129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1276 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  99.5 
 
 		 403 aa  788    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  100 
 
 		 403 aa  790    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  99.5 
 
 		 403 aa  788    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  88.59 
 
 		 422 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  88.59 
 
 		 422 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  88.59 
 
 		 422 aa  703    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  84.12 
 
 		 425 aa  637    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  88.59 
 
 		 422 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  99.75 
 
 		 403 aa  788    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  99.5 
 
 		 403 aa  788    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  99.5 
 
 		 403 aa  788    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  99.5 
 
 		 403 aa  788    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  100 
 
 		 403 aa  790    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  99.26 
 
 		 403 aa  783    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  88.59 
 
 		 422 aa  706    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  79.16 
 
 		 402 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  79.16 
 
 		 402 aa  615  1e-175  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  79.16 
 
 		 402 aa  615  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  80.65 
 
 		 402 aa  597  1e-169  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  72.89 
 
 		 402 aa  575  1.0000000000000001e-163  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  72.64 
 
 		 402 aa  570  1e-161  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  52.49 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  51.99 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  50.25 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  49.75 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  49.62 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  49.62 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  48.74 
 
 		 395 aa  371  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  48.74 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  50 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  50.25 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  50.25 
 
 		 395 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  49.49 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  48.51 
 
 		 400 aa  363  3e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  45.23 
 
 		 390 aa  347  3e-94  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  47.92 
 
 		 380 aa  345  1e-93  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  50.37 
 
 		 403 aa  339  5e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  45.75 
 
 		 361 aa  315  9e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  47.89 
 
 		 405 aa  311  1e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  41.21 
 
 		 395 aa  272  1e-71  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  40.7 
 
 		 395 aa  265  2e-69  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  40.97 
 
 		 391 aa  259  4e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  40.97 
 
 		 391 aa  259  7e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  41.46 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  40.35 
 
 		 400 aa  258  1e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  40.97 
 
 		 391 aa  258  2e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  41.41 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  41.22 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  37.32 
 
 		 418 aa  256  4e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  38.42 
 
 		 392 aa  256  7e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  40.97 
 
 		 391 aa  255  9e-67  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  42.22 
 
 		 399 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  39.19 
 
 		 391 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  37.5 
 
 		 418 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  37.5 
 
 		 418 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  37.5 
 
 		 418 aa  253  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  42.64 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  42.11 
 
 		 395 aa  251  1e-65  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  37.5 
 
 		 418 aa  251  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  36.59 
 
 		 414 aa  249  7e-65  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  40.05 
 
 		 399 aa  248  1e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  36.59 
 
 		 418 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  36.67 
 
 		 418 aa  248  2e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  36.67 
 
 		 418 aa  247  2e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  36.95 
 
 		 417 aa  247  3e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  37.25 
 
 		 418 aa  245  8e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  37.99 
 
 		 416 aa  244  3e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  36.01 
 
 		 418 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  36.07 
 
 		 418 aa  240  4e-62  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  39.49 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  34.99 
 
 		 414 aa  238  1e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  34.99 
 
 		 414 aa  236  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  35.29 
 
 		 425 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  35.82 
 
 		 418 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  35.48 
 
 		 414 aa  233  5e-60  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  37.09 
 
 		 418 aa  233  6e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  34.74 
 
 		 412 aa  232  1e-59  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  35.09 
 
 		 424 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  34.5 
 
 		 467 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  35.57 
 
 		 418 aa  226  6e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  34.25 
 
 		 417 aa  225  1e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  34.59 
 
 		 424 aa  224  3e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  32.81 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  35 
 
 		 409 aa  203  4e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  33.68 
 
 		 414 aa  202  7e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  32.03 
 
 		 414 aa  202  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  32.55 
 
 		 414 aa  201  9.999999999999999e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  32.29 
 
 		 414 aa  200  3e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  33.09 
 
 		 415 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  32.55 
 
 		 414 aa  199  5e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  33.09 
 
 		 415 aa  200  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  33.09 
 
 		 415 aa  200  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  32.29 
 
 		 414 aa  199  5e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  33.09 
 
 		 415 aa  200  5e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  32.29 
 
 		 414 aa  199  6e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  32.29 
 
 		 414 aa  199  6e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0411186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  32.29 
 
 		 414 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  32.29 
 
 		 414 aa  199  7e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  32.29 
 
 		 414 aa  199  7.999999999999999e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  33.09 
 
 		 415 aa  198  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.406172 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>