More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4531 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4531  xanthine/uracil/vitamin C permease  100 
 
 
443 aa  851    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.720055  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0674  xanthine/uracil/vitamin C permease  59.25 
 
 
443 aa  488  1e-137  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.163748  normal  0.211367 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3842  xanthine/uracil/vitamin C permease  58.29 
 
 
449 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.899468 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4631  Xanthine/uracil/vitamin C permease  55.35 
 
 
442 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.435017 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3907  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.89 
 
 
441 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3843  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.89 
 
 
441 aa  426  1e-118  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4011  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.43 
 
 
441 aa  423  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3951  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.66 
 
 
441 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3829  xanthine/uracil/vitamin C permease  49.66 
 
 
441 aa  424  1e-117  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6620  xanthine/uracil/vitamin C transporter  53.99 
 
 
451 aa  405  1.0000000000000001e-112  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.685724  normal  0.577034 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5849  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.89 
 
 
451 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.24264  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6692  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.65 
 
 
451 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.265924 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6216  xanthine/uracil/vitamin C permease  54.65 
 
 
451 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.668276  decreased coverage  0.00189744 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5275  uracil-xanthine permease  38.37 
 
 
633 aa  262  8e-69  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2478  uracil-xanthine permease  35.58 
 
 
431 aa  261  2e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000102506  decreased coverage  0.00126456 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1670  xanthine permease  35.63 
 
 
460 aa  257  3e-67  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2599  uracil-xanthine permease  38.9 
 
 
459 aa  255  1.0000000000000001e-66  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.765117  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1691  xanthine permease  37.73 
 
 
466 aa  254  3e-66  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0626617 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2057  xanthine permease  37.7 
 
 
444 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0614609  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2010  xanthine permease  37.73 
 
 
466 aa  253  5.000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0376042  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2729  xanthine/uracil permease  36.9 
 
 
446 aa  252  7e-66  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.562669  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2965  xanthine permease  38.62 
 
 
640 aa  251  3e-65  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.276589  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2840  uracil-xanthine permease  36.07 
 
 
458 aa  249  8e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1127  xanthine permease  37.16 
 
 
465 aa  248  2e-64  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.28309  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3263  xanthine permease  36.87 
 
 
501 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.480223  normal  0.169511 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0261  xanthine permease  36.47 
 
 
825 aa  244  9.999999999999999e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0691  xanthine permease  34.99 
 
 
458 aa  244  3e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.298309  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4001  uracil-xanthine permease  35.41 
 
 
463 aa  242  7.999999999999999e-63  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.787039  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2047  purine permease  36.49 
 
 
465 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.679547  normal  0.900156 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3072  xanthine/uracil permease  37.16 
 
 
463 aa  241  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.362165  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_03150  uracil-xanthine permease  35.68 
 
 
647 aa  240  4e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0683  xanthine/uracil permease family protein  35.08 
 
 
457 aa  238  1e-61  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.355729  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0228  xanthine/uracil permease  33.99 
 
 
442 aa  238  2e-61  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000515312  decreased coverage  6.186300000000001e-25 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3255  xanthine permease  33.86 
 
 
469 aa  237  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6205  xanthine permease  35.45 
 
 
463 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1021  putative permease protein  35.12 
 
 
457 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0317497  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0858  xanthine permease  35.12 
 
 
457 aa  236  6e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0863  xanthine permease  34.63 
 
 
479 aa  236  8e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1996  uracil-xanthine permease  34.32 
 
 
458 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0659686  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2606  uracil-xanthine permease  34.32 
 
 
458 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.779678  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2630  xanthine permease  34.32 
 
 
457 aa  234  3e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0249  xanthine permease  37.05 
 
 
487 aa  233  4.0000000000000004e-60  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0481  xanthine permease  33.86 
 
 
471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.0273217 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2436  xanthine/uracil permease  34 
 
 
482 aa  233  6e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.120352  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5937  xanthine/uracil transporter  34.42 
 
 
458 aa  233  7.000000000000001e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247365  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0711  xanthine/uracil - cation symporter  33.94 
 
 
469 aa  232  9e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5248  xanthine permease  39.95 
 
 
466 aa  231  1e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0121197 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0266  xanthine permease  34.27 
 
