More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_1587 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_1587  threonine synthase  100 
 
 		 448 aa  914    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.34277  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0457  L-threonine synthase  54.85 
 
 		 447 aa  531  1e-150  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0075  threonine synthase  43.57 
 
 		 434 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.293948 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2707  threonine synthase  41.43 
 
 		 438 aa  353  4e-96  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.207551  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2573  threonine synthase  41.83 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.965745  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2402  threonine synthase  42.02 
 
 		 432 aa  346  4e-94  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1987  threonine synthase  40.53 
 
 		 438 aa  345  1e-93  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3802  threonine synthase  40.9 
 
 		 439 aa  342  5.999999999999999e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3806  threonine synthase  40.18 
 
 		 435 aa  339  5e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0398302  normal  0.207163 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0138  threonine synthase  40.22 
 
 		 439 aa  339  5.9999999999999996e-92  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.135778  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1263  threonine synthase  44.22 
 
 		 436 aa  338  9.999999999999999e-92  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.904932  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1360  threonine synthase  42.53 
 
 		 428 aa  335  7e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.489161  normal  0.105086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5431  threonine synthase  40.45 
 
 		 435 aa  335  7e-91  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.418256  normal  0.890668 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2546  threonine synthase  40.18 
 
 		 438 aa  335  7e-91  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.229703  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2334  threonine synthase  39.96 
 
 		 437 aa  331  2e-89  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0260  threonine synthase  40 
 
 		 438 aa  329  5.0000000000000004e-89  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.0450617 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5522  threonine synthase  41.87 
 
 		 435 aa  327  3e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000125532  normal  0.439141 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0295  threonine synthase  40 
 
 		 439 aa  327  4.0000000000000003e-88  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.212464 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07410  threonine synthase  39.1 
 
 		 453 aa  324  2e-87  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2554  threonine synthase  38.8 
 
 		 427 aa  311  1e-83  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3578  threonine synthase  39.36 
 
 		 427 aa  308  1.0000000000000001e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4289  threonine synthase  37.61 
 
 		 434 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004455  threonine synthase  37.98 
 
 		 426 aa  307  2.0000000000000002e-82  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.892545  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3474  threonine synthase  39.51 
 
 		 429 aa  307  3e-82  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1212  threonine synthase  38.65 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.13484  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0685  threonine synthase  39.29 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0750067  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3602  threonine synthase  39.29 
 
 		 429 aa  305  1.0000000000000001e-81  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0574  threonine synthase  39.33 
 
 		 429 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1277  threonine synthase  37.86 
 
 		 425 aa  304  2.0000000000000002e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.507773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0806  threonine synthase  39.33 
 
 		 426 aa  303  3.0000000000000004e-81  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.196525 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00941  threonine synthase  37.75 
 
 		 426 aa  303  5.000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1941  threonine synthase  37.25 
 
 		 426 aa  302  8.000000000000001e-81  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0392149  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0566  threonine synthase  39.57 
 
 		 428 aa  302  9e-81  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03326  threonine synthase  38.5 
 
 		 427 aa  300  4e-80  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0535  threonine synthase  40.28 
 
 		 429 aa  298  1e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0620  threonine synthase  39.31 
 
 		 461 aa  298  2e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1831  threonine synthase  39.09 
 
 		 461 aa  297  2e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2904  threonine synthase  39.33 
 
 		 427 aa  297  3e-79  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.869101  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0480  threonine synthase  38.88 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.475299  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1141  threonine synthase  39.42 
 
 		 427 aa  296  5e-79  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.212689  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4315  threonine synthase  39.22 
 
 		 462 aa  296  5e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.236333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1177  threonine synthase  38.88 
 
 		 426 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.300194  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2733  threonine synthase  39.24 
 
 		 427 aa  294  3e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1140  threonine synthase  39.42 
 
 		 427 aa  293  3e-78  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1211  threonine synthase  39.42 
 
 		 427 aa  294  3e-78  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3413  threonine synthase  38.57 
 
 		 427 aa  291  1e-77  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0004  threonine synthase  40.28 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.70048  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0004  threonine synthase  40.28 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.153937  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0004  threonine synthase  40.28 
 
 		 428 aa  291  2e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0004  threonine synthase  40.28 
 
