More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6216 on replicon NC_008544
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6620  xanthine/uracil/vitamin C transporter  94.24 
 
 		 451 aa  790    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6692  xanthine/uracil/vitamin C permease  98.45 
 
 		 451 aa  845    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265924 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5849  xanthine/uracil/vitamin C permease  99.78 
 
 		 451 aa  857    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24264  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6216  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 451 aa  859    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.668276  decreased coverage  0.00189744 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4631  Xanthine/uracil/vitamin C permease  73.78 
 
 		 442 aa  607  1e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3842  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.2 
 
 		 449 aa  437  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0674  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.55 
 
 		 443 aa  432  1e-120  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163748  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3843  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.72 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3829  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.95 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3951  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.95 
 
 		 441 aa  429  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3907  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.95 
 
 		 441 aa  430  1e-119  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4011  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.72 
 
 		 441 aa  427  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4531  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.99 
 
 		 443 aa  410  1e-113  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.720055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  34.43 
 
 		 458 aa  220  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  33.94 
 
 		 633 aa  216  9.999999999999999e-55  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  35.29 
 
 		 444 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  35.07 
 
 		 446 aa  209  6e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  31.77 
 
 		 463 aa  206  5e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  35.55 
 
 		 459 aa  205  1e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  31.51 
 
 		 505 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  32.29 
 
 		 825 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  33.18 
 
 		 463 aa  200  3e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  32.72 
 
 		 501 aa  199  6e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  35.35 
 
 		 640 aa  197  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  32.37 
 
 		 431 aa  197  3e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  32.48 
 
 		 665 aa  194  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  32.43 
 
 		 466 aa  194  3e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  32.21 
 
 		 466 aa  193  5e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  33.55 
 
 		 475 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  33.55 
 
 		 475 aa  193  6e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  30.59 
 
 		 505 aa  192  1e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  31.69 
 
 		 506 aa  191  2e-47  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  30.59 
 
 		 505 aa  191  2e-47  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  32.47 
 
 		 465 aa  191  2.9999999999999997e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  30.88 
 
 		 457 aa  189  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  32.24 
 
 		 647 aa  189  1e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  30.8 
 
 		 566 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  31.15 
 
 		 503 aa  188  2e-46  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  37.98 
 
 		 469 aa  187  3e-46  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  30.14 
 
 		 505 aa  187  4e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  33.33 
 
 		 452 aa  186  5e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  29.72 
 
 		 469 aa  186  5e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  29.69 
 
 		 497 aa  187  5e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  33.64 
 
 		 487 aa  186  6e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  29.11 
 
 		 495 aa  186  8e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  28.74 
 
 		 460 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  30.43 
 
 		 457 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  30.5 
 
 		 509 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  31.03 
 
 		 455 aa  184  3e-45  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  37.26 
 
 		 469 aa  184  3e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  31.14 
 
 		 482 aa  183  4.0000000000000006e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  29.14 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  29.14 
 
 		 458 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  30.91 
 
 		 496 aa  182  8.000000000000001e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  28.92 
 
 		 458 aa  182  9.000000000000001e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  31.81 
 
 		 468 aa  182  9.000000000000001e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  29.36 
 
 		 457 aa  181  2e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  29.39 
 
 		 469 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  29.98 
 
 		 458 aa  181  2e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  30.55 
 
 		 485 aa  182  2e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  32 
 
 		 465 aa  181  2e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  30.67 
 
 		 455 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  29.76 
 
 		 458 aa  180  4e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  29.77 
 
 		 479 aa  180  4e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  30.18 
 
 		 457 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  30.18 
 
 		 457 aa  180  4.999999999999999e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  29.39 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  33.94 
 
 		 450 aa  179  7e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0717  xanthine permease  31.43 
 
 		 502 aa  179  8e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  31.84 
 
 		 468 aa  177  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  30.73 
 
 		 449 aa  177  3e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  28.09 
 
 		 440 aa  176  6e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  28.63 
 
 		 493 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  29.2 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  29.2 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  29.2 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  33.71 
 
 		 466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  29.2 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  29.2 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  29.2 
 
 		 525 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  29.2 
 
 		 482 aa  174  2.9999999999999996e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  29.85 
 
 		 518 aa  174  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  27.95 
 
 		 471 aa  173  6.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  31.02 
 
 		 469 aa  173  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  30.02 
 
 		 490 aa  173  6.999999999999999e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  30.59 
 
 		 469 aa  172  1e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  26.88 
 
 		 495 aa  172  1e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  32.68 
 
 		 463 aa  171  2e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  28.98 
 
 		 525 aa  171  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  27.57 
 
 		 495 aa  171  2e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  27.57 
 
 		 495 aa  170  5e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  28.5 
 
 		 442 aa  169  6e-41  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  27.1 
 
 		 440 aa  169  9e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  27.1 
 
 		 440 aa  169  1e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  27.1 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  27.1 
 
 		 440 aa  168  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  29.62 
 
 		 442 aa  167  4e-40  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  29.12 
 
 		 493 aa  167  4e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  26.86 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  29.24 
 
 		 494 aa  167  5e-40  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>