137 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0511 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  100 
 
 		 400 aa  781    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  86.25 
 
 		 400 aa  686    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  86.25 
 
 		 400 aa  665    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  64.21 
 
 		 395 aa  486  1e-136  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  63.45 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  63.1 
 
 		 395 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  63.2 
 
 		 395 aa  475  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  63.2 
 
 		 395 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  63.36 
 
 		 395 aa  473  1e-132  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  63.36 
 
 		 395 aa  472  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  63.1 
 
 		 395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  62.85 
 
 		 395 aa  470  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  52.32 
 
 		 390 aa  397  1e-109  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  53.5 
 
 		 400 aa  391  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  50 
 
 		 422 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  50.25 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  50.25 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  50.25 
 
 		 402 aa  387  1e-106  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  50 
 
 		 422 aa  383  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  50 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  50 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  50 
 
 		 422 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  53.42 
 
 		 380 aa  385  1e-105  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  50.25 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  50.25 
 
 		 403 aa  379  1e-104  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  50.25 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  50.25 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  50.25 
 
 		 403 aa  377  1e-103  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  50.25 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  50.25 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  50.25 
 
 		 403 aa  378  1e-103  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  50 
 
 		 403 aa  372  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  50.75 
 
 		 402 aa  367  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  49.75 
 
 		 402 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  50.25 
 
 		 425 aa  357  2.9999999999999997e-97  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  52.08 
 
 		 361 aa  355  7.999999999999999e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  49.5 
 
 		 402 aa  349  6e-95  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  44.67 
 
 		 403 aa  297  2e-79  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  43.73 
 
 		 395 aa  286  7e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  42.2 
 
 		 395 aa  275  9e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  42.27 
 
 		 391 aa  272  9e-72  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  42.27 
 
 		 391 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  42.53 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  42.39 
 
 		 391 aa  270  2.9999999999999997e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  42.53 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  42.01 
 
 		 391 aa  270  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  42.27 
 
 		 391 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  41.62 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  39.85 
 
 		 395 aa  268  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  40.65 
 
 		 400 aa  262  8e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  42.04 
 
 		 405 aa  260  3e-68  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  42.74 
 
 		 395 aa  259  8e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  42.31 
 
 		 395 aa  257  3e-67  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  39.63 
 
 		 399 aa  256  6e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  40.35 
 
 		 399 aa  249  8e-65  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  34.8 
 
 		 425 aa  241  2e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  39.54 
 
 		 388 aa  237  3e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  34.16 
 
 		 424 aa  233  5e-60  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  34.31 
 
 		 414 aa  229  6e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  34.21 
 
 		 418 aa  228  2e-58  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  34.21 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  34.31 
 
 		 418 aa  227  2e-58  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  33.17 
 
 		 424 aa  226  6e-58  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  33.99 
 
 		 418 aa  225  9e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  34.13 
 
 		 418 aa  222  9e-57  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  34.13 
 
 		 418 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  34.13 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  34.13 
 
 		 418 aa  222  9.999999999999999e-57  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  34.55 
 
 		 416 aa  219  6e-56  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  32.92 
 
 		 467 aa  218  1e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  32.69 
 
 		 417 aa  217  2e-55  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  32.67 
 
 		 417 aa  218  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  33.81 
 
 		 418 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  33.97 
 
 		 418 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  33.42 
 
 		 418 aa  213  7e-54  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  33.09 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  31.54 
 
 		 414 aa  210  4e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  32.09 
 
 		 409 aa  207  2e-52  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06320  hypothetical protein  39.18 
 
 		 385 aa  207  3e-52  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  32.36 
 
 		 418 aa  206  8e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  31.3 
 
 		 414 aa  206  9e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  31.85 
 
 		 414 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  38.4 
 
 		 385 aa  204  2e-51  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  33.09 
 
 		 418 aa  204  2e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  31.3 
 
 		 412 aa  203  5e-51  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  33.33 
 
 		 419 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1723  tryptophan/tyrosine permease family protein  36.53 
 
 		 424 aa  191  2e-47  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0448  tyrosine-specific transport protein  36.53 
 
 		 426 aa  191  2.9999999999999997e-47  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  29.95 
 
 		 414 aa  189  9e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1337  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  37.9 
 
 		 384 aa  187  2e-46  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  32.17 
 
 		 396 aa  186  7e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  34.88 
 
 		 398 aa  185  1.0000000000000001e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  35.15 
 
 		 398 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  31.92 
 
 		 396 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  29.95 
 
 		 414 aa  184  3e-45  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  29.69 
 
 		 414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  29.69 
 
 		 414 aa  183  4.0000000000000006e-45  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  29.17 
 
 		 414 aa  183  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  29.69 
 
 		 414 aa  182  6e-45  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  29.69 
 
 		 414 aa  182  6e-45  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0411186 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>