More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SeD_A4011 on replicon NC_011205
Organism: Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011080  SNSL254_A3907  xanthine/uracil/vitamin C permease  99.32 
 
 		 441 aa  856    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3843  xanthine/uracil/vitamin C permease  99.32 
 
 		 441 aa  857    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4011  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 		 441 aa  861    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3829  xanthine/uracil/vitamin C permease  99.32 
 
 		 441 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3951  xanthine/uracil/vitamin C permease  99.32 
 
 		 441 aa  855    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3842  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.27 
 
 		 449 aa  509  1e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.899468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0674  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.97 
 
 		 443 aa  506  9.999999999999999e-143  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163748  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4631  Xanthine/uracil/vitamin C permease  52.5 
 
 		 442 aa  451  1e-125  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4531  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.43 
 
 		 443 aa  423  1e-117  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.720055  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6692  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.72 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.265924 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5849  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.95 
 
 		 451 aa  419  1e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24264  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6216  xanthine/uracil/vitamin C permease  53.72 
 
 		 451 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.668276  decreased coverage  0.00189744 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6620  xanthine/uracil/vitamin C transporter  52.42 
 
 		 451 aa  414  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  30.05 
 
 		 431 aa  206  5e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  30.37 
 
 		 566 aa  205  1e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  31.16 
 
 		 444 aa  204  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  30.8 
 
 		 446 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  30.72 
 
 		 501 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  29.75 
 
 		 460 aa  194  2e-48  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  31.4 
 
 		 459 aa  190  4e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  30.14 
 
 		 633 aa  190  4e-47  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  28.84 
 
 		 463 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  31.44 
 
 		 647 aa  187  3e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  28.3 
 
 		 497 aa  185  1.0000000000000001e-45  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  28.84 
 
 		 825 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  29.44 
 
 		 463 aa  183  6e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  30.54 
 
 		 640 aa  182  1e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  28.64 
 
 		 458 aa  180  4.999999999999999e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  27.53 
 
 		 505 aa  180  5.999999999999999e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0967  uracil-xanthine permease  27.91 
 
 		 496 aa  179  8e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  29.06 
 
 		 665 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  28.24 
 
 		 505 aa  177  3e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  27 
 
 		 503 aa  177  3e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  28 
 
 		 505 aa  176  6e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  27.73 
 
 		 487 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  28.57 
 
 		 442 aa  174  1.9999999999999998e-42  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  26.35 
 
 		 469 aa  171  2e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  27.29 
 
 		 505 aa  170  5e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  27.08 
 
 		 506 aa  169  7e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  26.98 
 
 		 509 aa  169  1e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  27.94 
 
 		 442 aa  168  2e-40  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  26.19 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  26.18 
 
 		 489 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  26.19 
 
 		 440 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  26.19 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  26.19 
 
 		 440 aa  167  5e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  26.19 
 
 		 457 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  27.9 
 
 		 500 aa  167  5e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  26.19 
 
 		 458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  26.19 
 
 		 458 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  26.19 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  26.19 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  26.19 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  26.19 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  26.19 
 
 		 440 aa  166  9e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3209  xanthine permease  27.97 
 
 		 501 aa  165  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  25.96 
 
 		 458 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  29.15 
 
 		 450 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  26.19 
 
 		 440 aa  166  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  26.68 
 
 		 493 aa  164  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  26.44 
 
 		 466 aa  164  3e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  27.07 
 
 		 482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  26.44 
 
 		 466 aa  163  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  25.18 
 
 		 440 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  27.71 
 
 		 449 aa  162  9e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  27.56 
 
 		 485 aa  162  9e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  26.19 
 
 		 457 aa  162  1e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  25.73 
 
 		 458 aa  162  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  27.49 
 
 		 468 aa  160  3e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  26.95 
 
 		 465 aa  160  6e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  28.38 
 
 		 468 aa  159  8e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  28.51 
 
 		 465 aa  159  1e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  26.35 
 
 		 469 aa  159  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  25.51 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  25.51 
 
 		 458 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  26.29 
 
 		 457 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  26.29 
 
 		 457 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  31.15 
 
 		 469 aa  156  8e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  30.7 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0536  xanthine/uracil permease  27.94 
 
 		 448 aa  155  1e-36  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000490682  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  27.35 
 
 		 457 aa  155  1e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1701  xanthine/uracil permease  28.94 
 
 		 452 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.226413  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  26.07 
 
 		 479 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  27.15 
 
 		 475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  27.15 
 
 		 475 aa  153  5.9999999999999996e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  25.58 
 
 		 471 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1266  xanthine/uracil permease  28.28 
 
 		 427 aa  152  1e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0144889  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2388  xanthine permease  25.3 
 
 		 435 aa  152  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  27.29 
 
 		 469 aa  152  2e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  27.07 
 
 		 469 aa  151  2e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0384  xanthine permease  27.46 
 
 		 452 aa  151  3e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0385  uracil-xanthine permease  27.46 
 
 		 452 aa  150  5e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  29.75 
 
 		 466 aa  149  8e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3824  putative transporter  25.52 
 
 		 455 aa  149  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.208531  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3080  xanthine/uracil permease  28.61 
 
 		 449 aa  149  1.0000000000000001e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.230022  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44950  putative transporter  25.74 
 
 		 455 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3020  putative xanthine permease  26.57 
 
 		 525 aa  148  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0805  xanthine permease  26.13 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.568005  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3213  putative xanthine permease  26.13 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0821  xanthine permease  26.13 
 
 		 482 aa  147  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>