More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3578 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  75.59 
 
 		 427 aa  692    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  100 
 
 		 427 aa  882    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  61.85 
 
 		 426 aa  560  1e-158  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  61.88 
 
 		 426 aa  559  1e-158  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  61.74 
 
 		 425 aa  554  1e-157  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  60.89 
 
 		 428 aa  554  1e-157  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  61.7 
 
 		 427 aa  555  1e-157  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  61.14 
 
 		 426 aa  557  1e-157  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  62.21 
 
 		 426 aa  552  1e-156  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  61.83 
 
 		 429 aa  552  1e-156  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  61.36 
 
 		 429 aa  545  1e-154  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  61.74 
 
 		 426 aa  548  1e-154  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  61.79 
 
 		 425 aa  545  1e-154  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  62.3 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  61.12 
 
 		 429 aa  542  1e-153  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  61.27 
 
 		 426 aa  543  1e-153  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  59.95 
 
 		 429 aa  537  1e-151  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  59.62 
 
 		 427 aa  536  1e-151  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  60.09 
 
 		 428 aa  532  1e-150  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  61.85 
 
 		 428 aa  528  1e-149  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  61.85 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  61.85 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  60.33 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  58.76 
 
 		 434 aa  530  1e-149  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  61.85 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  60.33 
 
 		 427 aa  528  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  61.85 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  61.85 
 
 		 428 aa  530  1e-149  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  61.85 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  60.89 
 
 		 429 aa  529  1e-149  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  61.85 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  58.31 
 
 		 426 aa  528  1e-149  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  61.85 
 
 		 428 aa  529  1e-149  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  60.42 
 
 		 429 aa  526  1e-148  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  59.95 
 
 		 427 aa  527  1e-148  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  60.56 
 
 		 427 aa  526  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  59.86 
 
 		 427 aa  525  1e-148  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  60.56 
 
 		 428 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  60.56 
 
 		 428 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  60.56 
 
 		 428 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  58.55 
 
 		 429 aa  521  1e-147  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  59.86 
 
 		 427 aa  524  1e-147  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  59.86 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  60.56 
 
 		 428 aa  521  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  59.62 
 
 		 427 aa  520  1e-146  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  60.33 
 
 		 428 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  59.62 
 
 		 427 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  59.86 
 
 		 428 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  44.29 
 
 		 434 aa  362  6e-99  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  45.05 
 
 		 435 aa  362  9e-99  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  44.55 
 
 		 429 aa  355  5.999999999999999e-97  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  44.24 
 
 		 453 aa  346  6e-94  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  43.12 
 
 		 435 aa  345  8.999999999999999e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  43.53 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  42.56 
 
 		 439 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  42.52 
 
 		 439 aa  335  1e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  41.82 
 
 		 438 aa  333  2e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  41.61 
 
 		 438 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  41.51 
 
 		 439 aa  327  3e-88  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  41.92 
 
 		 437 aa  327  3e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  41.4 
 
 		 435 aa  326  6e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  41.69 
 
 		 438 aa  321  9.999999999999999e-87  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  39.36 
 
 		 448 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  39.19 
 
 		 447 aa  303  5.000000000000001e-81  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  40.81 
 
 		 428 aa  285  8e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  36.83 
 
 		 436 aa  280  4e-74  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  41.48 
 
 		 432 aa  278  1e-73  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  35.08 
 
 		 465 aa  273  5.000000000000001e-72  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  34.14 
 
 		 461 aa  271  2e-71  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  36.32 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  36.32 
 
 		 463 aa  268  2e-70  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  34.64 
 
 		 468 aa  262  8.999999999999999e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  36.27 
 
 		 470 aa  261  2e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  35.87 
 
 		 471 aa  260  4e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  35.9 
 
 		 428 aa  259  5.0000000000000005e-68  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  34.29 
 
 		 462 aa  259  6e-68  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  33.55 
 
 		 463 aa  259  7e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  33.7 
 
 		 469 aa  258  2e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  33.7 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  33.92 
 
 		 467 aa  256  6e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  34.29 
 
 		 470 aa  256  6e-67  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  34.47 
 
 		 474 aa  256  8e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  33.26 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  33.04 
 
 		 461 aa  254  2.0000000000000002e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  34.79 
 
 		 465 aa  254  2.0000000000000002e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  33.92 
 
 		 469 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  32.95 
 
 		 465 aa  253  4.0000000000000004e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  34.07 
 
 		 469 aa  253  6e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  34.01 
 
 		 471 aa  252  9.000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  34.56 
 
 		 470 aa  251  1e-65  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  34.07 
 
 		 469 aa  251  1e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  33.7 
 
 		 469 aa  251  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  37.1 
 
 		 434 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  34.56 
 
 		 470 aa  251  2e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  35.17 
 
 		 460 aa  250  3e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  33.69 
 
 		 465 aa  251  3e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  33.92 
 
 		 469 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  33.7 
 
 		 469 aa  249  5e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  33.48 
 
 		 469 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  33.7 
 
 		 461 aa  248  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>