126 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_003573 on replicon NC_013456
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  91.97 
 
 		 361 aa  645    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  100 
 
 		 380 aa  743    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  77.11 
 
 		 400 aa  542  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  53.42 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  55.79 
 
 		 400 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  53.42 
 
 		 400 aa  398  1e-109  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  51.47 
 
 		 390 aa  394  1e-108  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  54.96 
 
 		 395 aa  391  1e-108  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  54.96 
 
 		 395 aa  392  1e-108  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  54.16 
 
 		 395 aa  389  1e-107  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  54.3 
 
 		 395 aa  390  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  54.42 
 
 		 395 aa  385  1e-106  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  54.3 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  54.03 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  53.49 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  53.49 
 
 		 395 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  47.66 
 
 		 403 aa  355  8.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  47.92 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  47.92 
 
 		 403 aa  353  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  47.66 
 
 		 403 aa  352  4e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  47.66 
 
 		 403 aa  352  4e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  47.66 
 
 		 403 aa  352  4e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  47.66 
 
 		 403 aa  352  4e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  47.66 
 
 		 403 aa  352  4e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  47.66 
 
 		 403 aa  352  5.9999999999999994e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  47.14 
 
 		 422 aa  347  3e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  46.88 
 
 		 422 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  46.88 
 
 		 422 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  46.88 
 
 		 422 aa  345  7e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  46.88 
 
 		 422 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  46.88 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  46.88 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  46.88 
 
 		 402 aa  338  9.999999999999999e-92  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  47.52 
 
 		 402 aa  329  6e-89  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  48.04 
 
 		 402 aa  326  5e-88  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  47.4 
 
 		 402 aa  324  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  48.18 
 
 		 425 aa  322  9.999999999999999e-87  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  42.3 
 
 		 403 aa  269  7e-71  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  39.53 
 
 		 395 aa  261  2e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  39.62 
 
 		 392 aa  261  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  38.8 
 
 		 391 aa  256  5e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  39.62 
 
 		 391 aa  249  5e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  39.34 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  39.08 
 
 		 400 aa  247  2e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  39.34 
 
 		 391 aa  247  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  41.24 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  40.05 
 
 		 399 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  39.89 
 
 		 395 aa  245  8e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  37.7 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  42.93 
 
 		 405 aa  241  2e-62  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  37.43 
 
 		 391 aa  240  2.9999999999999997e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  37.43 
 
 		 395 aa  239  5e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  37.16 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  37.84 
 
 		 399 aa  239  6.999999999999999e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  37.7 
 
 		 395 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  37.47 
 
 		 388 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  32.29 
 
 		 414 aa  212  7.999999999999999e-54  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  32.66 
 
 		 417 aa  211  2e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  32.23 
 
 		 418 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  31.71 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  31.71 
 
 		 418 aa  209  4e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  31.71 
 
 		 418 aa  210  4e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  32.23 
 
 		 418 aa  209  5e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  31.97 
 
 		 418 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  32.65 
 
 		 418 aa  209  9e-53  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  31.98 
 
 		 418 aa  208  1e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  31.36 
 
 		 425 aa  207  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  31.46 
 
 		 418 aa  205  1e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  30.39 
 
 		 414 aa  199  5e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  33.59 
 
 		 418 aa  199  9e-50  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  32.81 
 
 		 418 aa  196  6e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  32.97 
 
 		 418 aa  192  1e-47  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  31.47 
 
 		 418 aa  191  2e-47  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  33.33 
 
 		 416 aa  190  4e-47  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  31.27 
 
 		 418 aa  189  1e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  31.13 
 
 		 412 aa  188  2e-46  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  31.13 
 
 		 414 aa  188  2e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  31.13 
 
 		 414 aa  186  8e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06320  hypothetical protein  36.66 
 
 		 385 aa  182  6e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  30.39 
 
 		 424 aa  182  9.000000000000001e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  30.49 
 
 		 467 aa  180  4e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  34.92 
 
 		 396 aa  179  7e-44  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  34.92 
 
 		 396 aa  179  9e-44  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  30.23 
 
 		 417 aa  178  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  37.33 
 
 		 385 aa  177  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  30.23 
 
 		 424 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1337  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  33.78 
 
 		 384 aa  171  2e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0709  hypothetical protein  34.15 
 
 		 398 aa  170  4e-41  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0691  hypothetical protein  33.88 
 
 		 398 aa  169  5e-41  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  27.53 
 
 		 414 aa  169  8e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  29.02 
 
 		 419 aa  168  1e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  28.28 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  28.02 
 
 		 414 aa  166  5.9999999999999996e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  27.76 
 
 		 414 aa  165  1.0000000000000001e-39  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  28.28 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  28.28 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  27.76 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  28.28 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  28.28 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813995 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  28.28 
 
 		 414 aa  163  4.0000000000000004e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>