More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6620 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6620  xanthine/uracil/vitamin C transporter  100 
 
 
451 aa  862    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5849  xanthine/uracil/vitamin C permease  94.46 
 
 
451 aa  783    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24264  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6216  xanthine/uracil/vitamin C permease  94.24 
 
 
451 aa  780    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.668276  decreased coverage  0.00189744 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6692  xanthine/uracil/vitamin C permease  94.68 
 
 
451 aa  784    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.265924 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4631  Xanthine/uracil/vitamin C permease  73.55 
 
 
442 aa  608  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3842  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.46 
 
 
449 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.899468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0674  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.63 
 
 
443 aa  433  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163748  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3951  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.66 
 
 
441 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3829  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.66 
 
 
441 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3907  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.66 
 
 
441 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3843  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.66 
 
 
441 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4011  xanthine/uracil/vitamin C permease  52.42 
 
 
441 aa  425  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4531  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.99 
 
 
443 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.720055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  32.88 
 
 
458 aa  218  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  35.07 
 
 
444 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  34.16 
 
 
446 aa  213  7e-54  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  35.37 
 
 
459 aa  208  1e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  33.18 
 
 
633 aa  206  6e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  32.01 
 
 
501 aa  206  7e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  30.79 
 
 
505 aa  206  9e-52  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  31.4 
 
 
463 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  32.57 
 
 
825 aa  200  3e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  32.73 
 
 
463 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  35.06 
 
 
640 aa  198  1.0000000000000001e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  30.13 
 
 
505 aa  198  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  30.13 
 
 
505 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  30.84 
 
 
566 aa  197  4.0000000000000005e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  35.18 
 
 
665 aa  196  7e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  32.94 
 
 
466 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  32.7 
 
 
466 aa  196  9e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  31.89 
 
 
475 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  30.75 
 
 
506 aa  195  2e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  31.41 
 
 
431 aa  194  2e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  31.89 
 
 
475 aa  195  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  29.69 
 
 
505 aa  194  3e-48  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  32.7 
 
 
465 aa  194  3e-48  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  29.42 
 
 
457 aa  194  3e-48  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  29.62 
 
 
497 aa  191  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  33.8 
 
 
452 aa  190  4e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  29.5 
 
 
460 aa  190  5e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  31.11 
 
 
455 aa  189  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  31.98 
 
 
487 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  28.06 
 
 
469 aa  188  1e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  35.57 
 
 
469 aa  188  2e-46  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  30.68 
 
 
503 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  35.79 
 
 
469 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  31.09 
 
 
482 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  29.36 
 
 
457 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  30.89 
 
 
455 aa  187  4e-46  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  32.31 
 
 
647 aa  187  5e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  30.91 
 
 
496 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  29.06 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  29.06 
 
 
457 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  31.25 
 
 
465 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  29.61 
 
 
509 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  30.43 
 
 
449 aa  184  3e-45  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  30.14 
 
 
458 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  28.67 
 
 
479 aa  184  3e-45  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  30.38 
 
 
468 aa  183  4.0000000000000006e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  28.07 
 
 
495 aa  183  5.0000000000000004e-45  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  33.72 
 
 
450 aa  182  8.000000000000001e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  29.06 
 
 
471 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  33.11 
 
 
466 aa  182  9.000000000000001e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  29.91 
 
 
458 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  29.65 
 
 
482 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  29.65 
 
 
482 aa  182  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  29.65 
 
 
482 aa  182  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  29.65 
 
 
482 aa  182  1e-44  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  29.65 
 
 
482 aa  182  1e-44  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  29.65 
 
 
482 aa  182  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  29.65 
 
 
525 aa  181  2e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  28.48 
 
 
469 aa  182  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  29.84 
 
 
485 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  28.8 
 
 
457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  28.8 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  28.8 
 
 
458 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  31.19 
 
 
469 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  31.91 
 
 
468 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  28.57 
 
 
458 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0717  xanthine permease  32.65 
 
 
502 aa  179  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  29.42 
 
 
525 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  29.29 
 
 
458 aa  179  1e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  30.8 
 
 
469 aa  177  4e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  27.31 
 
 
440 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  29.27 
 
 
493 aa  176  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  32.67 
 
 
463 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  30.52 
 
 
518 aa  174  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  29.77 
 
 
490 aa  173  5.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  28.74 
 
 
442 aa  172  7.999999999999999e-42  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  29.19 
 
 
494 aa  171  3e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  26.75 
 
 
495 aa  170  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  29.26 
 
 
442 aa  169  1e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  29.96 
 
 
463 aa  167  2e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  28.38 
 
 
500 aa  167  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  26.65 
 
 
440 aa  167  5e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  26.65 
 
 
440 aa  167  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  26.65 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  26.65 
 
 
440 aa  166  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  28.85 
 
 
493 aa  166  8e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  30.06 
 
 
499 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>