More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0726 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0726  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  100 
 
 		 684 aa  1294    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0242608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2460  NADH dehydrogenase (quinone)  29.77 
 
 		 683 aa  223  7e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3292  hydrogenase 4 subunit B  30.18 
 
 		 674 aa  195  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0179  hydrogenase 4 subunit B  30.77 
 
 		 669 aa  188  3e-46  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.987712  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6065  hydrogenase 4 subunit B  31.55 
 
 		 669 aa  187  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.388772  hitchhiker  0.000500664 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4671  hydrogenase 4 subunit B  31.73 
 
 		 674 aa  185  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0132  hydrogenase 4 membrane subunit  24.01 
 
 		 650 aa  182  2e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.167866  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1142  hydrogenase 4 subunit B  30.28 
 
 		 748 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.239539  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1194  hydrogenase 4 subunit B  26.77 
 
 		 672 aa  180  7e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02374  NADH dehydrogenase subunit N  26.6 
 
 		 672 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02336  hypothetical protein  26.6 
 
 		 672 aa  179  1e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0916  hydrogenase 4 subunit B  30.43 
 
 		 674 aa  179  1e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0329  hydrogenase 4 subunit B  29.98 
 
 		 669 aa  179  1e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3704  hydrogenase 4 subunit B  26.72 
 
 		 672 aa  179  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.726938  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1187  NADH dehydrogenase (quinone)  26.55 
 
 		 672 aa  178  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1617  hydrogenase 4 subunit B  30.13 
 
 		 668 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1532  hydrogenase 4 subunit B  30.13 
 
 		 668 aa  175  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0929  hydrogenase 4 subunit B  30.9 
 
 		 687 aa  174  6.999999999999999e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1261  hydrogenase 4 subunit B  29.65 
 
 		 668 aa  173  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0734  NAD-dependent dehydrogenase subunit  32.83 
 
 		 668 aa  172  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0393018  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2629  hydrogenase 4 subunit B  26.38 
 
 		 672 aa  171  4e-41  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1791  ATP-binding protein  27.05 
 
 		 655 aa  169  1e-40  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0608774  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4066  NADH dehydrogenase (quinone)  26.23 
 
 		 669 aa  169  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0619804  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2191  hydrogenase 4 subunit B  29.6 
 
 		 673 aa  170  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.660892 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0070  NADH dehydrogenase (quinone)  28.92 
 
 		 667 aa  169  1e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2558  NADH dehydrogenase (quinone)  28.94 
 
 		 666 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0166  hydrogenase 4 subunit B  30.67 
 
 		 681 aa  166  2.0000000000000002e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3781  NADH dehydrogenase (quinone)  34.68 
 
 		 654 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0217094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3655  NADH dehydrogenase (quinone)  34.02 
 
 		 654 aa  163  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0270969  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2474  hydrogenase 4 subunit B  29.8 
 
 		 669 aa  163  9e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4575  hydrogenase 4 subunit B  28.06 
 
 		 671 aa  163  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1691  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  24.82 
 
 		 688 aa  161  4e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.0000143823  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1807  hydrogenase 4 subunit B  31.91 
 
 		 660 aa  161  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.370569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2149  hydrogenase 4 subunit B  31.91 
 
 		 660 aa  161  5e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.33721  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1285  hydrogenase 4 subunit B  31.06 
 
 		 673 aa  159  1e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.488809  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0892  NADH dehydrogenase (quinone)  26.4 
 
 		 669 aa  159  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3855  hydrogenase 4 subunit B  30.02 
 
 		 672 aa  159  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1127  hydrogenase membrane subunit  28.07 
 
 		 649 aa  159  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0224903  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0739  NAD-dependent dehydrogenase subunit  29.4 
 
 		 661 aa  158  3e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.188084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2708  hydrogenase 4 subunit B  30.56 
 
 		 679 aa  156  1e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1260  hydrogenase 4 subunit B  31.33 
 
 		 672 aa  156  1e-36  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0751084 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3197  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.84 
 
 		 666 aa  155  2e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00940  formate hydrogenlyase subunit 3/multisubunit Na+/H+ antiporter, MnhD subunit  27.5 
 
 		 672 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4288  NADH dehydrogenase (quinone)  26.89 
 
 		 637 aa  155  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000277072  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1914  L-alanyl-D-glutamate peptidase  25.42 
 
 		 655 aa  154  4e-36  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2601  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.8 
 
 		 660 aa  154  5e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10084  oxidoreductase  36.45 
 
 		 640 aa  153  8e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00281156  normal  0.170471 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0375  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.46 
 
 		 669 aa  152  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.044448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1822  hydrogenase membrane subunit  29.04 
 
 		 643 aa  152  2e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0165692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3796  NADH dehydrogenase (quinone)  34.92 
 
 		 654 aa  151  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273036  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1065  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.53 
 
