More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3802 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  100 
 
 
439 aa  908    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  55.86 
 
 
435 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  53.56 
 
 
434 aa  481  1e-134  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  54.04 
 
 
429 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  49.77 
 
 
435 aa  433  1e-120  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  51.72 
 
 
453 aa  430  1e-119  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  47.58 
 
 
438 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  46.67 
 
 
438 aa  408  1e-113  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  48.5 
 
 
438 aa  408  1e-113  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  47.58 
 
 
437 aa  405  1.0000000000000001e-112  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  45.96 
 
 
439 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  47.48 
 
 
438 aa  404  1e-111  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  47.47 
 
 
435 aa  400  9.999999999999999e-111  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  46.1 
 
 
439 aa  397  1e-109  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  43.65 
 
 
426 aa  360  4e-98  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  43.52 
 
 
426 aa  359  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  43.42 
 
 
429 aa  355  6.999999999999999e-97  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  43.06 
 
 
426 aa  354  2e-96  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  44.01 
 
 
428 aa  354  2e-96  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  44.39 
 
 
432 aa  351  1e-95  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  42.73 
 
 
429 aa  349  5e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  43.29 
 
 
427 aa  349  5e-95  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  43.98 
 
 
427 aa  347  2e-94  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  43.98 
 
 
427 aa  346  4e-94  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  42.96 
 
 
425 aa  345  8e-94  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  43.98 
 
 
427 aa  345  8e-94  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  42.73 
 
 
429 aa  344  2e-93  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  43.75 
 
 
427 aa  344  2e-93  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  42.73 
 
 
426 aa  343  2e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  42.73 
 
 
429 aa  343  2.9999999999999997e-93  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  44.29 
 
 
428 aa  343  4e-93  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  44.14 
 
 
425 aa  342  5e-93  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  42.49 
 
 
429 aa  342  5.999999999999999e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  40.9 
 
 
448 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  43.65 
 
 
428 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  43.52 
 
 
427 aa  340  2e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  43.65 
 
 
428 aa  341  2e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  43.65 
 
 
428 aa  341  2e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  43.88 
 
 
428 aa  340  2e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  43.65 
 
 
428 aa  341  2e-92  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  43.65 
 
 
428 aa  341  2e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  43.65 
 
 
428 aa  341  2e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  43.65 
 
 
428 aa  341  2e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  43.65 
 
 
428 aa  340  2.9999999999999998e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  42.66 
 
 
434 aa  337  1.9999999999999998e-91  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  42.56 
 
 
427 aa  338  1.9999999999999998e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  43.78 
 
 
428 aa  336  3.9999999999999995e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  42.3 
 
 
427 aa  335  7.999999999999999e-91  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  43.55 
 
 
428 aa  335  9e-91  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  43.06 
 
 
427 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  43.55 
 
 
428 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  43.55 
 
 
428 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  43.06 
 
 
427 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  43.55 
 
 
428 aa  335  1e-90  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  43.29 
 
 
426 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  43.06 
 
 
427 aa  335  1e-90  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  42.82 
 
 
427 aa  334  2e-90  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  40.67 
 
 
447 aa  334  2e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  42.82 
 
 
427 aa  333  3e-90  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  42.59 
 
 
428 aa  333  4e-90  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  42.36 
 
 
426 aa  330  2e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  41.74 
 
 
427 aa  328  1.0000000000000001e-88  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  42.03 
 
 
436 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  42.86 
 
 
429 aa  326  5e-88  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  42.99 
 
 
428 aa  325  9e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  42.17 
 
 
429 aa  325  1e-87  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  42.66 
 
 
426 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  35.78 
 
 
468 aa  276  7e-73  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  35.56 
 
 
463 aa  276  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  35.56 
 
 
463 aa  275  1.0000000000000001e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  37.56 
 
 
428 aa  273  3e-72  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1096  threonine synthase  38.81 
 
 
432 aa  273  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  41.69 
 
 
433 aa  266  4e-70  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  34.26 
 
 
466 aa  265  8.999999999999999e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  37.47 
 
 
434 aa  265  2e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  33.9 
 
 
469 aa  263  4.999999999999999e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  34.42 
 
 
465 aa  263  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  40.82 
 
 
433 aa  261  3e-68  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  34.12 
 
 
465 aa  259  6e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  34.77 
 
 
463 aa  258  1e-67  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  36.73 
 
 
473 aa  257  2e-67  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  34.98 
 
 
460 aa  256  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  34.38 
 
 
461 aa  256  6e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  34.3 
 
 
470 aa  255  9e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  34.24 
 
 
465 aa  255  9e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  32.47 
 
 
465 aa  254  3e-66  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  35.06 
 
 
460 aa  254  3e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  35.39 
 
 
474 aa  254  3e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0262  threonine synthase  33.7 
 
 
472 aa  253  5.000000000000001e-66  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  32.91 
 
 
469 aa  253  6e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  33.33 
 
 
469 aa  253  7e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  34.56 
 
 
461 aa  252  7e-66  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  37.3 
 
 
500 aa  252  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  35.06 
 
 
461 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  34.84 
 
 
471 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  34.77 
 
 
460 aa  252  1e-65  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  33.26 
 
 
470 aa  250  3e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1383  threonine synthase  35.89 
 
 
422 aa  251  3e-65  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  35.65 
 
 
467 aa  250  3e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  32.48 
 
 
469 aa  249  6e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>