More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_0133 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_0194  acyltransferase family protein  81.85 
 
 		 620 aa  1010    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05313  hypothetical protein  69.53 
 
 		 618 aa  904    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0175  phospholipid/glycerol acyltransferase  80.65 
 
 		 620 aa  1011    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.292728 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0133  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 		 620 aa  1260    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.449425 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  80.32 
 
 		 620 aa  1010    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000570  lysophospholipid transporter LplT/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase/acyl-[acyl-carrier-protein] synthetase  70.68 
 
 		 617 aa  897    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3545  phospholipid/glycerol acyltransferase  82.42 
 
 		 620 aa  1047    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  81.45 
 
 		 620 aa  1021    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0168  phospholipid/glycerol acyltransferase  81.36 
 
 		 620 aa  1020    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0122  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.2 
 
 		 618 aa  919    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.430079  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  81.2 
 
 		 621 aa  1015    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0187  acyltransferase family protein  73.74 
 
 		 618 aa  941    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0171  phospholipid/glycerol acyltransferase  80.16 
 
 		 620 aa  1009    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4184  phospholipid/glycerol acyltransferase  80.32 
 
 		 620 aa  1010    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4343  phospholipid/glycerol acyltransferase  61.65 
 
 		 589 aa  615  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0169  phospholipid/glycerol acyltransferase  52.19 
 
 		 625 aa  599  1e-170  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  49.84 
 
 		 626 aa  591  1e-167  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  50.08 
 
 		 626 aa  590  1e-167  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2856  phospholipid/glycerol acyltransferase  48.78 
 
 		 637 aa  579  1e-164  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000113007  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  48.78 
 
 		 624 aa  575  1.0000000000000001e-163  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  48.78 
 
 		 624 aa  569  1e-161  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0159  major facilitator transporter  59.45 
 
 		 560 aa  527  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1700  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.19 
 
 		 661 aa  522  1e-147  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3147  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.52 
 
 		 624 aa  522  1e-147  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733327  normal  0.020121 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.35 
 
 		 625 aa  523  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.03 
 
 		 625 aa  521  1e-146  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.449657  decreased coverage  0.00341201 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1854  hypothetical protein  47.09 
 
 		 624 aa  519  1e-146  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328604  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.35 
 
 		 625 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3899  acyltransferase family protein  47.09 
 
 		 624 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.516687  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1665  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.56 
 
 		 624 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054165  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.91 
 
 		 644 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21750  hypothetical protein  47.09 
 
 		 624 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.783419 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.91 
 
 		 644 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1586  phospholipid/glycerol acyltransferase:phospholipid/glycerol acyltransferase  46.84 
 
 		 624 aa  513  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  44.26 
 
 		 644 aa  514  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.91 
 
 		 644 aa  515  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.43 
 
 		 632 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.63 
 
 		 644 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.63 
 
 		 644 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.98 
 
 		 644 aa  511  1e-143  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.87 
 
 		 635 aa  506  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.44 
 
 		 635 aa  503  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  43.78 
 
 		 644 aa  504  1e-141  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  45.33 
 
 		 644 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  43.39 
 
 		 645 aa  501  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.52 
 
 		 634 aa  501  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.06 
 
 		 645 aa  501  1e-140  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  45.33 
 
 		 644 aa  501  1e-140  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0537  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.79 
 
 		 654 aa  496  1e-139  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0160332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.3 
 
 		 645 aa  498  1e-139  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  45.16 
 
 		 644 aa  498  1e-139  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  45.04 
 
 		 635 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3732  putative transmembrane protein  44.71 
 
 		 632 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.896523 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3020  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.35 
 
 		 629 aa  483  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011576  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4497  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.72 
 
 		 644 aa  484  1e-135  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.170703 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4715  major facilitator transporter  58.39 
 
 		 429 aa  480  1e-134  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3878  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.93 
 
 		 651 aa  476  1e-133  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828126  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3151  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.93 
 
 		 651 aa  475  1e-132  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.233889  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02956  2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  41.52 
 
 		 640 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  44.5 
 
 		 604 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.24 
 
 		 644 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0248879  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5079  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.18 
 
 		 652 aa  470  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  44.5 
 
 		 604 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3695  phospholipid/glycerol acyltransferase  40.84 
 
 		 629 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0457  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.61 
 
 		 653 aa  466  9.999999999999999e-131  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409377  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3058  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.45 
 
 		 662 aa  464  1e-129  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.024597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0309  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.54 
 
 		 658 aa  465  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1690  major facilitator transporter  44.74 
 
 		 446 aa  347  4e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.86317 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1511  major facilitator transporter  43.54 
 
 		 446 aa  339  9.999999999999999e-92  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3578  major facilitator superfamily MFS_1  47.2 
 
 		 432 aa  327  3e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0372089  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1608  major facilitator transporter  43.06 
 
 		 439 aa  306  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000040432 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01330  major facilitator superfamily (MFS_1) protein  45.48 
 
 		 453 aa  304  3.0000000000000004e-81  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.08 
 
 		 1155 aa  297  3e-79  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.62 
 
 		 1114 aa  290  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2776  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.42 
 
 		 1129 aa  278  3e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  39.38 
 
 		 429 aa  276  9e-73  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.74 
 
 		 1131 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0910  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  33.28 
 
 		 1137 aa  273  5.000000000000001e-72  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.0715887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1780  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.82 
 
 		 1138 aa  272  1e-71  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324792 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  33.11 
 
 		 1136 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1501  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.82 
 
 		 1138 aa  272  2e-71  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.65 
 
 		 1128 aa  269  1e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.42 
 
 		 1124 aa  269  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5738  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.56 
 
 		 1144 aa  268  2e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3365  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  30.98 
 
 		 1146 aa  260  4e-68  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1502  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  31.21 
 
 		 1138 aa  258  2e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.780904 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0679  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.49 
 
 		 1131 aa  257  5e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120041  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  36.05 
 
 		 438 aa  256  1.0000000000000001e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0737  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  29.03 
 
 		 1131 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00473153  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1222  hypothetical protein  37.89 
 
 		 435 aa  249  1e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1153  major facilitator transporter  39.35 
 
 		 431 aa  249  1e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1222  hypothetical protein  37.14 
 
 		 435 aa  246  9.999999999999999e-64  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1334  major facilitator transporter  38.04 
 
 		 440 aa  238  2e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0164505  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4512  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  31.4 
 
 		 1139 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132383  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2369  AMP-dependent synthetase and ligase  29.36 
 
 		 1185 aa  233  8.000000000000001e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4578  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.81 
 
 		 1139 aa  222  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.557589  normal  0.0311221 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0197  major facilitator superfamily MFS_1  35.07 
 
 		 430 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31792 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0955  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  26.9 
 
 		 1170 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000517979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1253  major facilitator transporter  35.54 
 
 		 435 aa  200  7.999999999999999e-50  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.717143  decreased coverage  0.0000211446 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0921  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  29.06 
 
 		 1170 aa  199  1.0000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>