 		 666 aa  150  5e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.82932e-25 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0791  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  27.13 
 
 		 661 aa  150  8e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3713  NADH dehydrogenase (quinone)  35.2 
 
 		 654 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.117424  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4703  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  35.59 
 
 		 662 aa  147  5e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1069  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  33.01 
 
 		 659 aa  147  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.7000400000000002e-28 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2985  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  30.95 
 
 		 674 aa  147  7.0000000000000006e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0690807  hitchhiker  0.0074409 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1321  hydrogenase membrane subunit  25.53 
 
 		 644 aa  145  3e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0778  NADH dehydrogenase (quinone)  29.79 
 
 		 682 aa  145  3e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.590886  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0703  NADH dehydrogenase (quinone)  23.89 
 
 		 662 aa  143  8e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.20305  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2616  NADH dehydrogenase (quinone)  30.16 
 
 		 577 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2456  NADH dehydrogenase (quinone)  29.07 
 
 		 662 aa  143  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0192367  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1788  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.65 
 
 		 670 aa  142  1.9999999999999998e-32  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1453  hydrogenase subunit, HycC-like protein  24.07 
 
 		 644 aa  142  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3193  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  29.73 
 
 		 659 aa  142  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.141056  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3795  NADH dehydrogenase (quinone)  35.98 
 
 		 666 aa  140  6e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.789396  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1575  hydrogenase membrane subunit  25.96 
 
 		 617 aa  139  1e-31  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3712  NADH dehydrogenase (quinone)  35.38 
 
 		 666 aa  140  1e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.753561  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0773  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  28.89 
 
 		 595 aa  137  5e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00397311  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0188  NADH dehydrogenase (quinone)  31.32 
 
 		 737 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2560  NADH dehydrogenase (quinone)  32.17 
 
 		 663 aa  135  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1396  hydrogenase 4 subunit B  31.65 
 
 		 671 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2618  NADH dehydrogenase (quinone)  30.73 
 
 		 646 aa  133  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.430528  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3654  NADH dehydrogenase (quinone)  33.58 
 
 		 665 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3054  formate hydrogenlyase subunit 3  27.14 
 
 		 608 aa  131  5.0000000000000004e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.920212  normal  0.22505 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0966  NADH dehydrogenase (quinone)  26.24 
 
 		 608 aa  129  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0336  NADH dehydrogenase (quinone)  30.73 
 
 		 665 aa  129  2.0000000000000002e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4469  NADH dehydrogenase (quinone)  38.55 
 
 		 664 aa  129  2.0000000000000002e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3974  formate hydrogenlyase subunit 3  26.05 
 
 		 608 aa  128  3e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1862  NADH/Ubiquinone/plastoquinone (complex I)  25.78 
 
 		 646 aa  128  3e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.00000307213  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02573  NADH dehydrogenase subunit N  26.05 
 
 		 608 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.621394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3666  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.55 
 
 		 492 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.752681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2859  formate hydrogenlyase subunit 3  26.05 
 
 		 608 aa  128  4.0000000000000003e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2848  formate hydrogenlyase subunit 3  26.05 
 
 		 608 aa  127  5e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.264273 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3011  formate hydrogenlyase subunit 3  26.05 
 
 		 608 aa  127  6e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3196  formate hydrogenlyase subunit 3  28.08 
 
 		 608 aa  127  6e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1307  NADH dehydrogenase (quinone)  22.36 
 
 		 633 aa  127  7e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0989  formate hydrogenlyase subunit 3  26.05 
 
 		 608 aa  127  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.180245 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3003  formate hydrogenlyase subunit 3  27.14 
 
 		 608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00790766 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3284  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  30.75 
 
 		 492 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.141551  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3038  formate hydrogenlyase subunit 3  28.05 
 
 		 608 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000419635 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2972  formate hydrogenlyase subunit 3  27.14 
 
 		 608 aa  122  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0608  NADH/ubiquinone/plastoquinone (complex I)  31.53 
 
 		 658 aa  120  6e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.3059  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0943  NADH dehydrogenase (quinone)  26.85 
 
 		 723 aa  118  3e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.730208  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3161  formate hydrogenlyase subunit 3  26.71 
 
 		 608 aa  118  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.253093 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3953  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  29.39 
 
 		 492 aa  118  3e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2787  NADH dehydrogenase (quinone)  31.83 
 
 		 633 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2795  NADH dehydrogenase (quinone)  31.83 
 
 		 633 aa  116  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0135  putative monovalent cation/H+ antiporter subunit D  26.55 
 
 		 513 aa  110  9.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.501467  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3401  F420H2 dehydrogenase subunit N  27.4 
 
 		 481 aa  108  3e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.280357  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0753  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain N  31.35 
 
 		 511 aa  108  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.714815  normal  0.834911 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>