More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_3412 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_3412  ROK family protein  100 
 
 		 303 aa  590  1e-168  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3453  ROK family protein  68.87 
 
 		 307 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3755  ROK family protein  69.97 
 
 		 304 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0200167  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6233  transcriptional regulator ROK family  63.3 
 
 		 302 aa  346  3e-94  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1405  N-acetylglucosamine kinase  50.84 
 
 		 295 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0073  ROK family protein  50.84 
 
 		 295 aa  262  6e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.237257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3487  ROK family protein  50.16 
 
 		 316 aa  246  3e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2813  ROK family protein  50.67 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.255699 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0885  ROK  33.58 
 
 		 301 aa  150  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0426  ROK family protein  35.38 
 
 		 313 aa  146  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1138  N-acetyl-D-glucosamine kinase  32.67 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3279  fructokinase  31.49 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3140  fructokinase  31.49 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3290  fructokinase  31.49 
 
 		 304 aa  143  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.945696  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2296  ROK family protein  36.54 
 
 		 313 aa  142  8e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.124263  normal  0.0313966 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1603  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.79 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.321167  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1041  N-acetyl-D-glucosamine kinase  29.18 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1710  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.79 
 
 		 304 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1392  N-acetyl-D-glucosamine kinase  32.33 
 
 		 302 aa  140  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.139695  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0785  N-acetylglucosamine kinase  31.88 
 
 		 291 aa  140  3e-32  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.82704  normal  0.0143215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0940  N-acetylglucosamine kinase  31.35 
 
 		 304 aa  139  6e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0159754 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2128  ROK family protein  33.81 
 
 		 312 aa  138  1e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589605  normal  0.338351 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3992  ROK family protein  32.13 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003510  ROK family protein  30.33 
 
 		 302 aa  137  3.0000000000000003e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0489  ROK family protein  34.47 
 
 		 299 aa  136  4e-31  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.111687 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1621  ROK family protein  32.11 
 
 		 306 aa  135  8e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.613515  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0696  ROK family protein  32.78 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0763542  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2599  N-acetylglucosamine kinase  33.33 
 
 		 308 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.65292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2004  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.39 
 
 		 306 aa  135  9.999999999999999e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.738789  normal  0.0249015 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3816  ROK family protein  30.88 
 
 		 312 aa  134  1.9999999999999998e-30  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.904203 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02257  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.33 
 
 		 302 aa  134  1.9999999999999998e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2648  ROK family protein  29.81 
 
 		 326 aa  133  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2532  N-acetylglucosamine kinase  33.33 
 
 		 308 aa  132  6e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3833  fructokinase  32.21 
 
 		 299 aa  131  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0310  ROK family protein  36.05 
 
 		 307 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.62342  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1036  ROK family protein  31.64 
 
 		 302 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.411017  normal  0.461151 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2482  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.77 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000362615  normal  0.0910717 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.77 
 
 		 303 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000151672  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1651  ROK family protein  32.23 
 
 		 310 aa  130  4.0000000000000003e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.856165  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2698  N-acetylglucosamine kinase  33 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2528  ROK familiy protein  30.43 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000343311  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2007  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.43 
 
 		 303 aa  129  6e-29  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.988883  normal  0.0770572 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1241  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.43 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00378319  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1499  N-acetyl-D-glucosamine kinase  30.43 
 
 		 303 aa  129  8.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000306944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1197  putative ROK-family protein  31.39 
 
 		 335 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.517642 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1253  fructokinase  32.38 
 
 		 302 aa  126  5e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000200604  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2873  ROK family protein  32.15 
 
 		 298 aa  126  5e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1702  ROK family protein  28.01 
 
 		 299 aa  126  5e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0394956 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0150  ROK family protein  36.4 
 
 		 312 aa  125  7e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.403108 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1275  N-acetylglucosamine kinase  37.25 
 
 		 302 aa  124  2e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0634216  normal  0.0141029 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0864  fructokinase  29.82 
 
 		 301 aa  124  2e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150416  normal  0.617243 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3109  ROK family protein  30.27 
 
 		 303 aa  123  4e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3305  fructokinase  33.08 
 
 		 303 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2559  ROK family protein  33.33 
 
 		 307 aa  123  5e-27  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2474  ROK family protein  32.89 
 
 		 304 aa  122  8e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.480455  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0462  fructokinase  29.2 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0421  fructokinase  29.2 
 
 		 302 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00343  fructokinase  29.2 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00347  hypothetical protein  29.2 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3214  ROK familiy protein  29.2 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0424  fructokinase  29.2 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0469  fructokinase  29.2 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0431  fructokinase  30.18 
 
 		 302 aa  120  3e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1332  ROK family protein  33 
 
 		 299 aa  120  3e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0436  fructokinase  29.82 
 
 		 302 aa  119  3.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3238  fructokinase  30.74 
 
 		 331 aa  119  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.67247  normal  0.0186988 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0449  fructokinase  29.82 
 
 		 302 aa  119  4.9999999999999996e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1005  fructokinase  33.47 
 
 		 303 aa  119  4.9999999999999996e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.805165  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2738  N-acetylglucosamine kinase  33.65 
 
 		 304 aa  119  7e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0430  fructokinase  29.45 
 
 		 302 aa  119  7.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0618  ROK family protein  37.5 
 
 		 301 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0109316 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0491  fructokinase  29.45 
 
 		 302 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2630  N-acetylglucosamine kinase  37 
 
 		 310 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2231  fructokinase  32.44 
 
 		 299 aa  117  3e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.875192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2576  ROK family protein  34.36 
 
 		 307 aa  116  3.9999999999999997e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0661  ROK family protein  41.85 
 
 		 282 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.440897  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2782  ROK family protein  33.11 
 
 		 303 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0831324  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1441  fructokinase  31.93 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0134154  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1321  fructokinase  31.35 
 
 		 301 aa  114  3e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1134  fructokinase  32.44 
 
 		 298 aa  113  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0172277  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1186  fructokinase  32.44 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3171  fructokinase  32.44 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.4973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1219  fructokinase  32.44 
 
 		 298 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.176774  normal  0.599707 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2811  ROK family protein  37.17 
 
 		 299 aa  113  5e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.47906  normal  0.45478 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2600  ROK family protein  31.91 
 
 		 305 aa  113  5e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.220312  normal  0.341718 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0313  ROK family protein  30.43 
 
 		 261 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5716  ROK family protein  32.03 
 
 		 299 aa  111  2.0000000000000002e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.838692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2130  ROK family protein  31.67 
 
 		 307 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0366564  normal  0.310263 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1150  fructokinase  31.77 
 
 		 300 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.310813 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1320  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.44 
 
 		 303 aa  109  4.0000000000000004e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0713108  hitchhiker  0.00524449 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2323  ROK family protein  31.56 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.437029 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0091  ROK family protein  30.69 
 
 		 307 aa  108  8.000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.097356  normal  0.137586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2918  ROK family protein  31.52 
 
 		 306 aa  108  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.137068  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1964  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.44 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.607164  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1297  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.44 
 
 		 303 aa  108  1e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.27565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2805  N-acetylglucosamine kinase  33.77 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.14071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2148  N-acetyl-D-glucosamine kinase  31.44 
 
 		 303 aa  107  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.964696  hitchhiker  0.000723972 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2333  ROK family protein  34.85 
 
 		 298 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.391774 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2937  fructokinase  31.65 
 
 		 296 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.252164  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4078  ROK family protein  33.83 
 
 		 301 aa  106  4e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>