 
489 aa  231  2e-59  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0883  uracil-xanthine permease  34.71 
 
 
468 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.244227  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2526  xanthine permease  34.42 
 
 
458 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.10385 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2653  uracil-xanthine permease  34.42 
 
 
458 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.139978  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3140  xanthine permease  35.01 
 
 
457 aa  228  1e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0795  xanthine permease  34.49 
 
 
505 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.868998  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4071  xanthine permease  34.51 
 
 
475 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4183  xanthine permease  34.51 
 
 
475 aa  227  3e-58  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.118543  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4643  xanthine/uracil permease family protein  34.03 
 
 
505 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.422723 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4505  uracil-xanthine permease  34.03 
 
 
505 aa  226  6e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.552965  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1826  xanthine permease  34.2 
 
 
665 aa  225  1e-57  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4637  xanthine permease  33.8 
 
 
505 aa  225  1e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0163  uracil-xanthine permease  34.33 
 
 
503 aa  224  2e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2917  xanthine permease  34.25 
 
 
449 aa  224  2e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1141  xanthine permease  32.16 
 
 
490 aa  223  7e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3292  uracil-xanthine permease  35.96 
 
 
463 aa  222  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.967032  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4854  xanthine permease  33.02 
 
 
497 aa  221  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2224  putative transporter  33.95 
 
 
509 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3941  xanthine permease  32.35 
 
 
495 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0162348  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2118  putative xanthine permease transmembrane protein  33.11 
 
 
468 aa  219  8.999999999999998e-56  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.261398  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1034  xanthine permease  30.69 
 
 
495 aa  218  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.581901  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2911  uracil-xanthine permease  33.4 
 
 
494 aa  218  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.295839  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1113  uracil-xanthine permease  30.69 
 
 
495 aa  218  2e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1871  xanthine/uracil permease  33.57 
 
 
506 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.168569  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1935  xanthine permease  31.83 
 
 
469 aa  213  3.9999999999999995e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.39014  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0717  xanthine permease  33.87 
 
 
502 aa  213  7e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2107  xanthine permease  31.37 
 
 
495 aa  212  1e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.439445  normal  0.198609 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1828  uracil-xanthine permease  33.02 
 
 
442 aa  211  2e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2258  xanthine permease  31.4 
 
 
469 aa  211  2e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26050  putative transporter  33.66 
 
 
485 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.940504 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1340  xanthine permease  35.06 
 
 
466 aa  210  4e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000141627  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1627  xanthine permease  31.81 
 
 
440 aa  206  5e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000543313  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08240  uracil-xanthine permease  33.41 
 
 
566 aa  206  5e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1491  uracil-xanthine permease  31.81 
 
 
440 aa  206  7e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.994687  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1300  uracil-xanthine permease  32.25 
 
 
493 aa  206  7e-52  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0633  xanthine/uracil transporter  33.57 
 
 
457 aa  205  1e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.757735  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3718  xanthine permease  31.81 
 
 
440 aa  205  1e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.46094  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1476  xanthine permease  31.81 
 
 
440 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00182519  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1448  xanthine permease  31.81 
 
 
440 aa  205  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.868046  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1449  xanthine permease  31.81 
 
 
440 aa  205  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000505037  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1662  xanthine permease  31.81 
 
 
440 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.80713 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1592  xanthine permease  31.81 
 
 
440 aa  205  2e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1303  uracil-xanthine permease  31.96 
 
 
440 aa  203  4e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1698  xanthine permease  31.57 
 
 
440 aa  203  6e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1738  xanthine permease  31.57 
 
 
440 aa  203  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00633397  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1277  uracil-xanthine permease  30.75 
 
 
496 aa  203  6e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0599203  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3917  uracil-xanthine permease  31.74 
 
 
493 aa  202  7e-51  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.51079  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7137  xanthine permease  33.41 
 
 
446 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.946612 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3343  xanthine permease  35.33 
 
 
469 aa  201  3e-50  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3668  xanthine permease  35.1 
 
 
469 aa  200  5e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0396635  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2128  uracil-xanthine permease  36.57 
 
 
450 aa  199  6e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.344536  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3606  xanthine permease  33.86 
 
 
457 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.556926  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3428  uracil-xanthine permease  32.55 
 
 
500 aa  197  3e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>