More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1906 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009511  Swit_1906  short chain enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.34521  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5100  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.75 
 
 
256 aa  185  6e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2001  short chain enoyl-CoA hydratase  38.46 
 
 
259 aa  169  4e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4560  short chain enoyl-CoA hydratase  39.77 
 
 
256 aa  159  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.127005  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2856  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.74 
 
 
260 aa  158  7e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1794  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.69 
 
 
270 aa  157  1e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.836656 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2195  short chain enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
257 aa  158  1e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000647858  hitchhiker  0.00875803 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2272  enoyl-CoA hydratase  37.79 
 
 
269 aa  157  2e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.72 
 
 
273 aa  154  1e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2287  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  37.21 
 
 
260 aa  154  1e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.867439  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2585  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.82 
 
 
260 aa  153  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.22 
 
 
271 aa  151  8.999999999999999e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.83 
 
 
265 aa  149  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0267  short chain enoyl-CoA hydratase  37.07 
 
 
257 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0796269  normal 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5310  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.77 
 
 
269 aa  148  8e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.181246 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1877  short chain enoyl-CoA hydratase  35.71 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0147635  normal  0.173046 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.98 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1808  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.1 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.48 
 
 
271 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2603  short chain enoyl-CoA hydratase  40.38 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.167852  normal  0.240881 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.22 
 
 
271 aa  145  5e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1781  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
260 aa  145  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.655694  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0855  short chain enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 
263 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248089  normal  0.692759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2724  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.74 
 
 
249 aa  144  1e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.891783  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2117  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
261 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.409112 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6299  short chain enoyl-CoA hydratase  40.39 
 
 
266 aa  143  2e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1815  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.18 
 
 
268 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0429  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
262 aa  142  4e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.297367 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4588  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 
268 aa  142  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.61629  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0401  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.64 
 
 
260 aa  142  7e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3219  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
255 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0206173  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3208  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
255 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.5239  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3270  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.35 
 
 
255 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.868271  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6908  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.52 
 
 
264 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0177  enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.11 
 
 
274 aa  139  4.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  34.47 
 
 
269 aa  139  6e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0434  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.35 
 
 
266 aa  138  7e-32  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1202  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.64 
 
 
261 aa  138  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.255383  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4079  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
249 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4309  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
249 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.184062  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8753  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.62 
 
 
273 aa  137  1e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0594436 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4155  short chain enoyl-CoA hydratase  37.5 
 
 
249 aa  138  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04650  enoyl-CoA hydratase/carnithine racemase  37.4 
 
 
278 aa  137  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3041  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0775149  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1380  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.23 
 
 
260 aa  137  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.871476 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2071  short chain enoyl-CoA hydratase  35.57 
 
 
260 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000637715  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2054  short chain enoyl-CoA hydratase  33.46 
 
 
264 aa  136  3.0000000000000003e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216786  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1048  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.77 
 
 
265 aa  136  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0748381  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2864  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
258 aa  136  4e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.45 
 
 
261 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1765  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
270 aa  135  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.578699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2009  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.59 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.499146  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0344  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.9 
 
 
252 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2905  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
260 aa  135  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1746  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.27 
 
 
270 aa  135  9e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.82012  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0321  3-hydroxyacyl-CoA dehydrogenase NAD-binding protein  35.18 
 
 
663 aa  134  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.468082  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1604  enoyl-CoA hydratase  35.11 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.284722  normal  0.630859 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3010  enoyl-CoA hydratase  36.26 
 
 
258 aa  134  9.999999999999999e-31  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000686819  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0873  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.15 
 
 
267 aa  134  9.999999999999999e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.62 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1984  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.61 
 
 
270 aa  134  9.999999999999999e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.928303  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2252  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.68 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.832894  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  33.46 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4596  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.5 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.115827  normal  0.9625 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2902  enoyl-CoA hydratase  40.54 
 
 
263 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00341422  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1480  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.68 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  34.33 
 
 
266 aa  134  1.9999999999999998e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2833  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.511976  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0423  short chain enoyl-CoA hydratase  36.23 
 
 
259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.04 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1671  enoyl-CoA hydratase  35.69 
 
 
265 aa  133  3e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0787983  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2094  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
258 aa  133  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2032  short chain enoyl-CoA hydratase  34.65 
 
 
257 aa  133  3e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4360  enoyl-CoA hydratase/isomerase  34.89 
 
 
271 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.884728  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2262  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.68 
 
 
255 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.364403  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1213  short chain enoyl-CoA hydratase  36.88 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.847527  normal  0.487906 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3779  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.5 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.834377  normal  0.388082 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1968  short chain enoyl-CoA hydratase  37.27 
 
 
266 aa  132  3.9999999999999996e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0090  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  32.05 
 
 
258 aa  132  3.9999999999999996e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2031  3-hydroxybutyryl-CoA dehydratase  36.43 
 
 
260 aa  132  3.9999999999999996e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0110  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.96 
 
 
263 aa  132  5e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.549312  normal  0.683018 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3162  enoyl-CoA hydratase  35.88 
 
 
258 aa  132  5e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.0000276465  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3528  enoyl-CoA hydratase  34.62 
 
 
261 aa  132  5e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5256  enoyl-CoA hydratase  37.87 
 
 
267 aa  132  6e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22791  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1578  enoyl-CoA hydratase-isomerase  34.68 
 
 
255 aa  132  6.999999999999999e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2749  short chain enoyl-CoA hydratase  32.81 
 
 
262 aa  132  6.999999999999999e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.439722  normal  0.238533 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1772  enoyl-CoA hydratase/isomerase  31.54 
 
 
268 aa  132  7.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0766393  normal  0.0633742 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2368  short chain enoyl-CoA hydratase  38.98 
 
 
258 aa  132  7.999999999999999e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  37.12 
 
 
265 aa  131  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1854  short chain enoyl-CoA hydratase  36.47 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.850958  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3370  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.43 
 
 
258 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4513  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.36 
 
 
258 aa  130  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0541  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0765049  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0636  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0710524  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3575  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.615843  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10710  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.31 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1903  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0497842  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3548  enoyl-CoA hydratase  40.3 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.067753  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>