128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_2776 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  99.52 
 
 
414 aa  816    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  79.95 
 
 
414 aa  678    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  99.52 
 
 
412 aa  813    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  100 
 
 
414 aa  822    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  59.23 
 
 
417 aa  489  1e-137  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  59.61 
 
 
467 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  56.27 
 
 
425 aa  473  1e-132  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  57.91 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  57.66 
 
 
414 aa  451  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  55.12 
 
 
416 aa  452  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  57.91 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  57.91 
 
 
414 aa  452  1.0000000000000001e-126  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  57.91 
 
 
414 aa  451  1e-125  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  57.91 
 
 
414 aa  450  1e-125  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  57.91 
 
 
414 aa  451  1e-125  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  57.66 
 
 
414 aa  449  1e-125  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.813995 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  57.91 
 
 
414 aa  451  1e-125  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  52.88 
 
 
418 aa  442  1e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  56.45 
 
 
414 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  56.45 
 
 
414 aa  444  1e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  53.85 
 
 
418 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  52.88 
 
 
418 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  56.69 
 
 
414 aa  440  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  52.64 
 
 
418 aa  440  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  53.85 
 
 
418 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  56.2 
 
 
414 aa  439  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  56.69 
 
 
414 aa  441  9.999999999999999e-123  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  55.96 
 
 
414 aa  438  9.999999999999999e-123  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  53.85 
 
 
418 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  53.85 
 
 
418 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  51.92 
 
 
414 aa  436  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  54.21 
 
 
418 aa  437  1e-121  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  55.58 
 
 
418 aa  433  1e-120  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  52.3 
 
 
418 aa  434  1e-120  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  53.22 
 
 
424 aa  430  1e-119  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  53.96 
 
 
424 aa  431  1e-119  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  53.51 
 
 
418 aa  429  1e-119  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  55.53 
 
 
418 aa  431  1e-119  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  53.35 
 
 
417 aa  428  1e-118  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  53.64 
 
 
418 aa  419  1e-116  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  51.82 
 
 
418 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  50.49 
 
 
419 aa  392  1e-108  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  45.91 
 
 
409 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  43.93 
 
 
415 aa  359  5e-98  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  43.69 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  43.45 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  43.45 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  43.69 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  43.45 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  43.45 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  43.2 
 
 
413 aa  351  2e-95  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  44.12 
 
 
409 aa  318  1e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  44.33 
 
 
411 aa  308  8e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  34.74 
 
 
422 aa  240  2.9999999999999997e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
422 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  35.24 
 
 
403 aa  239  5e-62  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
422 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
422 aa  239  5e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  35.24 
 
 
422 aa  239  5.999999999999999e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  36.76 
 
 
402 aa  237  3e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  34.99 
 
 
403 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  34.99 
 
 
403 aa  236  8e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
403 aa  236  8e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
403 aa  236  8e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  34.99 
 
 
403 aa  236  8e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  34.99 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  34.99 
 
 
403 aa  235  1.0000000000000001e-60  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  36.76 
 
 
402 aa  229  7e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  33.33 
 
 
400 aa  219  6e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  32.67 
 
 
395 aa  211  2e-53  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  33.33 
 
 
402 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  32.67 
 
 
395 aa  209  6e-53  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  33.33 
 
 
402 aa  209  6e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  33.33 
 
 
402 aa  209  6e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  32.42 
 
 
395 aa  209  7e-53  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  35.73 
 
 
425 aa  208  1e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  32.42 
 
 
395 aa  208  2e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  32.42 
 
 
395 aa  207  3e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  31.3 
 
 
400 aa  206  5e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  32.49 
 
 
395 aa  204  2e-51  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  33.51 
 
 
395 aa  200  3e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  33.16 
 
 
395 aa  199  7e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  32.91 
 
 
395 aa  196  9e-49  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  30.34 
 
 
400 aa  195  1e-48  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  33.95 
 
 
390 aa  194  2e-48  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  31.65 
 
 
395 aa  191  2e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  32.68 
 
 
402 aa  188  2e-46  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  31.11 
 
 
400 aa  186  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  34.03 
 
 
388 aa  181  2e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  32.33 
 
 
403 aa  180  4e-44  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  33.07 
 
 
400 aa  180  4e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  30.36 
 
 
380 aa  178  2e-43  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  30.79 
 
 
399 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  31.02 
 
 
392 aa  173  5e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  30.43 
 
 
391 aa  171  2e-41  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  32.01 
 
 
399 aa  165  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  30.81 
 
 
391 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  30.73 
 
 
395 aa  161  3e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  32.03 
 
 
395 aa  160  3e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>