127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_02530 on replicon NC_009783
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  91.97 
 
 		 380 aa  645    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  707    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  76.45 
 
 		 400 aa  514  1e-144  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  51.52 
 
 		 400 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  53.74 
 
 		 400 aa  371  1e-102  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  53.95 
 
 		 395 aa  368  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  54.24 
 
 		 395 aa  369  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  53.95 
 
 		 395 aa  368  1e-101  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  52.08 
 
 		 400 aa  369  1e-101  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  51.41 
 
 		 390 aa  371  1e-101  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  52.41 
 
 		 395 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  53.39 
 
 		 395 aa  363  3e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  52.12 
 
 		 395 aa  358  8e-98  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  51.84 
 
 		 395 aa  355  8.999999999999999e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  51.84 
 
 		 395 aa  354  1e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  51.56 
 
 		 395 aa  352  4e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  45.75 
 
 		 403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  45.75 
 
 		 403 aa  324  1e-87  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  45.75 
 
 		 403 aa  324  1e-87  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  45.75 
 
 		 403 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  45.75 
 
 		 403 aa  323  2e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  45.75 
 
 		 403 aa  323  2e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  45.75 
 
 		 422 aa  323  2e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  45.75 
 
 		 403 aa  323  2e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  45.75 
 
 		 403 aa  323  2e-87  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  45.75 
 
 		 403 aa  323  2e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  45.75 
 
 		 422 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  45.75 
 
 		 422 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  45.75 
 
 		 422 aa  322  6e-87  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  45.75 
 
 		 422 aa  320  1.9999999999999998e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  44.97 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  44.97 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  44.97 
 
 		 402 aa  313  3.9999999999999997e-84  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  46.37 
 
 		 402 aa  299  4e-80  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  46.37 
 
 		 425 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  44.51 
 
 		 402 aa  293  3e-78  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  44.78 
 
 		 402 aa  290  3e-77  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  39.15 
 
 		 391 aa  251  1e-65  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  39.15 
 
 		 392 aa  250  3e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  40.69 
 
 		 403 aa  248  1e-64  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  40.96 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  38.84 
 
 		 395 aa  242  9e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  39.39 
 
 		 391 aa  236  3e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  38.67 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  39.11 
 
 		 391 aa  235  7e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  39.28 
 
 		 391 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  37.92 
 
 		 391 aa  233  3e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  39.66 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  37.64 
 
 		 391 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  37.36 
 
 		 395 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  37.36 
 
 		 391 aa  230  3e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  37.88 
 
 		 399 aa  228  1e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  38.29 
 
 		 399 aa  223  6e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  37.75 
 
 		 395 aa  220  3e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  41.24 
 
 		 405 aa  212  9e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  38.4 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  32.97 
 
 		 425 aa  204  3e-51  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  33.42 
 
 		 414 aa  202  7e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  33.33 
 
 		 418 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  33.33 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  33.33 
 
 		 418 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  32.8 
 
 		 418 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  32.8 
 
 		 418 aa  199  6e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  32.53 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  32.53 
 
 		 418 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  32.8 
 
 		 418 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  32 
 
 		 418 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  32.18 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  33.97 
 
 		 418 aa  191  1e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  32.33 
 
 		 418 aa  186  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  30.39 
 
 		 414 aa  182  9.000000000000001e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  32.27 
 
 		 418 aa  180  4e-44  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  31.25 
 
 		 418 aa  177  2e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06320  hypothetical protein  38.02 
 
 		 385 aa  175  8e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  33.04 
 
 		 418 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  31.99 
 
 		 416 aa  172  1e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  30.3 
 
 		 424 aa  171  2e-41  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001420  tyrosine-specific transport protein  37.72 
 
 		 385 aa  171  3e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1337  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  35.06 
 
 		 384 aa  169  9e-41  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  29.46 
 
 		 414 aa  169  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  29.46 
 
 		 412 aa  168  1e-40  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  29.46 
 
 		 414 aa  168  1e-40  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  29.95 
 
 		 467 aa  167  2e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  29.67 
 
 		 417 aa  166  5e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  29.28 
 
 		 424 aa  164  3e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  27.62 
 
 		 414 aa  161  2e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  29.08 
 
 		 414 aa  160  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0710  hypothetical protein  33.72 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0692  hypothetical protein  33.72 
 
 		 396 aa  160  4e-38  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  28.8 
 
 		 414 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  28.8 
 
 		 414 aa  159  7e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  28.42 
 
 		 414 aa  159  9e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813995 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  28.42 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  27.87 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  28.42 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  28.42 
 
 		 414 aa  157  2e-37  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0411186 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  28.42 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  28.53 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  28.42 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  28.42 
 
 		 414 aa  157  3e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>