140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E4213 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_03593  tryptophan transporter of low affinity  99.52 
 
 		 415 aa  812    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4258  aromatic amino acid transporter  99.04 
 
 		 415 aa  810    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4213  tryptophan permease TnaB  100 
 
 		 413 aa  816    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03537  hypothetical protein  99.52 
 
 		 415 aa  812    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5140  tryptophan permease TnaB  99.04 
 
 		 415 aa  807    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.406172 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3923  tryptophan permease TnaB  99.52 
 
 		 415 aa  812    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4218  tryptophan permease TnaB  99.52 
 
 		 415 aa  812    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4285  tryptophan permease TnaB  98.8 
 
 		 415 aa  808    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0991  tryptophan permease  51.46 
 
 		 424 aa  404  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3634  tryptophan permease  52.58 
 
 		 414 aa  400  9.999999999999999e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0755  tryptophan permease  52.67 
 
 		 424 aa  401  9.999999999999999e-111  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3535  tryptophan permease  52.06 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3572  tryptophan permease  52.06 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3466  tryptophan permease  52.32 
 
 		 414 aa  395  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03028  tryptophan transporter of high affinity  52.58 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0544  aromatic amino acid transporter  52.84 
 
 		 414 aa  395  1e-108  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02979  hypothetical protein  52.58 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4480  tryptophan permease  52.32 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3598  tryptophan permease  52.06 
 
 		 414 aa  394  1e-108  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0157208 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3353  tryptophan permease  52.32 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3643  tryptophan permease  52.32 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3611  tryptophan permease  52.32 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0537  tryptophan permease  52.32 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0411186 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3457  tryptophan permease  52.32 
 
 		 414 aa  392  1e-108  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.813995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3466  tryptophan permease  51.8 
 
 		 414 aa  390  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71710  tryptophan permease  48.3 
 
 		 417 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.268423  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6222  tryptophan permease  48.31 
 
 		 467 aa  382  1e-105  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3787  aromatic amino acid transporter  45.67 
 
 		 418 aa  360  3e-98  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3987  aromatic amino acid transporter  46.19 
 
 		 418 aa  359  5e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3860  aromatic amino acid transporter  45.67 
 
 		 418 aa  358  8e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4601  tryptophan-specific transport protein  45.7 
 
 		 414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3513  aromatic amino acid transport protein  47.32 
 
 		 417 aa  353  2.9999999999999997e-96  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3778  aromatic amino acid transporter  46.93 
 
 		 418 aa  353  4e-96  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0158  aromatic amino acid transporter  46.39 
 
 		 418 aa  352  5.9999999999999994e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0182  aromatic amino acid transporter  46.38 
 
 		 418 aa  352  8e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4307  aromatic amino acid transporter  46.39 
 
 		 418 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.257824 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4108  aromatic amino acid transporter  46.39 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4176  aromatic amino acid transporter  46.39 
 
 		 418 aa  351  1e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2776  aromatic amino acid transporter  43.2 
 
 		 414 aa  351  2e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3236  aromatic amino acid transporter  44.55 
 
 		 414 aa  349  6e-95  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0262  aromatic amino acid transporter  47.67 
 
 		 418 aa  348  1e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2697  tryptophan-specific transport protein  42.96 
 
 		 414 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1031  aromatic amino acid transporter  43.72 
 
 		 425 aa  344  2e-93  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1511  tryptophan-specific transport protein  42.96 
 
 		 412 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0202  aromatic amino acid transporter  47.83 
 
 		 418 aa  342  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1562  tryptophan-specific transport protein  45.69 
 
 		 416 aa  340  2e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000304843  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3531  aromatic amino acid transporter  46.15 
 
 		 418 aa  335  1e-90  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3995  aromatic amino acid transporter  46.28 
 
 		 418 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3479  aromatic amino acid transport protein  44.25 
 
 		 418 aa  306  3e-82  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.598645 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0097  aromatic amino acid transporter  38.35 
 
 		 419 aa  288  2e-76  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.103921  normal  0.507347 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1135  aromatic amino acid transporter  39.6 
 
 		 409 aa  265  8e-70  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.55679  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0800  tryptophan permease  40.39 
 
