More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3854 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  98.67 
 
 		 451 aa  873    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  97.78 
 
 		 451 aa  851    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  85.81 
 
 		 452 aa  746    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  76.5 
 
 		 455 aa  683    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  76.72 
 
 		 455 aa  686    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  100 
 
 		 451 aa  883    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  98 
 
 		 451 aa  871    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  56.37 
 
 		 463 aa  436  1e-121  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  49.14 
 
 		 468 aa  434  1e-120  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  50.43 
 
 		 466 aa  430  1e-119  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  48.6 
 
 		 482 aa  424  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  51.13 
 
 		 468 aa  418  1e-116  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  49.56 
 
 		 469 aa  419  1e-116  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  51.27 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  51.27 
 
 		 457 aa  419  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  50.34 
 
 		 457 aa  421  1e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  51.04 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  51.27 
 
 		 479 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  51.04 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  51.27 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  51.25 
 
 		 449 aa  417  9.999999999999999e-116  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  51.04 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  51.04 
 
 		 458 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  51.04 
 
 		 458 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  50.68 
 
 		 465 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  49.66 
 
 		 466 aa  412  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  48.89 
 
 		 469 aa  414  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  50.58 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  50.81 
 
 		 469 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  49.66 
 
 		 466 aa  411  1e-113  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  48.39 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  48.39 
 
 		 475 aa  405  1.0000000000000001e-112  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  50.6 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  50.6 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  50.6 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  50.6 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  50.6 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  50.6 
 
 		 525 aa  402  1e-111  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  50.6 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  50.36 
 
 		 525 aa  400  9.999999999999999e-111  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  50.12 
 
 		 471 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  51.03 
 
 		 466 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  50.12 
 
 		 469 aa  397  1e-109  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  48.72 
 
 		 463 aa  396  1e-109  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  47.83 
 
 		 463 aa  392  1e-108  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  49.04 
 
 		 431 aa  389  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  48.54 
 
 		 465 aa  386  1e-106  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  44.94 
 
 		 457 aa  381  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  46.19 
 
 		 494 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  44.38 
 
 		 496 aa  373  1e-102  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  50.46 
 
 		 469 aa  370  1e-101  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  44.91 
 
 		 458 aa  369  1e-101  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  49.77 
 
 		 469 aa  368  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  45.75 
 
 		 460 aa  367  1e-100  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  44.66 
 
 		 495 aa  364  2e-99  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  46.23 
 
 		 490 aa  363  4e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  44.49 
 
 		 495 aa  363  4e-99  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  44.49 
 
 		 495 aa  362  6e-99  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  47.22 
 
 		 463 aa  360  4e-98  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  45.6 
 
 		 493 aa  355  6.999999999999999e-97  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  46.26 
 
 		 503 aa  354  2e-96  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  44.34 
 
 		 505 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  45.27 
 
 		 501 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  43.88 
 
 		 495 aa  353  4e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  46.1 
 
 		 493 aa  351  2e-95  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  44.6 
 
 		 446 aa  347  2e-94  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  45.54 
 
 		 566 aa  347  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1307  xanthine permease  45.59 
 
 		 499 aa  345  8e-94  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.225701  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  42.53 
 
 		 457 aa  341  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  45.05 
 
 		 505 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  43.53 
 
 		 497 aa  339  5e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3433  xanthine/uracil permease  43.18 
 
 		 451 aa  338  9e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.474352 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  43.61 
 
 		 459 aa  338  9e-92  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  44.58 
 
 		 505 aa  338  9e-92  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  44.76 
 
 		 489 aa  338  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  43.19 
 
 		 509 aa  338  9.999999999999999e-92  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  41.94 
 
 		 487 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  43.91 
 
 		 485 aa  337  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  43.44 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  44.34 
 
 		 505 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  42.62 
 
 		 825 aa  332  1e-89  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  43.88 
 
 		 506 aa  332  1e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  44.24 
 
 		 500 aa  332  1e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  41.78 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  41.78 
 
 		 440 aa  330  2e-89  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  43.06 
 
 		 446 aa  330  3e-89  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  41.78 
 
 		 440 aa  330  3e-89  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  41.55 
 
 		 440 aa  330  4e-89  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  41.78 
 
 		 440 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  41.78 
 
 		 440 aa  330  4e-89  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  41.78 
 
 		 440 aa  330  4e-89  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  41.78 
 
 		 440 aa  330  4e-89  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  41.78 
 
 		 440 aa  330  4e-89  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  43.45 
 
 		 501 aa  329  6e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  41.78 
 
 		 440 aa  329  7e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  44.13 
 
 		 496 aa  328  9e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  42.31 
 
 		 440 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  41.57 
 
 		 444 aa  318  1e-85  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4724  xanthine permease  41.11 
 
 		 518 aa  315  9.999999999999999e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0102171  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0161  xanthine permease  41.59 
 
 		 451 aa  311  1e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>