218 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4343 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009831  Ssed_4343  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
589 aa  1194    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3545  phospholipid/glycerol acyltransferase  59.82 
 
 
620 aa  628  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0175  phospholipid/glycerol acyltransferase  60.18 
 
 
620 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.292728 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4184  phospholipid/glycerol acyltransferase  60.18 
 
 
620 aa  625  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  60 
 
 
621 aa  623  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  60.18 
 
 
620 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0133  phospholipid/glycerol acyltransferase  61.65 
 
 
620 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.449425 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0171  phospholipid/glycerol acyltransferase  60 
 
 
620 aa  619  1e-176  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  59.82 
 
 
620 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0168  phospholipid/glycerol acyltransferase  59.63 
 
 
620 aa  617  1e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0187  acyltransferase family protein  60.37 
 
 
618 aa  615  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0194  acyltransferase family protein  60 
 
 
620 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05313  hypothetical protein  56.88 
 
 
618 aa  600  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000570  lysophospholipid transporter LplT/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase/acyl-[acyl-carrier-protein] synthetase  57.25 
 
 
617 aa  590  1e-167  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0122  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.06 
 
 
618 aa  565  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.430079  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0159  major facilitator transporter  62.02 
 
 
560 aa  537  1e-151  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4715  major facilitator transporter  58.7 
 
 
429 aa  455  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  46.2 
 
 
626 aa  427  1e-118  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  44.74 
 
 
624 aa  410  1e-113  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  42.94 
 
 
624 aa  406  1.0000000000000001e-112  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0169  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.01 
 
 
625 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.49 
 
 
626 aa  365  1e-100  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2856  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.55 
 
 
637 aa  363  6e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000113007  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1665  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.69 
 
 
624 aa  344  2e-93  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054165  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.58 
 
 
625 aa  342  1e-92  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.449657  decreased coverage  0.00341201 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1700  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.58 
 
 
661 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.58 
 
 
625 aa  342  2e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1854  hypothetical protein  41.26 
 
 
624 aa  341  2e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328604  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1690  major facilitator transporter  43.61 
 
 
446 aa  341  2e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.86317 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.68 
 
 
644 aa  339  7e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.68 
 
 
644 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21750  hypothetical protein  41.26 
 
 
624 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.783419 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.43 
 
 
644 aa  339  9.999999999999999e-92  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3899  acyltransferase family protein  39.96 
 
 
624 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.516687  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1511  major facilitator transporter  43.13 
 
 
446 aa  338  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1586  phospholipid/glycerol acyltransferase:phospholipid/glycerol acyltransferase  44 
 
 
624 aa  337  3.9999999999999995e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3147  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.09 
 
 
624 aa  335  1e-90  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733327  normal  0.020121 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.25 
 
 
644 aa  334  2e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  37.43 
 
 
644 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.25 
 
 
644 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.25 
 
 
644 aa  335  2e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  37.43 
 
 
604 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.75 
 
 
625 aa  335  2e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  37.43 
 
 
604 aa  335  2e-90  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  37.43 
 
 
644 aa  334  2e-90  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  38.07 
 
 
644 aa  335  2e-90  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  37.43 
 
 
644 aa  333  4e-90  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  36.88 
 
 
644 aa  333  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3020  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.93 
 
 
629 aa  328  2.0000000000000001e-88  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011576  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.46 
 
 
645 aa  322  8e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  37.2 
 
 
645 aa  321  3e-86  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  35.02 
 
 
645 aa  320  5e-86  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0457  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.54 
 
 
653 aa  319  7e-86  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409377  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.56 
 
 
635 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.72 
 
 
635 aa  318  2e-85  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3578  major facilitator superfamily MFS_1  47.03 
 
 
432 aa  316  7e-85  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0372089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0537  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.11 
 
 
654 aa  316  7e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0160332 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  38.68 
 
 
635 aa  314  1.9999999999999998e-84  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.38 
 
 
632 aa  315  1.9999999999999998e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1608  major facilitator transporter  43.72 
 
 
439 aa  312  1e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000040432 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3695  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.68 
 
 
629 aa  311  2e-83  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5079  phospholipid/glycerol acyltransferase  39.25 
 
 
652 aa  311  2e-83  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0309  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.25 
 
 
658 aa  311  2e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3732  putative transmembrane protein  38.23 
 
 
632 aa  311  2e-83  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.896523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4497  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.34 
 
 
644 aa  310  5.9999999999999995e-83  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.170703 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.89 
 
 
634 aa  306  7e-82  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3058  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.2 
 
 
662 aa  303  4.0000000000000003e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.024597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  38.62 
 
 
644 aa  303  4.0000000000000003e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0248879  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02956  2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  36.15 
 
 
640 aa  300  7e-80  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3878  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.76 
 
 
651 aa  294  3e-78  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828126  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3151  phospholipid/glycerol acyltransferase  36.76 
 
 
651 aa  294  4e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.233889  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01330  major facilitator superfamily (MFS_1) protein  44.16 
 
 
453 aa  291  2e-77  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  38.88 
 
 
429 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1222  hypothetical protein  37.38 
 
 
435 aa  264  4e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1153  major facilitator transporter  40.2 
 
 
431 aa  259  1e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1222  hypothetical protein  36.89 
 
 
435 aa  258  2e-67  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  36.45 
 
 
438 aa  252  1e-65  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1334  major facilitator transporter  37.67 
 
 
440 aa  247  4e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0164505  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5738  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  34.63 
 
 
1144 aa  229  1e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1780  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.17 
 
 
1138 aa  218  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1501  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.17 
 
 
1138 aa  217  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1502  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  34.2 
 
 
1138 aa  204  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.780904 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0910  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  35.76 
 
 
1137 aa  204  5e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.0715887 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1253  major facilitator transporter  33.6 
 
 
435 aa  194  3e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.717143  decreased coverage  0.0000211446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0197  major facilitator superfamily MFS_1  32.05 
 
 
430 aa  194  4e-48  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31792 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0679  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.57 
 
 
1131 aa  190  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120041  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0737  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.3 
 
 
1131 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00473153  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4578  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.81 
 
 
1139 aa  187  3e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.557589  normal  0.0311221 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4512  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.72 
 
 
1139 aa  186  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132383  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0852  major facilitator transporter  30.51 
 
 
442 aa  182  1e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.83 
 
 
1131 aa  177  5e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.83 
 
 
1124 aa  169  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1714  major facilitator transporter  34.43 
 
 
538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  29.32 
 
 
1136 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.62 
 
 
1114 aa  163  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.87 
 
 
1155 aa  160  7e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.6 
 
 
1128 aa  157  7e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3365  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.01 
 
 
1146 aa  147  6e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2776  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.75 
 
 
1129 aa  146  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2369  AMP-dependent synthetase and ligase  25.44 
 
 
1185 aa  130  9.000000000000001e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>