More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1941 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  87.09 
 
 		 426 aa  777    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  79.63 
 
 		 427 aa  716    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  100 
 
 		 426 aa  878    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  86.38 
 
 		 426 aa  768    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  71.16 
 
 		 425 aa  631  1e-180  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  69.41 
 
 		 425 aa  610  1e-173  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  68 
 
 		 429 aa  600  1e-170  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  68 
 
 		 429 aa  600  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  68 
 
 		 429 aa  598  1e-170  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  68 
 
 		 426 aa  598  1e-170  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  67.53 
 
 		 429 aa  590  1e-167  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  66.98 
 
 		 429 aa  587  1e-167  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  66.9 
 
 		 428 aa  583  1.0000000000000001e-165  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  68.15 
 
 		 429 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  68.15 
 
 		 429 aa  581  1.0000000000000001e-165  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  67.61 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  67.61 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  67.61 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  67.37 
 
 		 428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  67.61 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  67.61 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  67.37 
 
 		 428 aa  571  1.0000000000000001e-162  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  67.61 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  67.61 
 
 		 428 aa  573  1.0000000000000001e-162  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  67.37 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  67.37 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  67.37 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  67.37 
 
 		 428 aa  568  1e-161  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  67.14 
 
 		 428 aa  566  1e-160  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  61.88 
 
 		 427 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  61.97 
 
 		 427 aa  546  1e-154  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  59.34 
 
 		 426 aa  526  1e-148  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  59.76 
 
 		 427 aa  523  1e-147  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  60 
 
 		 427 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  59.76 
 
 		 427 aa  519  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  59.53 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  59.53 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  58.29 
 
 		 428 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  59.53 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  59.53 
 
 		 427 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  59.53 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  59.76 
 
 		 427 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  59.06 
 
 		 427 aa  514  1e-144  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  58.29 
 
 		 427 aa  508  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  58.06 
 
 		 434 aa  504  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  57.18 
 
 		 426 aa  504  1e-141  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  59.72 
 
 		 428 aa  504  1e-141  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  56.71 
 
 		 426 aa  500  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  47.94 
 
 		 434 aa  384  1e-105  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  43.65 
 
 		 439 aa  360  3e-98  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  43.32 
 
 		 435 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  43.55 
 
 		 429 aa  355  1e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  41.74 
 
 		 439 aa  341  1e-92  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  41.71 
 
 		 435 aa  337  2.9999999999999997e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  42.45 
 
 		 437 aa  333  5e-90  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  42.09 
 
 		 453 aa  331  1e-89  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  41.94 
 
 		 438 aa  331  1e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  39.91 
 
 		 438 aa  330  3e-89  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  40.55 
 
 		 438 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  39.86 
 
 		 439 aa  319  5e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  39.95 
 
 		 438 aa  314  1.9999999999999998e-84  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  41.26 
 
 		 435 aa  311  1e-83  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  37.25 
 
 		 448 aa  302  7.000000000000001e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  36.24 
 
 		 447 aa  278  1e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  37.88 
 
 		 436 aa  277  2e-73  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1751  threonine synthase  37.44 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.182156 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0760  threonine synthase  35.96 
 
 		 465 aa  271  2e-71  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  40.54 
 
 		 428 aa  263  4e-69  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  34.98 
 
 		 474 aa  260  3e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0635  threonine synthase  35.2 
 
 		 471 aa  259  5.0000000000000005e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.05572  normal  0.105186 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1356  threonine synthase  36.87 
 
 		 433 aa  258  1e-67  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  38.64 
 
 		 432 aa  257  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  33.92 
 
 		 461 aa  257  3e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0536  threonine synthase  35.63 
 
 		 465 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.376888  normal  0.520587 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  34.94 
 
 		 463 aa  253  3e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  34.94 
 
 		 463 aa  253  3e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1423  threonine synthase  36.34 
 
 		 433 aa  252  8.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  33.7 
 
 		 461 aa  251  1e-65  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  34.02 
 
 		 468 aa  250  3e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  33.48 
 
 		 461 aa  250  3e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3524  threonine synthase  33.12 
 
 		 470 aa  250  4e-65  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.970017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00822  threonine synthase  40.15 
 
 		 434 aa  247  4e-64  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00943473  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1096  threonine synthase  33.79 
 
 		 432 aa  244  1.9999999999999999e-63  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  33.18 
 
 		 462 aa  244  1.9999999999999999e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  34.09 
 
 		 470 aa  239  8e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  34.83 
 
 		 470 aa  238  2e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  35.17 
 
 		 465 aa  238  2e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  32.46 
 
 		 467 aa  237  4e-61  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1075  threonine synthase  35.38 
 
 		 435 aa  236  5.0000000000000005e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.515489  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  34.05 
 
 		 470 aa  236  6e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3149  threonine synthase  32.24 
 
 		 462 aa  236  8e-61  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.211768  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2280  threonine synthase  31.88 
 
 		 460 aa  236  8e-61  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.12968  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0268  threonine synthase  34.8 
 
 		 471 aa  235  9e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.964457  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  33.33 
 
 		 471 aa  235  1.0000000000000001e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1892  threonine synthase  33.03 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000135451  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  32.22 
 
 		 473 aa  234  3e-60  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1613  threonine synthase  34.73 
 
 		 424 aa  233  4.0000000000000004e-60  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1383  threonine synthase  35.16 
 
 		 422 aa  232  1e-59  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1502  threonine synthase  31.36 
 
 		 463 aa  231  2e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.06587e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2395  threonine synthase  31.66 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000411335  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>