More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1991 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1991  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 
581 aa  1132    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366997  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1431  hydrogenase 4 subunit B  40.85 
 
 
570 aa  383  1e-105  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.832858 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0773  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.51 
 
 
595 aa  188  3e-46  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00397311  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  27.76 
 
 
662 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  25.89 
 
 
649 aa  127  4.0000000000000003e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  25.88 
 
 
637 aa  127  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  24.04 
 
 
683 aa  122  1.9999999999999998e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  25.72 
 
 
748 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  24.57 
 
 
650 aa  112  1.0000000000000001e-23  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  24.62 
 
 
644 aa  112  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.42 
 
 
661 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  30.5 
 
 
672 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  30.5 
 
 
672 aa  109  1e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  30.5 
 
 
672 aa  109  1e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  30.14 
 
 
672 aa  108  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  25.17 
 
 
674 aa  107  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  30.14 
 
 
672 aa  107  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  29.79 
 
 
672 aa  107  7e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  24.74 
 
 
673 aa  105  2e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  23.97 
 
 
655 aa  105  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  25.23 
 
 
577 aa  105  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.42 
 
 
646 aa  104  3e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  22.91 
 
 
644 aa  104  5e-21  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  23.56 
 
 
655 aa  103  6e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  21.62 
 
 
643 aa  103  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  25.63 
 
 
633 aa  102  2e-20  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  23.39 
 
 
669 aa  102  3e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  27.46 
 
 
674 aa  99.8  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  26.96 
 
 
654 aa  99.8  1e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  25.9 
 
 
737 aa  99.4  2e-19  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  25.24 
 
 
617 aa  99  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  24.14 
 
 
672 aa  99.4  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  26.26 
 
 
723 aa  98.2  3e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.64 
 
 
688 aa  98.2  4e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  29.18 
 
 
664 aa  97.1  7e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  24.1 
 
 
674 aa  97.1  9e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  23.99 
 
 
669 aa  96.3  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  22.52 
 
 
668 aa  95.5  2e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  22.95 
 
 
669 aa  95.5  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  26.86 
 
 
646 aa  93.2  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  21.52 
 
 
640 aa  92.8  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  29.24 
 
 
669 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  23.36 
 
 
669 aa  92  3e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  24.91 
 
 
654 aa  91.3  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  27.72 
 
 
671 aa  90.9  6e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  26.44 
 
 
669 aa  90.9  6e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.01 
 
 
666 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  22.13 
 
 
662 aa  89.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  27.38 
 
 
679 aa  90.1  1e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  27.38 
 
 
673 aa  88.6  3e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  22.91 
 
 
681 aa  87.8  5e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  27.67 
 
 
666 aa  87.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  26.17 
 
 
666 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  23.49 
 
 
668 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  27.16 
 
 
671 aa  85.5  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  22.16 
 
 
666 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.4 
 
 
669 aa  84.3  0.000000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  25.5 
 
 
666 aa  84  0.000000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  26.59 
 
 
667 aa  84  0.000000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1023  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.46 
 
 
555 aa  84  0.000000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.057602  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  21.92 
 
 
687 aa  83.6  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  22.48 
 
 
672 aa  82.4  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0107  NADH dehydrogenase (quinone)  26.97 
 
 
500 aa  82.4  0.00000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000249004 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  26.46 
 
 
661 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  23.01 
 
 
633 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  23.01 
 
 
633 aa  82  0.00000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  23.28 
 
 
674 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  26.24 
 
 
672 aa  80.9  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  27.27 
 
 
559 aa  80.9  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.69 
 
 
662 aa  79.7  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1788  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  23.85 
 
 
670 aa  79  0.0000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  25.17 
 
 
654 aa  79.3  0.0000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  26.72 
 
 
613 aa  79.3  0.0000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.82 
 
 
659 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  25.17 
 
 
665 aa  78.2  0.0000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0726  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  21.57 
 
 
684 aa  78.2  0.0000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0242608  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  26.77 
 
 
665 aa  78.2  0.0000000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  25.17 
 
 
654 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  27.36 
 
 
460 aa  75.9  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  29.61 
 
 
493 aa  75.5  0.000000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1598  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.56 
 
 
545 aa  75.9  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  24.42 
 
 
517 aa  74.7  0.000000000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  26.69 
 
 
682 aa  74.3  0.000000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0184  NADH dehydrogenase (quinone)  28.62 
 
 
487 aa  74.3  0.000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1116  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  25.75 
 
 
493 aa  73.9  0.000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0851  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.79 
 
 
545 aa  73.9  0.000000000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.157945  normal  0.412273 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  28.38 
 
 
660 aa  73.6  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  28.38 
 
 
660 aa  73.6  0.000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0853  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.17 
 
 
545 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1864  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  26.74 
 
 
544 aa  73.6  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.142353  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  27.87 
 
 
663 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0643  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  27.34 
 
 
544 aa  73.2  0.00000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.552071  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.11 
 
 
660 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  31.33 
 
 
499 aa  73.2  0.00000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0970  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  25.97 
 
 
545 aa  72.8  0.00000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0163848  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.05 
 
 
659 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2210  NADH dehydrogenase (quinone)  27.61 
 
 
1047 aa  72.8  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.129844 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1581  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.77 
 
 
563 aa  72  0.00000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1819  hydrogenase membrane subunit  33.54 
 
 
489 aa  71.6  0.00000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00530932  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.6 
 
 
674 aa  71.2  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>