More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1431 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009440  Msed_1431  hydrogenase 4 subunit B  100 
 
 
570 aa  1116    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.832858 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1991  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  40.79 
 
 
581 aa  385  1e-105  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.366997  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0773  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.13 
 
 
595 aa  210  6e-53  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00397311  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  25.82 
 
 
655 aa  122  1.9999999999999998e-26  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  24.39 
 
 
637 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  25.5 
 
 
655 aa  108  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  25.79 
 
 
662 aa  101  5e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  26.12 
 
 
673 aa  97.8  4e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  27.49 
 
 
577 aa  95.1  3e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  24.77 
 
 
649 aa  93.6  9e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  29.71 
 
 
674 aa  92  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  32.53 
 
 
661 aa  91.7  4e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  29.53 
 
 
646 aa  90.9  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  32.37 
 
 
669 aa  90.5  7e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  24.44 
 
 
633 aa  89.7  1e-16  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  28.57 
 
 
737 aa  87.8  4e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  30.03 
 
 
654 aa  87  9e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  30.03 
 
 
669 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  29.84 
 
 
669 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  27.58 
 
 
640 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.22 
 
 
646 aa  85.5  0.000000000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  29.84 
 
 
643 aa  84.3  0.000000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  30.36 
 
 
668 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0918  NADH dehydrogenase (quinone)  29.19 
 
 
559 aa  82.8  0.00000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  31.5 
 
 
617 aa  82  0.00000000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  28.19 
 
 
650 aa  81.6  0.00000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  25.51 
 
 
672 aa  81.6  0.00000000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.08 
 
 
661 aa  81.6  0.00000000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  27.49 
 
 
672 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  27.49 
 
 
672 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  27.49 
 
 
672 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  27.49 
 
 
672 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  27.19 
 
 
672 aa  80.9  0.00000000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  28.3 
 
 
644 aa  80.9  0.00000000000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.33 
 
 
688 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  32.03 
 
 
654 aa  80.5  0.00000000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  27.19 
 
 
672 aa  80.1  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  29.06 
 
 
669 aa  80.1  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  23.81 
 
 
683 aa  80.1  0.0000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  27.63 
 
 
662 aa  79.3  0.0000000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  30.17 
 
 
654 aa  79  0.0000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  26.71 
 
 
748 aa  78.2  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0681  NADH dehydrogenase (quinone)  31.16 
 
 
584 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.389184 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  28.94 
 
 
674 aa  78.2  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  31.32 
 
 
654 aa  77.8  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  32.91 
 
 
664 aa  77.8  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  25.21 
 
 
723 aa  77  0.0000000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2210  NADH dehydrogenase (quinone)  28.28 
 
 
1047 aa  77  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.129844 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1124  hydrogenase membrane subunit  33.82 
 
 
494 aa  76.6  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.113605  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1741  NADH dehydrogenase subunit M  29.04 
 
 
604 aa  76.3  0.000000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.56797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  29.69 
 
 
674 aa  76.3  0.000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  31.14 
 
 
666 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  31.14 
 
 
666 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  25.75 
 
 
671 aa  75.1  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.49 
 
 
666 aa  75.1  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1788  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.47 
 
 
670 aa  75.1  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1581  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.01 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  30.29 
 
 
644 aa  75.1  0.000000000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.78 
 
 
666 aa  74.7  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  30.51 
 
 
666 aa  74.3  0.000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  27.48 
 
 
679 aa  74.3  0.000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0284  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  29.1 
 
 
517 aa  74.3  0.000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    decreased coverage  0.0000000106102 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  28.97 
 
 
671 aa  73.9  0.000000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.25 
 
 
669 aa  73.2  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1318  hydrogenase membrane subunit  30.87 
 
 
493 aa  72  0.00000000002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  27.17 
 
 
669 aa  72.8  0.00000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12050  NADH dehydrogenase I subunit M  32.05 
 
 
506 aa  72  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0114969  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  26.48 
 
 
672 aa  71.2  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0379  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.38 
 
 
605 aa  70.9  0.00000000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  0.00000000000619684  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1572  hydrogenase membrane subunit  31.37 
 
 
460 aa  70.5  0.00000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  25.5 
 
 
687 aa  70.5  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.5 
 
 
662 aa  70.1  0.00000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4787  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  28.57 
 
 
475 aa  69.7  0.0000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  30.45 
 
 
665 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  27 
 
 
673 aa  69.7  0.0000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1450  hydrogenase subunit, NADH dehydrogenase subunit N-like protein  31.7 
 
 
499 aa  69.7  0.0000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  30.27 
 
 
668 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  30.27 
 
 
668 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.51 
 
 
659 aa  69.3  0.0000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0726  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.6 
 
 
684 aa  68.9  0.0000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0242608  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0608  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.62 
 
 
658 aa  68.6  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3059  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_05170  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  26.21 
 
 
521 aa  68.6  0.0000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2663  NADH dehydrogenase (quinone)  30.38 
 
 
479 aa  68.2  0.0000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.07 
 
 
659 aa  68.2  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1082  NADH dehydrogenase (quinone)  24.36 
 
 
624 aa  68.2  0.0000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.047689  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0890  NADH dehydrogenase subunit M  28.78 
 
 
613 aa  67.4  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.514114  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  28.33 
 
 
669 aa  67  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2620  hydrogenase 4 subunit F  31.17 
 
 
526 aa  67  0.0000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1190  hydrogenase 4 subunit F  31.17 
 
 
526 aa  67  0.0000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.647759 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2871  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  29.55 
 
 
537 aa  67  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0408599 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02378  NADH dehydrogenase subunit N  31.17 
 
 
526 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1183  NADH dehydrogenase (quinone)  31.17 
 
 
526 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  31.82 
 
 
668 aa  66.2  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2633  hydrogenase 4 subunit F  31.17 
 
 
526 aa  66.2  0.000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3948  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.19 
 
 
545 aa  66.6  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.147624 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0315  NADH dehydrogenase (quinone)  26.25 
 
 
674 aa  66.2  0.000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.39787  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02340  hypothetical protein  31.17 
 
 
526 aa  66.6  0.000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2858  hydrogenase 4 subunit F  31.17 
 
 
517 aa  65.9  0.000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  27.22 
 
 
672 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3534  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  26.84 
 
 
532 aa  65.9  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.123849  normal  0.336988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>