More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal195_1306 on replicon NC_009997
Organism: Shewanella baltica OS195



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  88.06 
 
 
427 aa  779    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  74.65 
 
 
426 aa  668    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  98.59 
 
 
427 aa  865    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  72.07 
 
 
428 aa  636    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  94.85 
 
 
427 aa  835    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  100 
 
 
427 aa  875    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  98.83 
 
 
427 aa  865    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  88.76 
 
 
427 aa  786    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  88.52 
 
 
427 aa  785    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  77.7 
 
 
427 aa  692    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  76.53 
 
 
426 aa  679    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  76.53 
 
 
427 aa  673    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  88.52 
 
 
427 aa  789    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  74.41 
 
 
428 aa  641    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  98.59 
 
 
427 aa  865    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  71.83 
 
 
426 aa  632  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  62.74 
 
 
425 aa  541  9.999999999999999e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  60.56 
 
 
427 aa  526  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  61.03 
 
 
427 aa  518  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  59.53 
 
 
426 aa  515  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  59.53 
 
 
426 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  59.15 
 
 
427 aa  514  1e-144  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  59.29 
 
 
426 aa  513  1e-144  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  60.42 
 
 
429 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  59.58 
 
 
434 aa  508  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  60.85 
 
 
426 aa  508  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  61.28 
 
 
428 aa  509  1e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  60.19 
 
 
429 aa  505  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  60.42 
 
 
429 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  59.95 
 
 
429 aa  503  1e-141  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  60.57 
 
 
428 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  60.81 
 
 
428 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  60.57 
 
 
428 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  60.57 
 
 
428 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  58.78 
 
 
429 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  60.33 
 
 
428 aa  491  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  60.57 
 
 
428 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  56.71 
 
 
425 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  60.57 
 
 
428 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  60.57 
 
 
428 aa  491  1e-137  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  60.57 
 
 
428 aa  490  1e-137  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  60.57 
 
 
428 aa  491  1e-137  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  60.57 
 
 
428 aa  490  1e-137  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  60.57 
 
 
428 aa  490  1e-137  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  60.57 
 
 
428 aa  490  1e-137  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  60.57 
 
 
428 aa  490  1e-137  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  58.31 
 
 
429 aa  484  1e-136  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  58.78 
 
 
429 aa  484  1e-135  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  43.39 
 
 
429 aa  349  5e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  44.04 
 
 
434 aa  344  1e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  42.82 
 
 
439 aa  333  3e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  42.33 
 
 
438 aa  333  3e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  41.65 
 
 
453 aa  332  5e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  42.83 
 
 
435 aa  330  4e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  40.18 
 
 
438 aa  325  1e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  41.01 
 
 
438 aa  321  1.9999999999999998e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  41.11 
 
 
439 aa  318  7.999999999999999e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  40.89 
 
 
437 aa  316  4e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  40.05 
 
 
439 aa  316  5e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  42.33 
 
 
438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  40.88 
 
 
435 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  38.9 
 
 
435 aa  296  4e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  38.96 
 
 
448 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  42.69 
 
 
432 aa  286  4e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  41.25 
 
 
436 aa  286  4e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  42.02 
 
 
428 aa  280  4e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  35.81 
 
 
447 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  35.68 
 
 
461 aa  258  1e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  34.8 
 
 
461 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  34.8 
 
 
461 aa  250  4e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  34.35 
 
 
465 aa  250  4e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  35.19 
 
 
470 aa  245  9.999999999999999e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  34.48 
 
 
470 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  33.84 
 
 
463 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  34.97 
 
 
470 aa  243  5e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  34.13 
 
 
467 aa  243  6e-63  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  36.28 
 
 
428 aa  241  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  32.83 
 
 
462 aa  239  6.999999999999999e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  32.61 
 
 
465 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  31.73 
 
 
460 aa  238  1e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  35.41 
 
 
470 aa  238  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  32.68 
 
 
461 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  35.41 
 
 
471 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  34.59 
 
 
461 aa  236  7e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  33.77 
 
 
470 aa  236  8e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  32.82 
 
 
463 aa  236  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  34.79 
 
 
463 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  34.79 
 
 
463 aa  234  3e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  35.04 
 
 
470 aa  233  6e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  32.75 
 
 
471 aa  232  9e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  34.5 
 
 
466 aa  231  1e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  33.41 
 
 
474 aa  231  1e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  33.55 
 
 
473 aa  231  2e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  34.56 
 
 
472 aa  229  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  34.26 
 
 
471 aa  228  2e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  34.71 
 
 
465 aa  228  2e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  33.26 
 
 
471 aa  227  3e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  34.76 
 
 
468 aa  227  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0839  threonine synthase  35.19 
 
 
471 aa  227  3e-58  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  35.18 
 
 
472 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.214669 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>