More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1297 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009656  PSPA7_1854  hypothetical protein  72.8 
 
 		 624 aa  908    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328604  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  96.32 
 
 		 625 aa  1182    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1700  phospholipid/glycerol acyltransferase  96.48 
 
 		 661 aa  1184    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  94.56 
 
 		 625 aa  1165    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.449657  decreased coverage  0.00341201 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3899  acyltransferase family protein  76.64 
 
 		 624 aa  960    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.516687  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1586  phospholipid/glycerol acyltransferase:phospholipid/glycerol acyltransferase  76.48 
 
 		 624 aa  942    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1665  phospholipid/glycerol acyltransferase  80.48 
 
 		 624 aa  1011    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054165  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 625 aa  1244    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21750  hypothetical protein  73.12 
 
 		 624 aa  903    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.783419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3147  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.16 
 
 		 624 aa  951    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733327  normal  0.020121 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2856  phospholipid/glycerol acyltransferase  51.18 
 
 		 637 aa  609  1e-173  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000113007  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0169  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.56 
 
 		 625 aa  603  1.0000000000000001e-171  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.92 
 
 		 635 aa  595  1e-169  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.08 
 
 		 635 aa  587  1e-166  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.72 
 
 		 626 aa  588  1e-166  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  50.08 
 
 		 635 aa  579  1e-164  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.53 
 
 		 634 aa  577  1.0000000000000001e-163  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  50 
 
 		 644 aa  568  1e-161  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  50 
 
 		 644 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  50 
 
 		 644 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  50 
 
 		 644 aa  569  1e-161  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  49.52 
 
 		 644 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  49.52 
 
 		 644 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.76 
 
 		 644 aa  566  1e-160  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  49.52 
 
 		 644 aa  568  1e-160  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.76 
 
 		 644 aa  567  1e-160  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  49.84 
 
 		 644 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  50 
 
 		 626 aa  561  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.5 
 
 		 632 aa  559  1e-158  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3695  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.03 
 
 		 629 aa  560  1e-158  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  48.1 
 
 		 624 aa  561  1e-158  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  47.62 
 
 		 624 aa  555  1e-157  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.68 
 
 		 644 aa  554  1e-156  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02956  2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  47.67 
 
 		 640 aa  551  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.21 
 
 		 645 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  47.76 
 
 		 645 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.22 
 
 		 645 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3151  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.39 
 
 		 651 aa  538  1e-151  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.233889  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3732  putative transmembrane protein  48.56 
 
 		 632 aa  537  1e-151  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.896523 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4497  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.54 
 
 		 644 aa  538  1e-151  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3878  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.39 
 
 		 651 aa  537  1e-151  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828126  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3545  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.41 
 
 		 620 aa  533  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4184  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.4 
 
 		 620 aa  532  1e-150  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0187  acyltransferase family protein  47.57 
 
 		 618 aa  533  1e-150  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.4 
 
 		 620 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0175  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.88 
 
 		 620 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.292728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0537  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.94 
 
 		 654 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160332 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5079  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.32 
 
 		 652 aa  527  1e-148  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.99 
 
 		 620 aa  528  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.99 
 
 		 621 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0171  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.4 
 
 		 620 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0168  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.24 
 
 		 620 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  50.18 
 
 		 604 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  50.18 
 
 		 604 aa  519  1e-146  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0194  acyltransferase family protein  47 
 
 		 620 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000570  lysophospholipid transporter LplT/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase/acyl-[acyl-carrier-protein] synthetase  46.6 
 
 		 617 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05313  hypothetical protein  46.13 
 
 		 618 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0133  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.35 
 
 		 620 aa  514  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449425 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0457  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.48 
 
 		 653 aa  511  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409377  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.59 
 
 		 644 aa  510  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0248879  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0309  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.83 
 
 		 658 aa  508  9.999999999999999e-143  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3058  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.65 
 
 		 662 aa  489  1e-137  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.024597 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0122  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.71 
 
 		 618 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.430079  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3020  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.41 
 
 		 629 aa  432  1e-120  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011576  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1690  major facilitator transporter  46.1 
 
 		 446 aa  357  5e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.86317 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1511  major facilitator transporter  45.86 
 
 		 446 aa  351  2e-95  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3578  major facilitator superfamily MFS_1  54.19 
 
 		 432 aa  351  3e-95  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0372089  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4343  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.75 
 
 		 589 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  34.42 
 
 		 1155 aa  320  6e-86  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1608  major facilitator transporter  45.89 
 
 		 439 aa  314  2.9999999999999996e-84  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000040432 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0159  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 560 aa  308  3e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591852  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01330  major facilitator superfamily (MFS_1) protein  49.1 
 
 		 453 aa  303  4.0000000000000003e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1780  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  35.11 
 
 		 1138 aa  303  5.000000000000001e-81  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1501  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  34.95 
 
 		 1138 aa  301  2e-80  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4715  major facilitator transporter  45.67 
 
 		 429 aa  296  6e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0910  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  35.86 
 
 		 1137 aa  295  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.0715887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0737  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  31.91 
 
 		 1131 aa  290  4e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00473153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  40.96 
 
 		 429 aa  288  2.9999999999999996e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0679  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  31.38 
 
 		 1131 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1502  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  35.35 
 
 		 1138 aa  278  3e-73  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.780904 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  34.25 
 
 		 1131 aa  277  5e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5738  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.74 
 
 		 1144 aa  275  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.64 
 
 		 1114 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  33.06 
 
 		 1128 aa  274  4.0000000000000004e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1153  major facilitator transporter  41.18 
 
 		 431 aa  273  7e-72  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4512  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  35.07 
 
 		 1139 aa  268  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132383  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  33.61 
 
 		 1136 aa  268  2e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  33.87 
 
 		 1124 aa  267  4e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  37.98 
 
 		 438 aa  263  1e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4578  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.56 
 
 		 1139 aa  258  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.557589  normal  0.0311221 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3365  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  33.18 
 
 		 1146 aa  254  5.000000000000001e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1222  hypothetical protein  35.89 
 
 		 435 aa  250  7e-65  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1222  hypothetical protein  35.65 
 
 		 435 aa  249  9e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2776  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  34.07 
 
 		 1129 aa  248  2e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1334  major facilitator transporter  37.95 
 
 		 440 aa  243  9e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0164505  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1253  major facilitator transporter  38.48 
 
 		 435 aa  241  4e-62  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.717143  decreased coverage  0.0000211446 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2369  AMP-dependent synthetase and ligase  32.2 
 
 		 1185 aa  235  2.0000000000000002e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0197  major facilitator superfamily MFS_1  34.93 
 
 		 430 aa  219  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31792 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0852  major facilitator transporter  34.62 
 
 		 442 aa  210  8e-53  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0921  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.44 
 
 		 1170 aa  204  4e-51  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>