127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_2697 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  100 
 
 
414 aa  822    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  79.71 
 
 
414 aa  676    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  99.03 
 
 
412 aa  807    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  99.52 
 
 
414 aa  816    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  58.99 
 
 
417 aa  486  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  59.36 
 
 
467 aa  484  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  56.02 
 
 
425 aa  469  1.0000000000000001e-131  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  57.66 
 
 
414 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  57.42 
 
 
414 aa  449  1e-125  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  57.66 
 
 
414 aa  450  1e-125  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  57.66 
 
 
414 aa  450  1e-125  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  55.12 
 
 
416 aa  449  1e-125  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  57.66 
 
 
414 aa  449  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  57.66 
 
 
414 aa  449  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  57.66 
 
 
414 aa  449  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  57.66 
 
 
414 aa  449  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  57.42 
 
 
414 aa  447  1.0000000000000001e-124  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.813995 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  56.2 
 
 
414 aa  443  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  56.2 
 
 
414 aa  442  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  56.45 
 
 
414 aa  438  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  56.45 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  53.61 
 
 
418 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  52.64 
 
 
418 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  52.64 
 
 
418 aa  437  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  52.4 
 
 
418 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  55.96 
 
 
414 aa  437  1e-121  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  55.72 
 
 
414 aa  436  1e-121  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  53.61 
 
 
418 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  53.61 
 
 
418 aa  435  1e-121  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  51.68 
 
 
414 aa  432  1e-120  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  53.61 
 
 
418 aa  434  1e-120  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  53.96 
 
 
418 aa  433  1e-120  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  53.96 
 
 
424 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  55.34 
 
 
418 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  53.22 
 
 
424 aa  429  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  51.82 
 
 
418 aa  429  1e-119  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  53.27 
 
 
418 aa  427  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  55.04 
 
 
418 aa  426  1e-118  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  53.1 
 
 
417 aa  424  1e-117  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  53.4 
 
 
418 aa  414  1e-114  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  51.57 
 
 
418 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  50.49 
 
 
419 aa  391  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  45.91 
 
 
409 aa  368  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  43.69 
 
 
415 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  43.2 
 
 
415 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  43.2 
 
 
415 aa  354  1e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  43.2 
 
 
415 aa  354  1e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  43.2 
 
 
415 aa  354  1e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  43.45 
 
 
415 aa  355  1e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  43.45 
 
 
415 aa  354  2e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  42.96 
 
 
413 aa  348  1e-94  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  44.36 
 
 
409 aa  318  7.999999999999999e-86  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  44.33 
 
 
411 aa  306  4.0000000000000004e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
422 aa  244  1.9999999999999999e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  35.24 
 
 
422 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  35.24 
 
 
422 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  35.24 
 
 
422 aa  244  3e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  35.48 
 
 
422 aa  243  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  35.24 
 
 
403 aa  237  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  36.76 
 
 
402 aa  236  8e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  34.99 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  34.99 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  34.99 
 
 
403 aa  233  4.0000000000000004e-60  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  34.99 
 
 
403 aa  233  5e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
403 aa  233  5e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
403 aa  233  5e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  36.76 
 
 
402 aa  228  1e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  33.09 
 
 
400 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  32.67 
 
 
395 aa  210  3e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  33.33 
 
 
402 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  33.33 
 
 
402 aa  209  5e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  33.33 
 
 
402 aa  209  5e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  32.67 
 
 
395 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  35.73 
 
 
425 aa  209  7e-53  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  32.42 
 
 
395 aa  209  8e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  32.42 
 
 
395 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  32.42 
 
 
395 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  32.49 
 
 
395 aa  202  6e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  31.05 
 
 
400 aa  202  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  33.51 
 
 
395 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  33.16 
 
 
395 aa  196  7e-49  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  30.34 
 
 
400 aa  194  2e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  33.25 
 
 
395 aa  193  5e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  33.68 
 
 
390 aa  192  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  31.65 
 
 
395 aa  189  5.999999999999999e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  32.92 
 
 
402 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  30.62 
 
 
400 aa  182  1e-44  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  32.33 
 
 
403 aa  180  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  34.11 
 
 
388 aa  179  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  33.07 
 
 
400 aa  178  2e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  31.13 
 
 
380 aa  176  8e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  30.79 
 
 
399 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  31.02 
 
 
392 aa  172  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  30.43 
 
 
391 aa  171  3e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  32.01 
 
 
399 aa  164  3e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  32.03 
 
 
395 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  29.46 
 
 
361 aa  159  1e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  30.56 
 
 
391 aa  159  1e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>