65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0618 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0618  ABC-3 protein  100 
 
 		 286 aa  565  1e-160  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.087201  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4332  ABC-3 protein  82.02 
 
 		 265 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3309  ABC-3 protein  80.82 
 
 		 262 aa  397  9.999999999999999e-111  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0567  ABC-3 protein  79.67 
 
 		 255 aa  394  1e-109  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3462  ABC-3 protein  79.67 
 
 		 259 aa  394  1e-109  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0568  ABC-3 protein  79.27 
 
 		 255 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0566  ABC 3 transport family protein  73.23 
 
 		 259 aa  389  1e-107  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0449  ABC-3 protein  77.9 
 
 		 263 aa  384  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.856508  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3515  ABC-3 protein  74.61 
 
 		 261 aa  382  1e-105  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3797  ABC-3 protein  77.22 
 
 		 266 aa  374  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3923  ABC-3 protein  77.22 
 
 		 266 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0528  ABC-3 protein  77.22 
 
 		 266 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3740  ABC-3 protein  77.61 
 
 		 266 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3140  ABC 3 transport family protein  78.54 
 
 		 251 aa  371  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3714  ABC-3 protein  81.3 
 
 		 263 aa  369  1e-101  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0529  hypothetical protein  69.77 
 
 		 263 aa  348  7e-95  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00670346  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06464  hypothetical protein  40.74 
 
 		 264 aa  175  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000604  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  39.92 
 
 		 267 aa  172  5.999999999999999e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000103291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2539  zinc/manganese transport system permease protein  50 
 
 		 256 aa  155  9e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.421777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1547  ABC-3 protein  34.31 
 
 		 249 aa  116  5e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363711  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  35.74 
 
 		 466 aa  104  1e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0050  putative manganese transport system permease protein  33.91 
 
 		 249 aa  100  3e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  26.74 
 
 		 267 aa  51.2  0.00002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  28.41 
 
 		 276 aa  49.3  0.00008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  24.69 
 
 		 272 aa  49.3  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3890  ABC-3 protein  24.69 
 
 		 272 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  26.34 
 
 		 267 aa  48.9  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  29.95 
 
 		 239 aa  47.8  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  36.19 
 
 		 271 aa  48.1  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  34.29 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0688  cation ABC transporter, permease protein, putative  26.59 
 
 		 263 aa  48.1  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  34.85 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  28.09 
 
 		 280 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  26.81 
 
 		 287 aa  47  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0326  cation ABC transporter, permease protein, putative  26.36 
 
 		 263 aa  45.8  0.0009  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  30.47 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  25.13 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1027  metal ABC transport system permease protein  26.24 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.182005  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0072  putative cation ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0868  putative cation ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0864  putative cation ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0624  putative cation ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.987461  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2458  putative cation ABC transporter, permease protein  26.24 
 
 		 274 aa  45.4  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0518  cation ABC transporter, permease protein  24.9 
 
 		 264 aa  44.7  0.002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1236  anchored repeat-type ABC transporter, permease subunit  24.24 
 
 		 287 aa  44.3  0.002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000156655 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00860  zinc ABC transporter, permease protein  36.17 
 
 		 262 aa  44.3  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.952452  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  25.71 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1727  cation ABC transporter, permease protein  24.31 
 
 		 275 aa  44.7  0.002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0132  ABC-3 protein  36.96 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.493035  normal  0.654734 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0134  ABC-3 protein  36.96 
 
 		 260 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2036  ABC-3 protein  25.68 
 
 		 312 aa  44.7  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292587  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  30.93 
 
 		 273 aa  43.9  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  29.69 
 
 		 274 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  28.71 
 
 		 289 aa  43.9  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0117  hypothetical protein  36.96 
 
 		 260 aa  44.3  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.772352  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  24.51 
 
 		 275 aa  43.5  0.004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3284  ABC-3 protein  32.17 
 
 		 307 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4803  ABC-3 protein  27.53 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4717  hypothetical protein  27.53 
 
 		 288 aa  43.1  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4436  hypothetical protein  38.67 
 
 		 294 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.44647  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0220  zinc ABC transporter, permease protein  34.62 
 
 		 125 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5102  ABC-3 protein  27.53 
 
 		 288 aa  43.1  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.593949  normal  0.159747 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3413  ABC-3 protein  33.72 
 
 		 278 aa  42.7  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5111  ABC-3 protein  35.87 
 
 		 260 aa  42.4  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.156764 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  25.35 
 
 		 265 aa  42.4  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>