 		 409 aa  257  2e-67  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.121788  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1118  tryptophan-specific transport protein  39.08 
 
 		 411 aa  245  9.999999999999999e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2092  tyrosine-specific transport protein  33.01 
 
 		 422 aa  195  1e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0842051  hitchhiker  0.0000739999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2774  tyrosine-specific transport protein  33.25 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1318  tyrosine-specific transport protein  33.25 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2853  aromatic amino acid transporter  33.25 
 
 		 402 aa  195  1e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1307  tyrosine-specific transport protein  32.44 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000107929 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1184  tyrosine-specific transport protein  32.44 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.135204  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2099  tyrosine-specific transport protein  32.44 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  1.23753e-19 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2152  tyrosine-specific transport protein  32.44 
 
 		 422 aa  194  2e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000242218 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1034  tyrosine-specific transport protein  33.09 
 
 		 403 aa  193  4e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311327  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0526  aromatic amino acid transporter  30.07 
 
 		 400 aa  191  2e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.560578  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1736  aromatic amino acid transporter  33.09 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000018039  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1276  tyrosine-specific transport protein  33.09 
 
 		 403 aa  191  2.9999999999999997e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00001928  hitchhiker  0.0000367731 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01875  tyrosine transporter  33.09 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0104717  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01864  hypothetical protein  33.09 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00693993  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2005  tyrosine-specific transport protein  33.09 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000529329  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2140  tyrosine-specific transport protein  33.09 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000592969  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2647  tyrosine-specific transport protein  33.09 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.588852  hitchhiker  0.0000000318595 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1729  aromatic amino acid transporter  33.09 
 
 		 403 aa  190  4e-47  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000563721  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1118  aromatic amino acid transporter  33.66 
 
 		 402 aa  189  5.999999999999999e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3197  aromatic amino acid transporter  33.99 
 
 		 402 aa  183  6e-45  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2489  aromatic amino acid transporter  30.34 
 
 		 425 aa  175  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3276  aromatic amino acid transporter  30.56 
 
 		 402 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0511  putative tyrosine-specific transport protein  28.36 
 
 		 400 aa  167  4e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2065  tyrosine-specific transport protein  30.96 
 
 		 395 aa  164  3e-39  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2185  aromatic amino acid transporter  30.15 
 
 		 395 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135373  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3298  tyrosine-specific transport protein  31.06 
 
 		 388 aa  163  5.0000000000000005e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1792  aromatic amino acid transporter  29.9 
 
 		 395 aa  162  1e-38  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2426  aromatic amino acid transporter  28.64 
 
 		 395 aa  161  2e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.392601  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1846  aromatic amino acid transporter  29.65 
 
 		 395 aa  160  6e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.510263 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2186  aromatic amino acid transporter  29.22 
 
 		 395 aa  158  1e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338137  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4434  aromatic amino acid transporter  29.54 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1925  aromatic amino acid transporter  28.89 
 
 		 395 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00166231  normal  0.036415 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2433  aromatic amino acid transporter  28.64 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.485869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2544  aromatic amino acid transporter  28.64 
 
 		 395 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.487399  decreased coverage  0.00912111 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1774  tyrosine-specific transport protein (tyrosine permease)  32.1 
 
 		 390 aa  150  3e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3188  aromatic amino acid permease  29.85 
 
 		 395 aa  150  4e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.497864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0641  aromatic amino acid permease  30.25 
 
 		 399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0712  tyrosine-specific transport protein  30.03 
 
 		 400 aa  146  6e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0574  aromatic amino acid permease  32.11 
 
 		 400 aa  145  1e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3938  aromatic amino acid permease  28.9 
 
 		 392 aa  139  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal  0.472237 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003573  tyrosine-specific transport protein  28.64 
 
 		 380 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3878  aromatic amino acid permease  27.66 
 
 		 391 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00957771  hitchhiker  0.00000285867 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0780  tyrosine-specific transport protein  29.15 
 
 		 403 aa  130  6e-29  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.0000892482  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3389  aromatic amino acid permease  28.91 
 
 		 395 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3588  aromatic amino acid permease  28.91 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.281237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02530  hypothetical protein  27.17 
 
 		 361 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3465  aromatic amino acid permease  28.65 
 
 		 391 aa  126  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.230898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>