68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000604 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000604  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  100 
 
 		 267 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000103291  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06464  hypothetical protein  79.13 
 
 		 264 aa  387  1e-107  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4332  ABC-3 protein  41.86 
 
 		 265 aa  181  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0568  ABC-3 protein  42.11 
 
 		 255 aa  179  4e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3462  ABC-3 protein  41.7 
 
 		 259 aa  179  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0567  ABC-3 protein  41.7 
 
 		 255 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0566  ABC 3 transport family protein  41.7 
 
 		 259 aa  177  1e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3515  ABC-3 protein  40.32 
 
 		 261 aa  177  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3309  ABC-3 protein  41.87 
 
 		 262 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3140  ABC 3 transport family protein  39.92 
 
 		 251 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0529  hypothetical protein  39.92 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00670346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0618  ABC-3 protein  39.92 
 
 		 286 aa  169  3e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.087201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0449  ABC-3 protein  40.4 
 
 		 263 aa  167  1e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.856508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3923  ABC-3 protein  40.65 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3740  ABC-3 protein  40.65 
 
 		 266 aa  163  3e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3797  ABC-3 protein  40.65 
 
 		 266 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48799  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0528  ABC-3 protein  39.92 
 
 		 266 aa  161  9e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3714  ABC-3 protein  41 
 
 		 263 aa  158  7e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2539  zinc/manganese transport system permease protein  37.66 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.421777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1547  ABC-3 protein  25.68 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363711  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0050  putative manganese transport system permease protein  30.13 
 
 		 249 aa  80.1  0.00000000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  27.2 
 
 		 466 aa  68.2  0.0000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  27.78 
 
 		 289 aa  49.7  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  37.25 
 
 		 271 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  37.96 
 
 		 271 aa  48.5  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  30.65 
 
 		 279 aa  48.1  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0996  zinc ABC transporter, permease protein  24.71 
 
 		 274 aa  47.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.349684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  27.53 
 
 		 261 aa  47.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1444  hypothetical protein  30.42 
 
 		 239 aa  47  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00097924  normal  0.0494808 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2109  high-affinity zinc transporter membrane component  27.87 
 
 		 261 aa  47.4  0.0003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.14561  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3044  ABC-3 protein  29.82 
 
 		 289 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00612109  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  27.45 
 
 		 277 aa  46.6  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  28.72 
 
 		 261 aa  45.8  0.0006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  25.46 
 
 		 286 aa  46.2  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  28.81 
 
 		 261 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  28.81 
 
 		 261 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  28.81 
 
 		 261 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  28.81 
 
 		 261 aa  45.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.27 
 
 		 288 aa  45.4  0.0009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0220  zinc ABC transporter, permease protein  34.74 
 
 		 125 aa  45.4  0.0009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  27.32 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.27 
 
 		 288 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  27.32 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  27.32 
 
 		 261 aa  45.1  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 267 aa  45.4  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0928  hypothetical protein  30.41 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0195697  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0670  ABC-3 protein  27.92 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0026627  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0655  ABC-3 protein  27.92 
 
 		 278 aa  44.7  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00255792  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  23.22 
 
 		 266 aa  43.9  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  25 
 
 		 267 aa  43.5  0.003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1825  high-affinity zinc transporter membrane component  26.23 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.206601  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  28.14 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  28.14 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2965  ABC transporter permease  27.31 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000539845  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  28.14 
 
 		 261 aa  43.5  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2844  ABC-3 protein  27.12 
 
 		 281 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3190  ABC transporter permease  27.31 
 
 		 288 aa  43.5  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  24.71 
 
 		 276 aa  43.1  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  25.1 
 
 		 285 aa  42.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4771  ABC-3 protein  25.1 
 
 		 287 aa  42.7  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.129211  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  27.64 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  27.64 
 
 		 261 aa  42.4  0.007  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  25.91 
 
 		 272 aa  42.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  27.64 
 
 		 261 aa  42  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  27.64 
 
 		 261 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  27.64 
 
 		 261 aa  42  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  27.64 
 
 		 261 aa  42  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>