More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sbal223_3084 on replicon NC_011663
Organism: Shewanella baltica OS223



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  77 
 
 		 426 aa  682    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  88.99 
 
 		 427 aa  785    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  96.01 
 
 		 427 aa  840    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  99.77 
 
 		 427 aa  872    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  74.88 
 
 		 426 aa  669    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  98.83 
 
 		 427 aa  865    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  72.37 
 
 		 426 aa  636    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  100 
 
 		 427 aa  874    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  89.93 
 
 		 427 aa  793    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  89.7 
 
 		 427 aa  793    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  78.4 
 
 		 427 aa  696    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  77.28 
 
 		 427 aa  677    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  89.7 
 
 		 427 aa  796    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  75.12 
 
 		 428 aa  645    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  99.77 
 
 		 427 aa  872    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  72.6 
 
 		 428 aa  641    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  62.5 
 
 		 425 aa  542  1e-153  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  59.95 
 
 		 427 aa  527  1e-148  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  60.56 
 
 		 427 aa  518  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  59.29 
 
 		 426 aa  514  1.0000000000000001e-145  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  59.76 
 
 		 426 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  59.62 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  60.66 
 
 		 429 aa  511  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  59.53 
 
 		 426 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  61.52 
 
 		 428 aa  511  1e-144  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  59.58 
 
 		 434 aa  510  1e-143  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  60.42 
 
 		 429 aa  508  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  61.08 
 
 		 426 aa  511  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  60.37 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  60.66 
 
 		 429 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  59.02 
 
 		 429 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  56.94 
 
 		 425 aa  496  1e-139  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  60.81 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  60.81 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  60.81 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  60.57 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  60.81 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  60.81 
 
 		 428 aa  494  9.999999999999999e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  60.57 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  60.81 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  60.57 
 
 		 428 aa  492  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  60.57 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  60.57 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  60.81 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  60.81 
 
 		 428 aa  493  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  59.48 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  58.55 
 
 		 429 aa  488  1e-137  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  60.33 
 
 		 428 aa  491  1e-137  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  43.85 
 
 		 429 aa  350  2e-95  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  44.14 
 
 		 434 aa  344  2e-93  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  43.06 
 
 		 439 aa  335  9e-91  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  42.33 
 
 		 438 aa  333  4e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  41.65 
 
 		 453 aa  332  6e-90  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  43.05 
 
 		 435 aa  331  1e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  40.65 
 
 		 438 aa  329  7e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  41.24 
 
 		 438 aa  320  3.9999999999999996e-86  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  40.88 
 
 		 439 aa  319  5e-86  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  41.12 
 
 		 437 aa  317  3e-85  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  40.05 
 
 		 439 aa  316  4e-85  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  42.56 
 
 		 438 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  40.65 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  39.82 
 
 		 435 aa  301  1e-80  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  42.92 
 
 		 432 aa  287  2e-76  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  39.19 
 
 		 448 aa  286  4e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  40.86 
 
 		 436 aa  283  4.0000000000000003e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  42.02 
 
 		 428 aa  279  5e-74  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  35.81 
 
 		 447 aa  270  4e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  35.9 
 
 		 461 aa  261  2e-68  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  34.8 
 
 		 461 aa  251  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  34.8 
 
 		 461 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  33.91 
 
 		 465 aa  247  3e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  35.19 
 
 		 470 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  34.7 
 
 		 470 aa  246  6.999999999999999e-64  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  33.84 
 
 		 463 aa  245  9e-64  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  34.97 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  35.03 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  36.74 
 
 		 428 aa  244  3e-63  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  33.91 
 
 		 467 aa  241  2e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  32.61 
 
 		 465 aa  239  8e-62  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  35.41 
 
 		 470 aa  239  1e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  33.99 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  35.79 
 
 		 471 aa  237  2e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  31.51 
 
 		 460 aa  237  2e-61  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  33.18 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  34.37 
 
 		 461 aa  236  4e-61  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  32.6 
 
 		 463 aa  235  9e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1588  threonine synthase  35.49 
 
 		 470 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.742925  normal  0.0416146 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  34.33 
 
 		 463 aa  233  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  34.33 
 
 		 463 aa  232  8.000000000000001e-60  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  33.77 
 
 		 473 aa  232  9e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1613  threonine synthase  35.16 
 
 		 424 aa  230  3e-59  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1413  threonine synthase  33.7 
 
 		 466 aa  230  4e-59  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.778378  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  33.18 
 
 		 471 aa  229  6e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  33.48 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0229  threonine synthase  34.56 
 
 		 472 aa  228  1e-58  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2341  threonine synthase  34.49 
 
 		 471 aa  228  1e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  33.79 
 
 		 474 aa  229  1e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1383  threonine synthase  34.9 
 
 		 422 aa  228  2e-58  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0822  threonine synthase  34.96 
 
 		 472 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.214669 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  34.2 
 
 		 465 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>