56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06464 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06464  hypothetical protein  100 
 
 		 264 aa  522  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000604  zinc ABC transporter permease protein ZnuB  79.13 
 
 		 267 aa  387  1e-107  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000103291  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3515  ABC-3 protein  41.47 
 
 		 261 aa  185  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4332  ABC-3 protein  43.21 
 
 		 265 aa  182  4.0000000000000006e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.364125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3140  ABC 3 transport family protein  42.8 
 
 		 251 aa  181  9.000000000000001e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0567  ABC-3 protein  41.15 
 
 		 255 aa  176  3e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3309  ABC-3 protein  40.31 
 
 		 262 aa  176  3e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.224275  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3462  ABC-3 protein  39.69 
 
 		 259 aa  176  3e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0568  ABC-3 protein  41.15 
 
 		 255 aa  176  5e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0566  ABC 3 transport family protein  40.33 
 
 		 259 aa  175  8e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0529  hypothetical protein  40.24 
 
 		 263 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00670346  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0618  ABC-3 protein  40.74 
 
 		 286 aa  173  2.9999999999999996e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.087201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0449  ABC-3 protein  40.77 
 
 		 263 aa  170  3e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.856508  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3740  ABC-3 protein  40.08 
 
 		 266 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.298841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3797  ABC-3 protein  40.08 
 
 		 266 aa  162  7e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.48799  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3923  ABC-3 protein  40.08 
 
 		 266 aa  162  8.000000000000001e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00893533  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3714  ABC-3 protein  41.41 
 
 		 263 aa  161  8.000000000000001e-39  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0390511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0528  ABC-3 protein  39.67 
 
 		 266 aa  160  2e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000497802  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2539  zinc/manganese transport system permease protein  37.82 
 
 		 256 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.421777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1547  ABC-3 protein  25.94 
 
 		 249 aa  89.7  4e-17  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000363711  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0050  putative manganese transport system permease protein  30.64 
 
 		 249 aa  85.9  7e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2782  ABC-3 protein  26.78 
 
 		 466 aa  75.1  0.000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  25.1 
 
 		 266 aa  50.1  0.00004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2595  high-affinity zinc transporter membrane component  28.87 
 
 		 261 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0140343  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0955  high-affinity zinc transporter membrane component  28.87 
 
 		 261 aa  48.9  0.00007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0177046  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1327  high-affinity zinc transporter membrane component  28.87 
 
 		 261 aa  49.3  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0274583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1952  high-affinity zinc transporter membrane component  28.87 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0398109  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1781  ABC-3 protein  28.87 
 
 		 261 aa  48.9  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000666084  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01818  hypothetical protein  28.87 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0233663  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1773  high-affinity zinc transporter membrane component  28.87 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000387167  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2775  high-affinity zinc transporter membrane component  26.23 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000664264  hitchhiker  0.0068137 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01830  high-affinity zinc transporter membrane component  28.87 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0395688  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2089  high-affinity zinc transporter membrane component  28.87 
 
 		 261 aa  48.9  0.00009  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000234028  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  25.5 
 
 		 289 aa  48.1  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  25.27 
 
 		 277 aa  48.5  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2716  ABC-3 protein  38.46 
 
 		 271 aa  45.8  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.585165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2086  hypothetical protein  23.23 
 
 		 277 aa  45.4  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.628213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_574  cation ABC transporter, permease protein  24.72 
 
 		 273 aa  45.4  0.0009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0177  cation ABC transporter, permease protein  24.59 
 
 		 267 aa  45.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2735  ABC-3 protein  23.67 
 
 		 277 aa  45.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1038  high-affinity zinc uptake system, membrane protein  24.9 
 
 		 261 aa  45.4  0.001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2382  ABC-3 protein  37.18 
 
 		 271 aa  45.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.502952  normal  0.42152 
 
 
-
 
NC_002936  DET0633  cation ABC transporter, permease protein  24.8 
 
 		 273 aa  44.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2052  high-affinity zinc transporter membrane component  27.32 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00746645  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1355  high-affinity zinc transporter membrane component  27.87 
 
 		 261 aa  44.3  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.637528  hitchhiker  0.00410518 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1231  high-affinity zinc transporter membrane component  27.32 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0480731  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1913  ABC-3 protein  35.42 
 
 		 280 aa  43.9  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2047  high-affinity zinc transporter membrane component  27.32 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.397318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2107  high-affinity zinc transporter membrane component  27.32 
 
 		 261 aa  43.9  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0995017  normal  0.378427 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0153  cation ABC transporter, permease protein  24.04 
 
 		 267 aa  42.7  0.006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2893  ABC-3 transporter component  25.93 
 
 		 286 aa  42.7  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2419  high-affinity zinc transporter membrane component  26.59 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000310688  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2029  high-affinity zinc transporter membrane component  26.59 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000722551  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2142  high-affinity zinc transporter membrane component  26.59 
 
 		 261 aa  42.4  0.008  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000271019  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3940  ABC-3 protein  21.77 
 
 		 272 aa  42  0.009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0593953 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  27.23 
 
 		 264 aa  42.4  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>