150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_2939 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  100 
 
 
395 aa  764    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  72.82 
 
 
391 aa  554  1e-156  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  72.63 
 
 
392 aa  549  1e-155  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  74.18 
 
 
395 aa  535  1e-151  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  72.41 
 
 
395 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  74.1 
 
 
391 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  73.59 
 
 
391 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  73.85 
 
 
391 aa  527  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  69.87 
 
 
395 aa  525  1e-148  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  72.93 
 
 
399 aa  521  1e-147  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  72.05 
 
 
391 aa  521  1e-147  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  72.56 
 
 
391 aa  523  1e-147  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  72.05 
 
 
391 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  74.68 
 
 
395 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  68 
 
 
400 aa  504  1e-141  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  65.5 
 
 
399 aa  486  1e-136  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  42.31 
 
 
400 aa  300  3e-80  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  42.31 
 
 
400 aa  285  7e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  42.61 
 
 
422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  42.61 
 
 
422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  42.61 
 
 
422 aa  285  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  42.86 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  42.61 
 
 
422 aa  284  2.0000000000000002e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  42.39 
 
 
403 aa  282  6.000000000000001e-75  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  41.41 
 
 
390 aa  282  6.000000000000001e-75  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  42.64 
 
 
403 aa  281  2e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  42.64 
 
 
403 aa  281  2e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  42.39 
 
 
403 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  42.39 
 
 
403 aa  280  4e-74  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  42.39 
 
 
403 aa  280  4e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  42.39 
 
 
403 aa  280  4e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  42.39 
 
 
403 aa  280  4e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  42.39 
 
 
403 aa  280  5e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  43.15 
 
 
395 aa  278  1e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  41.77 
 
 
395 aa  278  1e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  42.89 
 
 
395 aa  276  3e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  42.67 
 
 
400 aa  276  3e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  42.89 
 
 
395 aa  276  5e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  42.07 
 
 
402 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  42.07 
 
 
402 aa  275  9e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  42.07 
 
 
402 aa  275  9e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  42.89 
 
 
395 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  42.68 
 
 
395 aa  273  3e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  42.17 
 
 
395 aa  273  3e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  41.67 
 
 
395 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  41.92 
 
 
395 aa  271  1e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  43.26 
 
 
400 aa  270  4e-71  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  44 
 
 
402 aa  268  1e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  42.46 
 
 
425 aa  267  2.9999999999999995e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  41.38 
 
 
380 aa  265  1e-69  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  41.56 
 
 
402 aa  265  1e-69  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  42.07 
 
 
402 aa  262  1e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  40.78 
 
 
361 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  38.78 
 
 
388 aa  229  7e-59  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  37.69 
 
 
385 aa  215  9e-55  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06320  hypothetical protein  37.84 
 
 
385 aa  215  9.999999999999999e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  35.2 
 
 
418 aa  211  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  33.16 
 
 
418 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  34.78 
 
 
418 aa  203  5e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1337  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  36.41 
 
 
384 aa  202  7e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  32.91 
 
 
418 aa  202  9e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  32.91 
 
 
418 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  32.91 
 
 
418 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  32.91 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  32.91 
 
 
418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  32.4 
 
 
414 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  32.65 
 
 
418 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  33.76 
 
 
418 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  32.17 
 
 
418 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  33.76 
 
 
418 aa  195  9e-49  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  34.27 
 
 
418 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  37.24 
 
 
403 aa  194  2e-48  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  32.03 
 
 
414 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  32.03 
 
 
414 aa  193  5e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  32.48 
 
 
418 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  31.75 
 
 
417 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  33.08 
 
 
396 aa  190  4e-47  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  31.59 
 
 
467 aa  190  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  33.6 
 
 
417 aa  189  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  33 
 
 
396 aa  189  1e-46  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  31.28 
 
 
425 aa  188  1e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  31.9 
 
 
414 aa  189  1e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  31.51 
 
 
412 aa  186  7e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  35.97 
 
 
405 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  32.16 
 
 
416 aa  179  9e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  32.71 
 
 
419 aa  178  1e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  29.69 
 
 
424 aa  172  6.999999999999999e-42  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  28.39 
 
 
424 aa  169  1e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  34.68 
 
 
398 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  30.42 
 
 
409 aa  167  2e-40  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  34.43 
 
 
398 aa  167  2e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0448  tyrosine-specific transport protein  35.45 
 
 
426 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1723  tryptophan/tyrosine permease family protein  35.45 
 
 
424 aa  161  2e-38  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  29.54 
 
 
414 aa  160  5e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0157208 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  27.65 
 
 
415 aa  159  9e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  27.39 
 
 
415 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  27.39 
 
 
415 aa  158  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  27.39 
 
 
415 aa  158  2e-37  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  27.39 
 
 
415 aa  158  2e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  27.39 
 
 
415 aa  158  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>