  55.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0292  ATPase-like protein  22.86 
 
 
1203 aa  55.1  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1327  hypothetical protein  41.18 
 
 
1142 aa  54.7  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.372438  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1298  hypothetical protein  24.48 
 
 
1183 aa  53.9  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.994763  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2108  hypothetical protein  24.72 
 
 
1214 aa  52  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5024  ATPase-like protein  22.33 
 
 
1202 aa  45.4  0.006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>