More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_0122 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_0194  acyltransferase family protein  76.1 
 
 
620 aa  933    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4082  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.59 
 
 
620 aa  947    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0171  phospholipid/glycerol acyltransferase  77 
 
 
620 aa  947    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000570  lysophospholipid transporter LplT/2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase/acyl-[acyl-carrier-protein] synthetase  67.77 
 
 
617 aa  852    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0175  phospholipid/glycerol acyltransferase  77.16 
 
 
620 aa  946    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.292728 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.05 
 
 
620 aa  939    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0168  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.57 
 
 
620 aa  940    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0819897 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0122  phospholipid/glycerol acyltransferase  100 
 
 
618 aa  1254    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.430079  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0133  phospholipid/glycerol acyltransferase  75.2 
 
 
620 aa  922    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.449425 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3545  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.86 
 
 
620 aa  961    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0173  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.59 
 
 
621 aa  942    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0187  acyltransferase family protein  70.29 
 
 
618 aa  884    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0791415 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05313  hypothetical protein  67.21 
 
 
618 aa  861    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4184  phospholipid/glycerol acyltransferase  76.59 
 
 
620 aa  947    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1552  hypothetical protein  50.57 
 
 
626 aa  586  1e-166  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.447419  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01437  hypothetical protein  49.27 
 
 
624 aa  580  1e-164  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0169  phospholipid/glycerol acyltransferase  49.84 
 
 
625 aa  574  1.0000000000000001e-162  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004025  hypothetical protein  48.46 
 
 
624 aa  567  1e-160  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0141461  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2856  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.99 
 
 
637 aa  563  1.0000000000000001e-159  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000113007  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4343  phospholipid/glycerol acyltransferase  57.06 
 
 
589 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0523485 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0405  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.67 
 
 
626 aa  559  1e-158  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.701436 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0159  major facilitator transporter  59.03 
 
 
560 aa  525  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.591852  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1700  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.19 
 
 
661 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0965087 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.21 
 
 
632 aa  516  1.0000000000000001e-145  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.667029  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4020  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.35 
 
 
625 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1255  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.44 
 
 
625 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.449657  decreased coverage  0.00341201 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1665  phospholipid/glycerol acyltransferase  47.17 
 
 
624 aa  512  1e-144  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.054165  normal  0.0273745 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4604  major facilitator superfamily transporter/phospholipid/glycerol acyltransferase  45.03 
 
 
644 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0964718  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1380  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.03 
 
 
644 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.856404  normal  0.602564 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0977  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.19 
 
 
644 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1459  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.19 
 
 
644 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1437  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.19 
 
 
644 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1297  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.71 
 
 
625 aa  505  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1340  phospholipid/glycerol acyltransferase  44.87 
 
 
644 aa  504  1e-141  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203495  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21750  hypothetical protein  46.61 
 
 
624 aa  505  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.783419 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3147  phospholipid/glycerol acyltransferase  45.88 
 
 
624 aa  504  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.733327  normal  0.020121 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1854  hypothetical protein  45.56 
 
 
624 aa  497  1e-139  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.328604  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.43 
 
 
635 aa  495  1e-139  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0176681 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1989  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.94 
 
 
635 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1586  phospholipid/glycerol acyltransferase:phospholipid/glycerol acyltransferase  45.93 
 
 
624 aa  494  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.12402 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1136  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.32 
 
 
634 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.492362  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1790  phospholipid/glycerol acyltransferase  46.21 
 
 
644 aa  493  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.236917  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2768  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.25 
 
 
645 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3899  acyltransferase family protein  45.38 
 
 
624 aa  490  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.516687  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1359  lysophospholipid exporter/ 2-acylglycerolphosphoethanolamine acyltransferase  43.89 
 
 
645 aa  486  1e-136  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.526954 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1564  hypothetical protein  44.23 
 
 
635 aa  483  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0537  phospholipid/glycerol acyltransferase  43.99 
 
 
654 aa  481  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0160332 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2615  acyltransferase family protein  42.95 
 
 
644 aa  479  1e-134  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1570  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.38 
 
 
645 aa  476  1e-133  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297196  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1865  acyltransferase family protein  42.63 
 
