283 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1413 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  100 
 
 		 466 aa  936    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0921  threonine synthase  71.15 
 
 		 473 aa  640    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.400205  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  71.92 
 
 		 465 aa  680    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  59.96 
 
 		 467 aa  551  1e-156  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  57.45 
 
 		 469 aa  539  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  57.24 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  56.37 
 
 		 469 aa  528  1e-148  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  56.52 
 
 		 469 aa  526  1e-148  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  56.37 
 
 		 469 aa  521  1e-147  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  59.22 
 
 		 462 aa  524  1e-147  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  56.16 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  55.94 
 
 		 469 aa  519  1e-146  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  55.51 
 
 		 469 aa  515  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  56.74 
 
 		 469 aa  514  1e-144  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  54.43 
 
 		 469 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  55.08 
 
 		 469 aa  511  1e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  57.76 
 
 		 461 aa  508  1e-143  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  53.96 
 
 		 466 aa  509  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  54.76 
 
 		 465 aa  506  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  57.08 
 
 		 461 aa  504  1e-141  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0308  threonine synthase  55.68 
 
 		 465 aa  501  1e-140  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00604196 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  56.65 
 
 		 461 aa  501  1e-140  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  52.92 
 
 		 471 aa  495  1e-139  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  54.73 
 
 		 462 aa  492  9.999999999999999e-139  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  53.49 
 
 		 463 aa  488  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  53.15 
 
 		 463 aa  490  1e-137  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  54.9 
 
 		 470 aa  491  1e-137  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  52.16 
 
 		 474 aa  491  1e-137  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  53.28 
 
 		 463 aa  485  1e-136  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  53.49 
 
 		 468 aa  483  1e-135  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  53.78 
 
 		 471 aa  482  1e-135  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  55.04 
 
 		 472 aa  478  1e-134  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  55.14 
 
 		 471 aa  479  1e-134  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  52.71 
 
 		 465 aa  479  1e-134  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3764  threonine synthase  51.62 
 
 		 461 aa  476  1e-133  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.106362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4578  threonine synthase  54.75 
 
 		 472 aa  475  1e-133  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  53.45 
 
 		 470 aa  476  1e-133  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  53.98 
 
 		 470 aa  476  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  53.56 
 
 		 471 aa  478  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  53.23 
 
 		 470 aa  473  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  53.68 
 
 		 473 aa  471  1e-132  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  53.17 
 
 		 472 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4795  threonine synthase  52.74 
 
 		 476 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.420552  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0907  threonine synthase  53.95 
 
 		 472 aa  470  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  53.04 
 
 		 465 aa  469  1.0000000000000001e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  53.52 
 
 		 470 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  54.49 
 
 		 472 aa  467  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  50.43 
 
 		 465 aa  465  9.999999999999999e-131  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  52.99 
 
 		 470 aa  462  1e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  48.05 
 
 		 460 aa  464  1e-129  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  50.43 
 
 		 463 aa  459  9.999999999999999e-129  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  51.37 
 
 		 471 aa  458  9.999999999999999e-129  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  50.76 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1787  threonine synthase  54.14 
 
 		 467 aa  438  1e-121  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  46.34 
 
 		 463 aa  419  1e-116  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  50.11 
 
 		 435 aa  418  1e-116  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0459  threonine synthase  49.68 
 
 		 459 aa  421  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  46.44 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  50.43 
 
 		 461 aa  415  9.999999999999999e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  48.05 
 
 		 460 aa  416  9.999999999999999e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  47.3 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  46.32 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2985  threonine synthase  46 
 
 		 458 aa  390  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.17832e-26 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1298  threonine synthase  46 
 
 		 458 aa  389  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000609388  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49056  predicted protein  45.61 
 
 		 504 aa  374  1e-102  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3635  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2230  threonine synthase  44.91 
 
 		 475 aa  361  2e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0456531  hitchhiker  0.000150597 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2191  threonine synthase  43.63 
 
 		 476 aa  360  3e-98  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.10374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2382  threonine synthase  42.8 
 
 		 475 aa  358  9.999999999999999e-98  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3205  threonine synthase  43.13 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.87945  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2558  threonine synthase  43.13 
 
 		 476 aa  357  2.9999999999999997e-97  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1542  threonine synthase  43.51 
 
 		 470 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1832  threonine synthase  43.49 
 
 		 471 aa  353  4e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1239  threonine synthase  42.92 
 
 		 481 aa  352  8e-96  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00928598 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5218  threonine synthase  43.07 
 
 		 475 aa  352  1e-95  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.160302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_65754  threonine synthase  40.41 
 
 		 511 aa  349  6e-95  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.148721 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1550  threonine synthase  41.77 
 
 		 477 aa  348  9e-95  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  41.56 
 
 		 473 aa  347  3e-94  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  41.56 
 
 		 473 aa  347  3e-94  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0905  threonine synthase  42.2 
 
 		 475 aa  346  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1049  threonine synthase  42.2 
 
 		 475 aa  346  4e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0844  threonine synthase  41.86 
 
 		 480 aa  346  5e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2024  threonine synthase  42.35 
 
 		 472 aa  345  1e-93  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2379  threonine synthase  41.78 
 
 		 476 aa  344  2e-93  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.499285 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2664  threonine synthase  42.54 
 
 		 516 aa  343  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2573  threonine synthase  42.45 
 
 		 487 aa  341  1e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.866855  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1913  threonine synthase  40.46 
 
 		 475 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.142116  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03031  threonine synthase (Eurofung)  40.16 
 
 		 517 aa  337  2.9999999999999997e-91  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0991235 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3518  threonine synthase  43.07 
 
 		 453 aa  336  5.999999999999999e-91  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.116965  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1420  threonine synthase  42.03 
 
 		 483 aa  332  9e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.226673  normal  0.0367452 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2199  threonine synthase  41.77 
 
 		 483 aa  330  3e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000410505  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1264  threonine synthase  40.73 
 
 		 481 aa  329  5.0000000000000004e-89  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.974615 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1807  threonine synthase  40.53 
 
 		 483 aa  329  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0266942  hitchhiker  0.00766231 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2380  threonine synthase  40.58 
 
 		 483 aa  329  8e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.254027  normal  0.782631 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1328  threonine synthase  41.39 
 
 		 481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.377271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1965  threonine synthase  40.62 
 
 		 481 aa  327  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000623225  normal  0.345947 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2231  threonine synthase  41.41 
 
 		 483 aa  327  3e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1763  threonine synthase  41.49 
 
 		 483 aa  327  3e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.158411 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5154  threonine synthase  41.41 
 
 		 483 aa  326  6e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.752909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2269  threonine synthase  41.2 
 
 		 483 aa  326  7e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.080234  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1877  threonine synthase  41.49 
 
 		 483 aa  325  7e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.102088  hitchhiker  0.0000174271 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>