More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5522 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  100 
 
 		 435 aa  892    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  54.44 
 
 		 435 aa  500  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  50.69 
 
 		 434 aa  451  1.0000000000000001e-126  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  49.77 
 
 		 439 aa  433  1e-120  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  48.51 
 
 		 453 aa  422  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  48.16 
 
 		 439 aa  416  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  47.7 
 
 		 435 aa  414  1e-114  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  48.73 
 
 		 429 aa  407  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  46.51 
 
 		 438 aa  404  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  46.65 
 
 		 437 aa  401  9.999999999999999e-111  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  44.55 
 
 		 438 aa  391  1e-107  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  43.98 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  44.37 
 
 		 438 aa  380  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  44.19 
 
 		 439 aa  375  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  45.52 
 
 		 432 aa  333  3e-90  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  332  7.000000000000001e-90  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  40.59 
 
 		 447 aa  332  7.000000000000001e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  43.09 
 
 		 425 aa  330  2e-89  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  41.87 
 
 		 448 aa  327  3e-88  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  41.4 
 
 		 427 aa  326  6e-88  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  43.68 
 
 		 428 aa  325  1e-87  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  41.34 
 
 		 427 aa  323  4e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  40.14 
 
 		 434 aa  320  3.9999999999999996e-86  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  320  3.9999999999999996e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  319  5e-86  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  43.02 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  43.26 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  43.26 
 
 		 428 aa  318  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  42.89 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  43.02 
 
 		 428 aa  317  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  41.47 
 
 		 428 aa  317  4e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  41.26 
 
 		 427 aa  316  4e-85  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  42.66 
 
 		 426 aa  316  7e-85  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  42.66 
 
 		 429 aa  315  8e-85  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  41.63 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  41.86 
 
 		 427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  41.8 
 
 		 434 aa  314  2.9999999999999996e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  41.26 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  41.51 
 
 		 426 aa  311  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  41.91 
 
 		 425 aa  311  2e-83  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  40.84 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  40.09 
 
 		 428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  39.59 
 
 		 426 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  40.5 
 
 		 427 aa  305  9.000000000000001e-82  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  40.37 
 
 		 426 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  39.17 
 
 		 429 aa  302  8.000000000000001e-81  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  40 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  41.28 
 
 		 429 aa  301  1e-80  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  39.82 
 
 		 427 aa  301  1e-80  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  39.82 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  40 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  39.82 
 
 		 427 aa  301  2e-80  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  39.82 
 
 		 433 aa  300  3e-80  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  40 
 
 		 427 aa  300  3e-80  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  39.23 
 
 		 426 aa  300  4e-80  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  40.23 
 
 		 427 aa  300  5e-80  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  39.77 
 
 		 427 aa  299  6e-80  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  39.59 
 
 		 436 aa  298  2e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  39.36 
 
 		 427 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  38.9 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  39.82 
 
 		 429 aa  296  6e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  40.27 
 
 		 428 aa  295  1e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  39.13 
 
 		 433 aa  292  1e-77  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1096  threonine synthase  37.5 
 
 		 432 aa  270  4e-71  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  33.12 
 
 		 463 aa  243  7e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  33.12 
 
 		 463 aa  243  7e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  33.91 
 
 		 470 aa  241  1e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  33.18 
 
 		 473 aa  241  2e-62  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  33.48 
 
 		 468 aa  241  2e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  32.9 
 
 		 460 aa  238  2e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  32.4 
 
 		 461 aa  236  4e-61  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  32.47 
 
 		 462 aa  235  1.0000000000000001e-60  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  33.48 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  31.82 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  33.63 
 
 		 471 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  31.7 
 
 		 467 aa  233  4.0000000000000004e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  35.53 
 
 		 461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  31.19 
 
 		 470 aa  233  4.0000000000000004e-60  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  32.47 
 
 		 462 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1383  threonine synthase  34.11 
 
 		 422 aa  232  8.000000000000001e-60  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  32.89 
 
 		 469 aa  231  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1613  threonine synthase  33.64 
 
 		 424 aa  231  2e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  33.41 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  31.94 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  32.59 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  32.33 
 
 		 465 aa  230  3e-59  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  33.04 
 
 		 463 aa  229  8e-59  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  32.44 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  32.22 
 
 		 469 aa  228  2e-58  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2268  threonine synthase  33.71 
 
 		 497 aa  228  2e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  32.22 
 
 		 469 aa  227  3e-58  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  32.75 
 
 		 465 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>