42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0529 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0529  hypothetical protein  100 
 
 		 263 aa  511  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00670346  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3515  ABC-3 protein  72.09 
 
 		 261 aa  359  3e-98  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3462  ABC-3 protein  74.39 
 
 		 259 aa  359  3e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3309  ABC-3 protein  73.88 
 
 		 262 aa  358  5e-98  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0567  ABC-3 protein  74.39 
 
 		 255 aa  358  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0566  ABC 3 transport family protein  73.98 
 
 		 259 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0568  ABC-3 protein  73.98 
 
 		 255 aa  357  9.999999999999999e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4332  ABC-3 protein  70.85 
 
 		 265 aa  344  8.999999999999999e-94  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0449  ABC-3 protein  75.71 
 
 		 263 aa  337  9.999999999999999e-92  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.856508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3923  ABC-3 protein  75.1 
 
 		 266 aa  335  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3740  ABC-3 protein  75.1 
 
 		 266 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3797  ABC-3 protein  75.1 
 
 		 266 aa  335  3.9999999999999995e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0528  ABC-3 protein  75.1 
 
 		 266 aa  335  5.999999999999999e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0618  ABC-3 protein  69.77 
 
 		 286 aa  332  3e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.087201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3140  ABC 3 transport family protein  70.16 
 
 		 251 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3714  ABC-3 protein  70.28 
 
 		 263 aa  304  9.000000000000001e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06464  hypothetical protein  40.24 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000604  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  39.92 
 
 		 267 aa  173  2.9999999999999996e-42  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000103291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2539  zinc/manganese transport system permease protein  48.72 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.421777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1547  ABC-3 protein  32.17 
 
 		 249 aa  110  3e-23  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363711  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0050  putative manganese transport system permease protein  34.3 
 
 		 249 aa  91.3  2e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  32.34 
 
 		 466 aa  89  7e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1010  ABC-3 protein  37.37 
 
 		 288 aa  47.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  29.23 
 
 		 285 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  28.78 
 
 		 267 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  34.65 
 
 		 271 aa  46.6  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1949  hypothetical protein  28.66 
 
 		 299 aa  46.2  0.0006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.386969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  34.23 
 
 		 271 aa  45.4  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  29.79 
 
 		 239 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0220  zinc ABC transporter, permease protein  35.06 
 
 		 125 aa  45.1  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  27.54 
 
 		 280 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2617  ABC-3 protein  28.29 
 
 		 312 aa  43.1  0.004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.60645 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  25.81 
 
 		 281 aa  43.1  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2139  cation ABC transporter, permease protein  28.99 
 
 		 299 aa  43.1  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  25.35 
 
 		 265 aa  43.1  0.005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  28.08 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  26.06 
 
 		 293 aa  42.7  0.007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  38.36 
 
 		 272 aa  42.7  0.007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  38.57 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1104  ABC-3 protein  24.85 
 
 		 264 aa  42  0.009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.310242  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1789  oligoendopeptidase F  25.9 
 
 		 268 aa  42  0.01  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>