 		 428 aa  290  3e-77  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.412725  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0004  threonine synthase  40.05 
 
 		 428 aa  290  4e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.66148  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1306  threonine synthase  38.96 
 
 		 427 aa  289  5.0000000000000004e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0003  threonine synthase  40.05 
 
 		 428 aa  289  6e-77  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0004  threonine synthase  39.81 
 
 		 428 aa  289  7e-77  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00004  threonine synthase  40.05 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.863935  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3592  threonine synthase  40.05 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0003  threonine synthase  40.05 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3651  threonine synthase  40.05 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0005  threonine synthase  40.05 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.674616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0005  threonine synthase  40.05 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.817747  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00004  hypothetical protein  40.05 
 
 		 428 aa  289  8e-77  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.902262  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2330  threonine synthase  39.83 
 
 		 463 aa  288  1e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.351518  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1272  threonine synthase  39.33 
 
 		 426 aa  288  1e-76  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0268749 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3084  threonine synthase  39.19 
 
 		 427 aa  286  4e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.823168  hitchhiker  0.00247535 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2738  threonine synthase  38.26 
 
 		 426 aa  286  4e-76  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00144538  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0677  threonine synthase  37.42 
 
 		 467 aa  286  5.999999999999999e-76  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0874999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1273  threonine synthase  38.96 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.270121  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0568  threonine synthase  39.78 
 
 		 500 aa  285  1.0000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1229  threonine synthase  38.96 
 
 		 427 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.117065  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0722  threonine synthase  35.91 
 
 		 471 aa  285  2.0000000000000002e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.259471 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1081  threonine synthase  38.01 
 
 		 427 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.301795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3254  threonine synthase  37.45 
 
 		 470 aa  284  3.0000000000000004e-75  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0242603 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1068  threonine synthase  37.58 
 
 		 428 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3578  threonine synthase  37.45 
 
 		 470 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3861  threonine synthase  38.39 
 
 		 429 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4498  threonine synthase  36.7 
 
 		 465 aa  283  6.000000000000001e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.395589  normal  0.347683 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3666  threonine synthase  38.8 
 
 		 429 aa  282  7.000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1146  threonine synthase  38.09 
 
 		 463 aa  282  8.000000000000001e-75  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3450  threonine synthase  37.93 
 
 		 470 aa  282  8.000000000000001e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.182634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1398  threonine synthase  37.09 
 
 		 465 aa  280  3e-74  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16090  threonine synthase  36.7 
 
 		 469 aa  280  3e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1251  threonine synthase  37.88 
 
 		 473 aa  279  8e-74  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1384  threonine synthase  36.7 
 
 		 469 aa  279  9e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.0019152  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1028  threonine synthase  36.21 
 
 		 469 aa  277  2e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1631  threonine synthase  35.57 
 
 		 461 aa  278  2e-73  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000988233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3393  threonine synthase  38.17 
 
 		 469 aa  277  3e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.955662  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0484  threonine synthase  35.71 
 
 		 463 aa  276  8e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.632525  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0599  threonine synthase  36.58 
 
 		 468 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39480  threonine synthase  36.42 
 
 		 469 aa  274  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.104033  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0489  threonine synthase  35.71 
 
 		 463 aa  275  2.0000000000000002e-72  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.513608  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2273  threonine synthase  36.64 
 
 		 466 aa  275  2.0000000000000002e-72  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.593832  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1291  threonine synthase  35.34 
 
 		 469 aa  273  4.0000000000000004e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0226346  normal  0.85232 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2465  threonine synthase  36.81 
 
 		 473 aa  273  5.000000000000001e-72  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.191399 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1695  threonine synthase  35.36 
 
 		 461 aa  272  1e-71  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1471  threonine synthase  35.56 
 
 		 469 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.466033  normal  0.368442 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2137  threonine synthase  36.17 
 
 		 473 aa  271  1e-71  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0606467 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0907  threonine synthase  36.94 
 
 		 428 aa  271  1e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0692  threonine synthase  35.19 
 
 		 474 aa  271  2e-71  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1076  threonine synthase  35.48 
 
 		 469 aa  271  2e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.184051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3233  threonine synthase  35.65 
 
 		 470 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>