More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_0606 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_0597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.59 
 
 
497 aa  686    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0807275  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1097  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.4 
 
 
531 aa  763    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.856592  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3456  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.95 
 
 
505 aa  775    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.146595  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0098  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.25 
 
 
498 aa  686    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.59 
 
 
498 aa  687    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4060  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67.4 
 
 
496 aa  706    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0775  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 
497 aa  674    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00425927  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0642  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.59 
 
 
497 aa  686    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000457228  decreased coverage  0.0000167809 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1379  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.4 
 
 
552 aa  764    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4593  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.6 
 
 
498 aa  674    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.314497  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0679  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.39 
 
 
497 aa  682    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.000513111  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0157  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.4 
 
 
552 aa  764    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.918228  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4104  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  73.95 
 
 
505 aa  774    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2319  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.2 
 
 
560 aa  773    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0686  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.19 
 
 
497 aa  676    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000335425  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3662  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  66.2 
 
 
496 aa  689    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0637  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.59 
 
 
497 aa  686    Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000000149078  normal  0.27415 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00766  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.99 
 
 
496 aa  686    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.2 
 
 
560 aa  762    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.291559  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1697  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  73.35 
 
 
505 aa  772    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3694  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.39 
 
 
498 aa  683    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1542  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  64.66 
 
 
499 aa  647    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0780531  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1657  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  74.15 
 
 
505 aa  764    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.908997  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0206  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 
497 aa  671    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.515725  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4044  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  64.79 
 
 
498 aa  689    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0372  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.75 
 
 
501 aa  781    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0493  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.4 
 
 
560 aa  764    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0676107  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1126  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  66.4 
 
 
496 aa  671    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2380  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  62.98 
 
 
495 aa  643    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0606  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  100 
 
 
502 aa  1036    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3203  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.75 
 
 
505 aa  764    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.525066  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4566  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.39 
 
 
497 aa  684    Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000243063  hitchhiker  0.00796429 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4293  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.55 
 
 
505 aa  776    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74921  normal  0.50186 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4052  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.15 
 
 
523 aa  763    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4746  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  75.15 
 
 
505 aa  794    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13890  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  67 
 
 
498 aa  669    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0371215  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4438  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.35 
 
 
518 aa  763    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68099  normal  0.139719 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3730  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.95 
 
 
505 aa  767    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1453  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.4 
 
 
531 aa  763    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.454102  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01600  putative aldehyde dehydrogenase  65.45 
 
 
497 aa  673    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.510904  normal  0.728588 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0414  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  65.39 
 
 
498 aa  689    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  72.95 
 
 
505 aa  765    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.174243 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3349  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  65.59 
 
 
498 aa  657    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.894288 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4314  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  73.15 
 
 
505 aa  763    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.389944  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1113  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  59.15 
 
 
496 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000656277  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1151  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.11 
 
 
496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.11811  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1091  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.91 
 
 
496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00014498  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3204  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.31 
 
 
496 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.887195  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1083  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.31 
 
 
496 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000148294  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2650  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.34 
 
 
496 aa  598  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000962307  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1597  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.34 
 
 
506 aa  600  1e-170  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3107  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.31 
 
 
496 aa  598  1e-170  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.281488  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2928  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.31 
 
 
496 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0250419  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1185  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.91 
 
 
496 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.773308  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2977  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57 
 
 
508 aa  596  1e-169  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0965  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.94 
 
 
496 aa  595  1e-169  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0738299  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1877  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57 
 
 
508 aa  596  1e-169  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00719864 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3010  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  57.11 
 
 
496 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.10059  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3023  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  54.89 
 
 
499 aa  597  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0588426  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3049  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.8 
 
 
508 aa  594  1e-168  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0935  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.42 
 
 
501 aa  590  1e-167  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0357372  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1043  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.94 
 
 
496 aa  591  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0205992  normal  0.342071 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2399  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.18 
 
 
502 aa  584  1.0000000000000001e-165  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.169024  normal  0.676059 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4215  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.28 
 
 
499 aa  577  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1791  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.63 
 
 
508 aa  575  1.0000000000000001e-163  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1444  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.2 
 
 
499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0424754  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2416  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.62 
 
 
497 aa  574  1.0000000000000001e-162  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1138  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.48 
 
 
499 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1282  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58 
 
 
499 aa  571  1e-161  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.24316  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0175  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.12 
 
 
509 aa  570  1e-161  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.262954  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3801  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.98 
 
 
511 aa  571  1e-161  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228893  normal  0.75946 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2368  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  58.23 
 
 
504 aa  566  1e-160  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0741  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.33 
 
 
506 aa  562  1.0000000000000001e-159  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.888468  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4274  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.8 
 
 
507 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.463031  normal  0.914985 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3343  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.63 
 
 
503 aa  558  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1334  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.43 
 
 
503 aa  560  1e-158  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5681  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.4 
 
 
503 aa  558  1e-158  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4384  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.8 
 
 
507 aa  558  1e-158  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.640119 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4703  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  54.09 
 
 
501 aa  561  1e-158  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000699732  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2521  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.83 
 
 
499 aa  559  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3822  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  56 
 
 
506 aa  561  1e-158  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.466972  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3003  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.4 
 
 
503 aa  560  1e-158  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3248  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.8 
 
 
509 aa  559  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1410  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.2 
 
 
506 aa  555  1e-157  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0980  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.36 
 
 
512 aa  556  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3271  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.2 
 
 
502 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.190179  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1351  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.2 
 
 
506 aa  554  1e-156  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.241244  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3332  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  55.91 
 
 
505 aa  553  1e-156  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3524  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  56.4 
 
 
506 aa  553  1e-156  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.132108  normal  0.367269 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0950  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  54.6 
 
 
506 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1584  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  54.2 
 
 
498 aa  552  1e-156  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.00000121824  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1432  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  54.6 
 
 
506 aa  552  1e-156  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02392  transmembrane aldehyde dehydrogenase oxidoreductase protein  58 
 
 
499 aa  550  1e-155  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.697821  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5828  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  54.2 
 
 
535 aa  550  1e-155  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4547  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  56.2 
 
 
510 aa  549  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1312  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  54.8 
 
 
506 aa  551  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.648779  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2619  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  53.41 
 
 
522 aa  545  1e-154  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.719043  normal  0.528801 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3021  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  57.03 
 
 
497 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.13552  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2245  methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating]  55.96 
 
 
500 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.230017  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2023  acylating methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase  56.74 
 
 
507 aa  542  1e-153  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.794475  normal  0.0299094 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>