 
644 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0815043  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1688  major facilitator transporter  42.63 
 
 
644 aa  478  1e-133  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.821003  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1711  major facilitator superfamily permease  42.47 
 
 
644 aa  475  1e-132  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5079  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.45 
 
 
652 aa  471  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3695  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.84 
 
 
629 aa  466  9.999999999999999e-131  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.757396 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3020  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.69 
 
 
629 aa  468  9.999999999999999e-131  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.011576  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4715  major facilitator transporter  57.41 
 
 
429 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3151  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.6 
 
 
651 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.233889  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4497  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.72 
 
 
644 aa  459  9.999999999999999e-129  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.170703 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3878  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.6 
 
 
651 aa  460  9.999999999999999e-129  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.828126  normal  0.597127 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3732  putative transmembrane protein  42.72 
 
 
632 aa  458  1e-127  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.896523 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0457  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.86 
 
 
653 aa  451  1e-125  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.409377  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1479  major facilitator family protein  44.13 
 
 
604 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.305606  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1659  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.99 
 
 
644 aa  448  1.0000000000000001e-124  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0248879  normal  0.151589 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0403  transporter  44.13 
 
 
604 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02956  2-acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  39.65 
 
 
640 aa  443  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3058  phospholipid/glycerol acyltransferase  42.06 
 
 
662 aa  444  1e-123  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.024597 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0309  phospholipid/glycerol acyltransferase  41.27 
 
 
658 aa  442  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1690  major facilitator transporter  44.05 
 
 
446 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.86317 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1511  major facilitator transporter  43.81 
 
 
446 aa  343  8e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1608  major facilitator transporter  43.68 
 
 
439 aa  310  5.9999999999999995e-83  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000040432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3578  major facilitator superfamily MFS_1  44.24 
 
 
432 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0372089  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01330  major facilitator superfamily (MFS_1) protein  44.93 
 
 
453 aa  298  2e-79  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4052  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.38 
 
 
1155 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.378016 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1106  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.39 
 
 
1114 aa  284  4.0000000000000003e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3029  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  32.14 
 
 
1136 aa  271  2e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.354114  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0285  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  30.94 
 
 
1131 aa  272  2e-71  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0069  major facilitator transporter  38.41 
 
 
429 aa  267  2.9999999999999995e-70  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0302  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.06 
 
 
1124 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5738  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  32.03 
 
 
1144 aa  264  4e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0910  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  31.58 
 
 
1137 aa  262  1e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.663694  normal  0.0715887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1780  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.68 
 
 
1138 aa  261  3e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324792 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1501  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.69 
 
 
1138 aa  261  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2776  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.03 
 
 
1129 aa  259  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0086  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.14 
 
 
1128 aa  259  1e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00331744  hitchhiker  0.000105918 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3595  major facilitator transporter  37.07 
 
 
438 aa  253  6e-66  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.425958  normal  0.449401 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3365  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  31.2 
 
 
1146 aa  253  1e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1222  hypothetical protein  36.36 
 
 
435 aa  247  4e-64  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1222  hypothetical protein  36.12 
 
 
435 aa  245  1.9999999999999999e-63  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1153  major facilitator transporter  37.44 
 
 
431 aa  245  1.9999999999999999e-63  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.558016 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2369  AMP-dependent synthetase and ligase  30.25 
 
 
1185 aa  244  3.9999999999999997e-63  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1502  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  31.35 
 
 
1138 aa  243  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.780904 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0679  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.95 
 
 
1131 aa  242  2e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.120041  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4512  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.23 
 
 
1139 aa  241  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132383  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0737  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  30.62 
 
 
1131 aa  241  4e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00473153  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1334  major facilitator transporter  36.72 
 
 
440 aa  230  7e-59  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0164505  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4578  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  29.18 
 
 
1139 aa  226  9e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.557589  normal  0.0311221 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0921  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  29.5 
 
 
1170 aa  209  2e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1253  major facilitator transporter  35.71 
 
 
435 aa  207  4e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.717143  decreased coverage  0.0000211446 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0197  major facilitator superfamily MFS_1  33.49 
 
 
430 aa  207  5e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.31792 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1016  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  28.86 
 
 
1170 aa  201  3e-50  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>