More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1987 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  72.08 
 
 
437 aa  651    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  100 
 
 
438 aa  909    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  71 
 
 
439 aa  634    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  72.6 
 
 
438 aa  646    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  70.32 
 
 
438 aa  650    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  70.25 
 
 
438 aa  634  1e-180  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  67.51 
 
 
439 aa  616  1e-175  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  49.08 
 
 
435 aa  428  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  45.73 
 
 
434 aa  419  1e-116  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  46.67 
 
 
439 aa  408  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  45.16 
 
 
429 aa  390  1e-107  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  45.62 
 
 
435 aa  388  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  43.98 
 
 
435 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  43.51 
 
 
453 aa  373  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  47.82 
 
 
428 aa  349  6e-95  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  47.47 
 
 
436 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  40.53 
 
 
448 aa  345  1e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  39.46 
 
 
447 aa  343  4e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  46.7 
 
 
432 aa  339  5e-92  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  42.2 
 
 
429 aa  334  1e-90  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  42.2 
 
 
429 aa  334  2e-90  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  42.26 
 
 
426 aa  333  3e-90  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  41.14 
 
 
434 aa  333  4e-90  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  41.11 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  42.93 
 
 
428 aa  326  4.0000000000000003e-88  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  42.68 
 
 
429 aa  325  8.000000000000001e-88  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  41.28 
 
 
429 aa  322  9.999999999999999e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  41.69 
 
 
427 aa  321  9.999999999999999e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  42.79 
 
 
427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  42.63 
 
 
427 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  41.08 
 
 
428 aa  320  3e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  40.88 
 
 
427 aa  319  6e-86  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  42.56 
 
 
427 aa  317  2e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  42.17 
 
 
427 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  42.17 
 
 
427 aa  317  3e-85  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  41.27 
 
 
426 aa  317  4e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  39.72 
 
 
426 aa  316  5e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  42.56 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  42.56 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  42.56 
 
 
427 aa  315  9.999999999999999e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  41.3 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  39.95 
 
 
426 aa  314  1.9999999999999998e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  42.33 
 
 
427 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  40.88 
 
 
429 aa  312  5.999999999999999e-84  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  40.83 
 
 
425 aa  312  6.999999999999999e-84  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  39.95 
 
 
426 aa  311  1e-83  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  42.82 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  38.36 
 
 
468 aa  308  1.0000000000000001e-82  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  42.82 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  42.82 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  42.82 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  42.82 
 
 
428 aa  308  1.0000000000000001e-82  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  42.2 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  42.2 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  42.2 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  41.28 
 
 
429 aa  307  2.0000000000000002e-82  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  42.2 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  42.2 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  42.2 
 
 
428 aa  307  2.0000000000000002e-82  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  42.2 
 
 
428 aa  307  3e-82  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  42.2 
 
 
428 aa  306  4.0000000000000004e-82  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  42.2 
 
 
428 aa  306  5.0000000000000004e-82  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  37.88 
 
 
474 aa  303  6.000000000000001e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  37.85 
 
 
463 aa  302  9e-81  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  41.06 
 
 
429 aa  301  1e-80  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  37.85 
 
 
463 aa  301  1e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  39.45 
 
 
427 aa  301  1e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  39.63 
 
 
427 aa  300  3e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  36.64 
 
 
471 aa  297  3e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  36.91 
 
 
465 aa  296  6e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  39.44 
 
 
426 aa  292  1e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  39.67 
 
 
425 aa  292  1e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  42.07 
 
 
434 aa  290  3e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  42.17 
 
 
428 aa  289  5.0000000000000004e-77  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  40.05 
 
 
428 aa  289  6e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  37.63 
 
 
465 aa  289  9e-77  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  36.34 
 
 
469 aa  286  5e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  35.85 
 
 
461 aa  286  5e-76  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  36.34 
 
 
469 aa  285  8e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4148  threonine synthase  36.13 
 
 
469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.707815  normal  0.707599 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4250  threonine synthase  36.13 
 
 
469 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.941259  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  38.69 
 
 
460 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  35.05 
 
 
466 aa  285  1.0000000000000001e-75  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1481  threonine synthase  35.19 
 
 
469 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.77093  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  40.14 
 
 
433 aa  282  6.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  40.51 
 
 
433 aa  282  7.000000000000001e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  35.41 
 
 
469 aa  282  7.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  38.24 
 
 
460 aa  282  8.000000000000001e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1096  threonine synthase  38.7 
 
 
432 aa  282  1e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  36.93 
 
 
461 aa  282  1e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0859  threonine synthase  36.5 
 
 
460 aa  281  2e-74  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00125642  hitchhiker  0.0000000245714 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  36.4 
 
 
471 aa  281  2e-74  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1210  threonine synthase  35.89 
 
 
465 aa  280  3e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  36.05 
 
 
469 aa  280  5e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  35.56 
 
 
463 aa  278  1e-73  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3009  threonine synthase  35.5 
 
 
462 aa  276  7e-73  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.923826  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1383  threonine synthase  36.11 
 
 
422 aa  276  8e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  36.67 
 
 
461 aa  274  2.0000000000000002e-72  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  37.12 
 
 
473 aa  275  2.0000000000000002e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  34.62 
 
 
469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>