130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0709 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  783    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  99.25 
 
 
398 aa  779    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  57.03 
 
 
396 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  57.03 
 
 
396 aa  402  1e-111  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0448  tyrosine-specific transport protein  48.22 
 
 
426 aa  324  2e-87  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1723  tryptophan/tyrosine permease family protein  48.22 
 
 
424 aa  323  4e-87  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  35.61 
 
 
422 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  35.61 
 
 
422 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  35.61 
 
 
422 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  35.34 
 
 
395 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  35.85 
 
 
422 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  35.08 
 
 
395 aa  217  2.9999999999999998e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  35.37 
 
 
422 aa  216  5e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  35.08 
 
 
395 aa  216  5.9999999999999996e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  35.4 
 
 
395 aa  213  7e-54  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  35.14 
 
 
395 aa  210  4e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  35.13 
 
 
403 aa  209  6e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  34.37 
 
 
395 aa  209  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  35.34 
 
 
400 aa  209  9e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  34.88 
 
 
395 aa  208  1e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  34.88 
 
 
395 aa  206  5e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  35.38 
 
 
403 aa  206  6e-52  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  35.38 
 
 
403 aa  206  6e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  34.55 
 
 
395 aa  205  9e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  35.13 
 
 
403 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  35.13 
 
 
403 aa  205  1e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  35.13 
 
 
403 aa  205  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  35.13 
 
 
403 aa  205  1e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  35.38 
 
 
403 aa  205  1e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  35.13 
 
 
403 aa  205  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  35.84 
 
 
402 aa  204  2e-51  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  34.2 
 
 
400 aa  204  3e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  36.84 
 
 
402 aa  202  6e-51  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  35.15 
 
 
400 aa  199  7e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  33.79 
 
 
390 aa  196  5.000000000000001e-49  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  37.35 
 
 
425 aa  194  2e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  33 
 
 
400 aa  194  3e-48  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  34.41 
 
 
402 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  34.41 
 
 
402 aa  193  4e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  34.41 
 
 
402 aa  193  4e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  35.07 
 
 
403 aa  192  8e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0204  Mtr/TnaB/TyrO permease family protein  34.86 
 
 
398 aa  189  7e-47  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  34.07 
 
 
388 aa  185  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  32.08 
 
 
399 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  33.33 
 
 
380 aa  182  6e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  32.11 
 
 
425 aa  182  1e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  35.19 
 
 
395 aa  181  2e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  33.75 
 
 
391 aa  179  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  32.08 
 
 
392 aa  177  3e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  34.68 
 
 
395 aa  176  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  31.35 
 
 
418 aa  176  7e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  35.07 
 
 
402 aa  176  8e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  34.78 
 
 
391 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  34.59 
 
 
395 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  34.78 
 
 
391 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  34.53 
 
 
391 aa  173  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  30.23 
 
 
418 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  34.19 
 
 
391 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  33.42 
 
 
391 aa  171  2e-41  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  31.25 
 
 
395 aa  171  2e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0205  Mtr/TnaB/TyrO permease family protein  32.67 
 
 
395 aa  171  3e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.702392  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  32.67 
 
 
400 aa  170  3e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  33.16 
 
 
391 aa  170  5e-41  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  29.2 
 
 
418 aa  170  5e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  30 
 
 
414 aa  169  6e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  30.6 
 
 
414 aa  169  7e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  30.6 
 
 
414 aa  169  8e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  30.94 
 
 
399 aa  167  2e-40  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  28.61 
 
 
418 aa  167  2e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  29.53 
 
 
418 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  36.16 
 
 
405 aa  166  9e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  28.87 
 
 
414 aa  166  1.0000000000000001e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  32.92 
 
 
395 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  29.72 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  29.72 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  29.72 
 
 
418 aa  164  2.0000000000000002e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  29.49 
 
 
418 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  29.49 
 
 
418 aa  164  3e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  29.49 
 
 
418 aa  164  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  29.72 
 
 
418 aa  163  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  29.97 
 
 
417 aa  162  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  30.58 
 
 
417 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  30.83 
 
 
467 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  30.35 
 
 
412 aa  162  1e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  31.17 
 
 
416 aa  161  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  29.72 
 
 
418 aa  160  2e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06320  hypothetical protein  33.07 
 
 
385 aa  161  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  32.96 
 
 
361 aa  160  4e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  33.79 
 
 
385 aa  159  1e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  29.8 
 
 
418 aa  157  3e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1337  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  31.61 
 
 
384 aa  154  2.9999999999999998e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  28.82 
 
 
424 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  30.59 
 
 
419 aa  145  9e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  30.63 
 
 
415 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  27.65 
 
 
409 aa  144  2e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  30.38 
 
 
415 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  30.38 
 
 
415 aa  144  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  30.38 
 
 
415 aa  144  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  30.38 
 
 
415 aa  144  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  30.38 
 
 
415 aa  144  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>