More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0674 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009620  Smed_3842  xanthine/uracil/vitamin C permease  77.48 
 
 		 449 aa  670    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0674  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 443 aa  860    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163748  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3843  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.44 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3951  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.44 
 
 		 441 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3829  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.44 
 
 		 441 aa  508  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3907  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.44 
 
 		 441 aa  510  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4011  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.97 
 
 		 441 aa  506  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4531  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.25 
 
 		 443 aa  488  1e-137  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.720055  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4631  Xanthine/uracil/vitamin C permease  57.28 
 
 		 442 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6692  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.29 
 
 		 451 aa  422  1e-117  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265924 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6620  xanthine/uracil/vitamin C transporter  54.63 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5849  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.29 
 
 		 451 aa  421  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24264  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6216  xanthine/uracil/vitamin C permease  55.05 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.668276  decreased coverage  0.00189744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  38.99 
 
 		 633 aa  265  2e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  34.57 
 
 		 825 aa  256  5e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  35.25 
 
 		 566 aa  255  1.0000000000000001e-66  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  36.32 
 
 		 459 aa  254  2.0000000000000002e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  34.26 
 
 		 505 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  33.86 
 
 		 458 aa  247  3e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  32.95 
 
 		 431 aa  244  1.9999999999999999e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  33.03 
 
 		 505 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  32.95 
 
 		 444 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  33.03 
 
 		 505 aa  240  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  33.11 
 
 		 501 aa  240  4e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  32.8 
 
 		 505 aa  239  5.999999999999999e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  32.66 
 
 		 460 aa  239  6.999999999999999e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  35.83 
 
 		 640 aa  238  2e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  32.79 
 
 		 469 aa  236  8e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  33.71 
 
 		 487 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  33.48 
 
 		 503 aa  234  2.0000000000000002e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  33.49 
 
 		 446 aa  234  3e-60  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  31.67 
 
 		 493 aa  234  3e-60  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  33.26 
 
 		 457 aa  232  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  33.49 
 
 		 457 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  33.49 
 
 		 457 aa  230  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  33.33 
 
 		 647 aa  229  8e-59  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  33.49 
 
 		 479 aa  229  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  32.54 
 
 		 665 aa  228  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  31.82 
 
 		 482 aa  228  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  30.68 
 
 		 463 aa  226  5.0000000000000005e-58  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  32.79 
 
 		 469 aa  226  8e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  31.57 
 
 		 463 aa  225  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  32.09 
 
 		 471 aa  224  2e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  32.31 
 
 		 468 aa  224  2e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  32.79 
 
 		 457 aa  224  3e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  32.79 
 
 		 458 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  32.79 
 
 		 458 aa  223  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  33.33 
 
 		 489 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  32.79 
 
 		 458 aa  223  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  31.45 
 
 		 509 aa  220  3e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  32.56 
 
 		 458 aa  221  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  33.02 
 
 		 458 aa  221  3e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  32.79 
 
 		 458 aa  219  7e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  31.57 
 
 		 500 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  31.12 
 
 		 501 aa  219  8.999999999999998e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  31.36 
 
 		 506 aa  218  2e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  30.24 
 
 		 440 aa  218  2e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  30.02 
 
 		 497 aa  218  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  31.03 
 
 		 485 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  30.87 
 
 		 475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  30.87 
 
 		 475 aa  215  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3616  xanthine permease  31.19 
 
 		 451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.267738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  29.58 
 
 		 442 aa  213  5.999999999999999e-54  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  30.59 
 
 		 496 aa  212  9e-54  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4290  xanthine/uracil permease family protein  31.49 
 
 		 451 aa  211  1e-53  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  30.41 
 
 		 455 aa  212  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02720  predicted transporter  30.04 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.553016  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3047  putative xanthine permease  30.04 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  30.04 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02683  hypothetical protein  30.04 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.673646  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  30.73 
 
 		 452 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  31.66 
 
 		 465 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  30.23 
 
 		 455 aa  211  2e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  29.52 
 
 		 440 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  30.04 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  30.48 
 
 		 525 aa  211  2e-53  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  30.04 
 
 		 482 aa  211  2e-53  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  29.52 
 
 		 440 aa  211  3e-53  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  30.43 
 
 		 457 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1578  uracil-xanthine permease  31.26 
 
 		 451 aa  210  4e-53  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3854  xanthine permease  31.26 
 
 		 451 aa  209  6e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00662261  normal  0.542415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  29.52 
 
 		 440 aa  209  7e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  29.29 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  29.29 
 
 		 440 aa  208  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4177  putative xanthine permease  30.25 
 
 		 525 aa  207  2e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  29.29 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  29.29 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  29.29 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  29.29 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  29.29 
 
 		 440 aa  207  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  30 
 
 		 442 aa  207  4e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  32.57 
 
 		 463 aa  207  4e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  30.07 
 
 		 466 aa  206  8e-52  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  30.07 
 
 		 466 aa  204  2e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  30 
 
 		 465 aa  203  4e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  29.94 
 
 		 495 aa  204  4e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  31.6 
 
 		 450 aa  203  6e-51  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  32.18 
 
 		 446 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0717  xanthine permease  29.85 
 
 		 502 aa  201  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  30.84 
 
 		 435 aa  201  3e-50  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>