140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ddes_1135 on replicon NC_011883
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  100 
 
 		 409 aa  812    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  63.93 
 
 		 419 aa  525  1e-148  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  45.91 
 
 		 414 aa  368  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  45.91 
 
 		 414 aa  367  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  46.44 
 
 		 467 aa  362  6e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  44.91 
 
 		 414 aa  361  2e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  46.19 
 
 		 417 aa  359  5e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  45.41 
 
 		 412 aa  358  9.999999999999999e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  45.27 
 
 		 418 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  45.77 
 
 		 418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  45.77 
 
 		 418 aa  352  7e-96  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  45.77 
 
 		 418 aa  352  7e-96  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  46.27 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  46.27 
 
 		 418 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  46.27 
 
 		 418 aa  351  2e-95  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  46.27 
 
 		 418 aa  350  4e-95  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  45.02 
 
 		 418 aa  348  9e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  45.27 
 
 		 414 aa  346  5e-94  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  43.03 
 
 		 425 aa  345  8.999999999999999e-94  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  45.54 
 
 		 417 aa  345  1e-93  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  45.41 
 
 		 418 aa  343  4e-93  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  46.27 
 
 		 418 aa  342  5e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  45.52 
 
 		 418 aa  342  5.999999999999999e-93  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  45.77 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  42.01 
 
 		 424 aa  330  2e-89  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  41.77 
 
 		 424 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  41.93 
 
 		 416 aa  321  9.999999999999999e-87  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  43.42 
 
 		 418 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  43.15 
 
 		 414 aa  317  3e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  43.41 
 
 		 414 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  42.89 
 
 		 414 aa  315  9e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  42.89 
 
 		 414 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  42.89 
 
 		 414 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  42.89 
 
 		 414 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  42.89 
 
 		 414 aa  314  9.999999999999999e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  42.89 
 
 		 414 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  42.89 
 
 		 414 aa  314  9.999999999999999e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0411186 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  42.89 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  42.89 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  42.89 
 
 		 414 aa  314  1.9999999999999998e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813995 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  42.89 
 
 		 414 aa  312  6.999999999999999e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  42.64 
 
 		 414 aa  311  9e-84  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  42.38 
 
 		 414 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  39.8 
 
 		 415 aa  273  5.000000000000001e-72  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  39.85 
 
 		 415 aa  272  7e-72  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  39.85 
 
 		 415 aa  272  7e-72  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  39.85 
 
 		 415 aa  272  7e-72  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  39.85 
 
 		 415 aa  272  7e-72  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  39.8 
 
 		 415 aa  271  1e-71  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  39.55 
 
 		 415 aa  272  1e-71  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  39.6 
 
 		 413 aa  265  8e-70  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  38.37 
 
 		 411 aa  249  7e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  36.52 
 
 		 409 aa  247  2e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  31.42 
 
 		 400 aa  209  6e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  32.09 
 
 		 400 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  35.2 
 
 		 422 aa  205  9e-52  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  34.95 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  34.95 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  34.95 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  34.95 
 
 		 422 aa  204  3e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  35 
 
 		 403 aa  202  7e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  35 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  35 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  35 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  35 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  35 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  35 
 
 		 403 aa  201  9.999999999999999e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  35 
 
 		 403 aa  202  9.999999999999999e-51  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  35 
 
 		 403 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  34.81 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  34.81 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  34.81 
 
 		 402 aa  198  2.0000000000000003e-49  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  34.67 
 
 		 402 aa  197  3e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  34.72 
 
 		 402 aa  189  1e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  34.44 
 
 		 395 aa  187  4e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  33.67 
 
 		 395 aa  182  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  33.67 
 
 		 395 aa  181  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  32.32 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  32.32 
 
 		 395 aa  180  4e-44  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  33.93 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  32.32 
 
 		 395 aa  180  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  31.62 
 
 		 400 aa  179  5.999999999999999e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  32.07 
 
 		 395 aa  178  1e-43  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  32.07 
 
 		 395 aa  177  2e-43  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  31.12 
 
 		 400 aa  173  5e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  33.59 
 
 		 402 aa  170  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  29.65 
 
 		 403 aa  168  1e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  29.35 
 
 		 390 aa  166  5.9999999999999996e-40  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  31.13 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  32.41 
 
 		 425 aa  162  1e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  31.03 
 
 		 400 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  30.43 
 
 		 399 aa  156  7e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  31.3 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  29.3 
 
 		 391 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  29.31 
 
 		 380 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  30.95 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  30 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  28.57 
 
 		 392 aa  144  4e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06320  hypothetical protein  29.49 
 
 		 385 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  28.86 
 
 		 405 aa  138  2e-31  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>