More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3842 on replicon NC_009620
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3842  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 449 aa  864    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0674  xanthine/uracil/vitamin C permease  77.48 
 
 		 443 aa  670    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163748  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3829  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.5 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3907  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.5 
 
 		 441 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3951  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.5 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3843  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.5 
 
 		 441 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4011  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.27 
 
 		 441 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4631  Xanthine/uracil/vitamin C permease  58.43 
 
 		 442 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4531  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.29 
 
 		 443 aa  479  1e-134  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.720055  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6620  xanthine/uracil/vitamin C transporter  54.65 
 
 		 451 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6692  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.82 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265924 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5849  xanthine/uracil/vitamin C permease  56.06 
 
 		 451 aa  428  1e-118  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24264  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6216  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.82 
 
 		 451 aa  426  1e-118  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.668276  decreased coverage  0.00189744 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  34.99 
 
 		 566 aa  245  9.999999999999999e-64  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  36.4 
 
 		 633 aa  244  1.9999999999999999e-63  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  32.58 
 
 		 501 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  33.41 
 
 		 825 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  32.06 
 
 		 505 aa  235  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  32.23 
 
 		 458 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  31.84 
 
 		 647 aa  233  5e-60  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  31.77 
 
 		 503 aa  230  5e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  31.19 
 
 		 505 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  31.19 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  31.19 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  32.63 
 
 		 431 aa  226  4e-58  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  33.02 
 
 		 459 aa  227  4e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  32.37 
 
 		 444 aa  227  4e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  34.38 
 
 		 446 aa  226  5.0000000000000005e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  34.34 
 
 		 487 aa  226  8e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  31.4 
 
 		 501 aa  221  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  31.35 
 
 		 500 aa  221  3e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  35.55 
 
 		 640 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  30.18 
 
 		 463 aa  216  7e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  30.84 
 
 		 493 aa  215  9.999999999999999e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  29.89 
 
 		 497 aa  215  9.999999999999999e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  29.66 
 
 		 460 aa  215  1.9999999999999998e-54  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  29.65 
 
 		 506 aa  213  4.9999999999999996e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  30.7 
 
 		 468 aa  209  5e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  31.14 
 
 		 482 aa  209  7e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  32.09 
 
 		 457 aa  209  7e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  28.96 
 
 		 509 aa  208  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  30.18 
 
 		 469 aa  208  2e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  32.33 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  31.03 
 
 		 665 aa  207  3e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  32.33 
 
 		 457 aa  207  3e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  33.03 
 
 		 479 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0717  xanthine permease  30.59 
 
 		 502 aa  206  7e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  28.9 
 
 		 485 aa  204  3e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  31.16 
 
 		 489 aa  203  5e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  31.35 
 
 		 463 aa  202  7e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  33.04 
 
 		 465 aa  202  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  30.93 
 
 		 525 aa  201  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  30.93 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  30.93 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  30.93 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  28.73 
 
 		 496 aa  201  3e-50  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  30.93 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  30.93 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  30.93 
 
 		 482 aa  201  3e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  31.78 
 
 		 458 aa  199  7e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  30.14 
 
 		 469 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  31.54 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  30.23 
 
 		 466 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  31.54 
 
 		 457 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  31.54 
 
 		 458 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  30.7 
 
 		 525 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  31.01 
 
 		 451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  30.23 
 
 		 466 aa  198  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  31.54 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  31.78 
 
 		 458 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  30.51 
 
 		 465 aa  196  5.000000000000001e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  31.08 
 
 		 451 aa  196  6e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  31.08 
 
 		 451 aa  196  7e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  31.54 
 
 		 458 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  31.05 
 
 		 452 aa  195  1e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  31.29 
 
 		 468 aa  194  2e-48  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  30.86 
 
 		 451 aa  195  2e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  29.16 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  30.8 
 
 		 495 aa  194  3e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  29.16 
 
 		 475 aa  194  3e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  30.14 
 
 		 471 aa  194  3e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  30.7 
 
 		 469 aa  192  8e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  31.26 
 
 		 457 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  29.87 
 
 		 463 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  30.28 
 
 		 455 aa  192  1e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  30.53 
 
 		 469 aa  190  2.9999999999999997e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  30.65 
 
 		 442 aa  190  5e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  30.05 
 
 		 455 aa  189  9e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  30.61 
 
 		 494 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  27.84 
 
 		 440 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  30.18 
 
 		 496 aa  187  2e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  31.62 
 
 		 450 aa  187  3e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  29.75 
 
 		 451 aa  187  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  29.28 
 
 		 490 aa  185  1.0000000000000001e-45  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  28.71 
 
 		 442 aa  185  1.0000000000000001e-45  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  33.56 
 
 		 469 aa  185  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  32.88 
 
 		 469 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  29.52 
 
 		 435 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  30.15 
 
 		 493 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  29.47 
 
 		 495 aa  181  2.9999999999999997e-44  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>