130 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_3276 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  87.06 
 
 		 402 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  100 
 
 		 402 aa  787    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  87.06 
 
 		 402 aa  686    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  87.06 
 
 		 402 aa  686    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  78.91 
 
 		 422 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  78.91 
 
 		 422 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  78.91 
 
 		 422 aa  627  1e-179  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  80.65 
 
 		 403 aa  625  1e-178  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  78.91 
 
 		 422 aa  627  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  78.41 
 
 		 422 aa  624  1e-178  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  80.65 
 
 		 403 aa  625  1e-178  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  80.15 
 
 		 403 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  80.15 
 
 		 403 aa  623  1e-177  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  80.4 
 
 		 403 aa  624  1e-177  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  80.15 
 
 		 403 aa  623  1e-177  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  80.15 
 
 		 403 aa  623  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  80.15 
 
 		 403 aa  623  1e-177  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  79.9 
 
 		 403 aa  618  1e-176  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  75.43 
 
 		 425 aa  571  1.0000000000000001e-162  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  73.32 
 
 		 402 aa  567  1e-160  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  72.07 
 
 		 402 aa  556  1e-157  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  50.75 
 
 		 400 aa  398  9.999999999999999e-111  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  51.74 
 
 		 400 aa  390  1e-107  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  51.14 
 
 		 395 aa  379  1e-104  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  51.14 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  50.63 
 
 		 395 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  50.75 
 
 		 400 aa  379  1e-104  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  50.89 
 
 		 395 aa  375  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  50.63 
 
 		 395 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  50.89 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  50.63 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  50.89 
 
 		 395 aa  373  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  50.63 
 
 		 395 aa  372  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  49.25 
 
 		 400 aa  360  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  45.57 
 
 		 390 aa  342  1e-92  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  47.4 
 
 		 380 aa  339  5.9999999999999996e-92  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  49 
 
 		 403 aa  333  3e-90  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  46.58 
 
 		 361 aa  313  3.9999999999999997e-84  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1166  tyrosine-specific transport protein  48.88 
 
 		 405 aa  311  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  40.81 
 
 		 395 aa  258  1e-67  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  40.56 
 
 		 391 aa  256  4e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  38.97 
 
 		 418 aa  255  8e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  37.32 
 
 		 414 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  37.59 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  37.59 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  40.71 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  37.59 
 
 		 418 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  37.75 
 
 		 418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  37.59 
 
 		 418 aa  253  4.0000000000000004e-66  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  37.32 
 
 		 418 aa  253  5.000000000000001e-66  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  40.8 
 
 		 400 aa  253  6e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  37.75 
 
 		 418 aa  252  7e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  36.67 
 
 		 418 aa  252  8.000000000000001e-66  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2939  tyrosine-specific transport protein, putative  44 
 
 		 395 aa  251  2e-65  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.0322125 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1074  tyrosine-specific transport protein, putative  40.81 
 
 		 395 aa  246  6e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  37.16 
 
 		 417 aa  246  6.999999999999999e-64  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  39.04 
 
 		 395 aa  245  9.999999999999999e-64  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  36.01 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  39.54 
 
 		 391 aa  243  3e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  39.79 
 
 		 399 aa  244  3e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0948  aromatic amino acid permease  40.82 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3026  aromatic amino acid permease  40.56 
 
 		 391 aa  243  5e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0912  aromatic amino acid permease  40.56 
 
 		 391 aa  242  7.999999999999999e-63  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.231999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0897  aromatic amino acid permease  39.54 
 
 		 391 aa  242  9e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  36.07 
 
 		 418 aa  242  9e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  39.29 
 
 		 391 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  36.59 
 
 		 425 aa  239  5.999999999999999e-62  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  36.07 
 
 		 418 aa  236  4e-61  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0683  aromatic amino acid permease  40.4 
 
 		 399 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.205009  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  38.35 
 
 		 418 aa  236  5.0000000000000005e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0916  aromatic amino acid permease  40.4 
 
 		 395 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  36.07 
 
 		 418 aa  233  5e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  36.92 
 
 		 416 aa  230  3e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  33.85 
 
 		 467 aa  224  1e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  34.59 
 
 		 424 aa  224  2e-57  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  33.85 
 
 		 417 aa  224  2e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  34.59 
 
 		 424 aa  223  4e-57  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  34.96 
 
 		 414 aa  220  3.9999999999999997e-56  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  33.33 
 
 		 414 aa  219  7.999999999999999e-56  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  33.07 
 
 		 414 aa  218  1e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  32.92 
 
 		 414 aa  216  4e-55  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  32.81 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  32.55 
 
 		 414 aa  215  9.999999999999999e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  33.07 
 
 		 414 aa  214  1.9999999999999998e-54  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  38.11 
 
 		 388 aa  214  1.9999999999999998e-54  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  32.68 
 
 		 414 aa  212  7.999999999999999e-54  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  33.25 
 
 		 414 aa  212  1e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  32.29 
 
 		 414 aa  211  3e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  32.03 
 
 		 414 aa  210  3e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813995 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  32.03 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  32.03 
 
 		 414 aa  209  5e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  31.77 
 
 		 414 aa  209  9e-53  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  31.77 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  31.77 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  31.77 
 
 		 414 aa  208  1e-52  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  31.51 
 
 		 414 aa  206  6e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  32.43 
 
 		 412 aa  206  7e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  33.59 
 
 		 409 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  33.92 
 
 		 419 aa  194  2e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  30.56 
 
 		 415 aa  192  7e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>