More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1831 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1831  acetyl-CoA acetyltransferase  100 
 
 		 403 aa  816    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.76791  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0301  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  58.59 
 
 		 401 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0179307  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05285  acetyl-CoA acetyltransferase  53.54 
 
 		 404 aa  445  1.0000000000000001e-124  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1554  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.71 
 
 		 402 aa  442  1e-123  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2196  beta-ketoadipyl CoA thiolase  60 
 
 		 400 aa  442  1e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0875  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56 
 
 		 404 aa  441  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5925  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.35 
 
 		 400 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2167  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.35 
 
 		 400 aa  436  1e-121  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.34173 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0384  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.816364  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6183  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.08 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2115  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.749553  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0798  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2248  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.68 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0780819  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0635  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.211029  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0542  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0885765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1490  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.159653  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0482  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 400 aa  433  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.807592  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2258  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.68 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.127272  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3565  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00704584  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1812  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 400 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3048  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.56 
 
 		 403 aa  432  1e-120  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.389192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0314  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.82 
 
 		 401 aa  432  1e-120  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1582  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.68 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1484  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.68 
 
 		 401 aa  434  1e-120  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3574  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.887338  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0932  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00352947  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 405 aa  432  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.19346  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3547  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.58 
 
 		 405 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.008459  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0263  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.35 
 
 		 400 aa  431  1e-119  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2126  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.33 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2698  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.09 
 
 		 404 aa  428  1e-119  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.398036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2901  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.33 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00482281  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1359  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.57 
 
 		 401 aa  430  1e-119  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.755858 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02790  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.31 
 
 		 401 aa  428  1e-119  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0219063 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2616  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.82 
 
 		 406 aa  428  1e-119  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.232956 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1370  acetyl-CoA acetyltransferase  54.68 
 
 		 399 aa  430  1e-119  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.59343  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3536  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.95 
 
 		 399 aa  427  1e-118  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3361  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.33 
 
 		 400 aa  425  1e-118  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.100968 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2457  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.06 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7640  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.27 
 
 		 402 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202781  normal  0.359257 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4011  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.06 
 
 		 399 aa  421  1e-117  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0170191 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2629  beta-ketoadipyl CoA thiolase  59.6 
 
 		 406 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.577515  normal  0.0691319 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0514  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.78 
 
 		 402 aa  422  1e-117  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.201521  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3179  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.44 
 
 		 399 aa  422  1e-117  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.694628  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5019  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.08 
 
 		 400 aa  422  1e-117  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.582505 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0916  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.36 
 
 		 400 aa  424  1e-117  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0659  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.27 
 
 		 401 aa  422  1e-117  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.993676  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3039  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.06 
 
 		 400 aa  418  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5587  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.31 
 
 		 400 aa  421  1e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3081  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.71 
 
 		 401 aa  420  1e-116  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.426252 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2064  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.06 
 
 		 400 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.664786 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5246  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.35 
 
 		 400 aa  420  1e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4887  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.92 
 
 		 401 aa  419  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0589853 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2479  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.58 
 
 		 406 aa  421  1e-116  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.612376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2398  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.46 
 
 		 404 aa  419  1e-116  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.681376  normal  0.0712183 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4717  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.09 
 
 		 406 aa  419  1e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1532  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.8 
 
 		 401 aa  419  1e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.117462 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5022  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.18 
 
 		 399 aa  420  1e-116  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.751086  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3280  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.32 
 
 		 406 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.939828  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0636  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.81 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0752  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.44 
 
 		 399 aa  416  9.999999999999999e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.842768  normal  0.454095 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4307  3-oxoadipyl-CoA thiolase  55.3 
 
 		 399 aa  415  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1269  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.31 
 
 		 401 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.690521  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0525  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.27 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.859351  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0320  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.77 
 
 		 402 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3669  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.81 
 
 		 400 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.486351 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_2998  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.84 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.16 
 
 		 401 aa  416  9.999999999999999e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4902  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.84 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.151617  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3825  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.55 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3767  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.98 
 
 		 400 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5368  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.84 
 
 		 400 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.360889  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5094  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.03 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2252  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.31 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00123839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3707  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.95 
 
 		 405 aa  414  1e-114  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.394558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6117  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.42 
 
 		 401 aa  414  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1696  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.81 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.142195 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1017  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.81 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.473484  hitchhiker  0.0000869499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3487  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.04 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00319846  hitchhiker  0.000297737 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0469  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.29 
 
 		 400 aa  413  1e-114  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1260  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.51 
 
 		 412 aa  412  1e-114  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0598  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.55 
 
 		 400 aa  414  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.319983  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0222  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.02 
 
 		 400 aa  412  1e-114  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0698438 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2852  beta-ketoadipyl CoA thiolase  54.57 
 
 		 400 aa  410  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0252423  normal  0.507023 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3718  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.54 
 
 		 400 aa  409  1e-113  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.33538  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2813  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.2 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3097  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.76 
 
 		 404 aa  410  1e-113  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.99011  hitchhiker  0.000409619 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2833  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.16 
 
 		 399 aa  409  1e-113  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.164293 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38200  beta-ketoadipyl CoA thiolase  55.3 
 
 		 401 aa  411  1e-113  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6797  beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.66 
 
 		 401 aa  409  1e-113  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1316  beta-ketoadipyl CoA thiolase  57.22 
 
 		 400 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0850862 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2690  beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.3 
 
 		 400 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0340832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0650  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  53.65 
 
 		 401 aa  406  1.0000000000000001e-112  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2321  acetyl-CoA acetyltransferase  52.66 
 
 		 402 aa  407  1.0000000000000001e-112  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2013  acetyl-CoA acetyltransferase  52.01 
 
 		 401 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.536911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1377  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.31 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388007  normal  0.268922 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4346  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.06 
 
 		 400 aa  404  1e-111  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.269292  normal  0.0367853 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1231  Beta-ketoadipyl CoA thiolase  52.28 
 
 		 400 aa  402  1e-111  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  decreased coverage  0.0000042843  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4437  beta-ketoadipyl CoA thiolase  56.31 
 
 		 400 aa  403  1e-111  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00228017 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0879  Acetyl-CoA C-acyltransferase  53.5 
 
 		 401 aa  403  1e-111  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>